More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_03080 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0071  SSS sodium solute transporter superfamily  71.51 
 
 		 528 aa  675    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03080  SSS sodium solute transporter  100 
 
 		 528 aa  1036    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2139  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  68.35 
 
 		 543 aa  640    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.301041 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2862  Na+/solute symporter  71.05 
 
 		 537 aa  669    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3373  SSS sodium solute transporter superfamily  70.58 
 
 		 536 aa  693    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.346982  normal  0.514599 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1075  SSS sodium solute transporter superfamily  71.13 
 
 		 546 aa  653    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.099805  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3659  SSS sodium solute transporter superfamily  69.98 
 
 		 542 aa  649    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.641913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13340  SSS sodium solute transporter  70.15 
 
 		 556 aa  674    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0683463  normal  0.0921974 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4055  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  67.54 
 
 		 541 aa  644    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.647451  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1967  SSS sodium solute transporter superfamily  67.78 
 
 		 552 aa  645    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.732438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12100  SSS sodium solute transporter  72.52 
 
 		 532 aa  683    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.24513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4130  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  67.54 
 
 		 541 aa  644    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.502613  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06910  SSS sodium solute transporter  70.25 
 
 		 540 aa  670    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4564  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  68.48 
 
 		 543 aa  644    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.252386  normal  0.41587 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4284  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  67.54 
 
 		 541 aa  644    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.231008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0694  SSS sodium solute transporter superfamily  67.98 
 
 		 543 aa  633  1e-180  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0219  SSS sodium solute transporter superfamily  66.05 
 
 		 552 aa  633  1e-180  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1378  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  67.18 
 
 		 538 aa  630  1e-179  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1396  SSS sodium solute transporter superfamily  68.02 
 
 		 538 aa  622  1e-177  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000408051 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1814  SSS sodium solute transporter superfamily  66.48 
 
 		 545 aa  608  1e-173  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5174  SSS sodium solute transporter superfamily  62.74 
 
 		 525 aa  604  1.0000000000000001e-171  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1161  SSS sodium solute transporter superfamily  60.77 
 
 		 568 aa  590  1e-167  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.710493  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3167  SSS sodium solute transporter superfamily  61.68 
 
 		 536 aa  580  1e-164  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0572213  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5018  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  60.07 
 
 		 557 aa  570  1e-161  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000399279 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4508  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  59.89 
 
 		 557 aa  570  1e-161  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6314  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  60.64 
 
 		 536 aa  571  1e-161  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.267295  normal  0.199401 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2129  SSS sodium solute transporter superfamily protein  59.77 
 
 		 537 aa  563  1.0000000000000001e-159  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.896322  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1538  SSS sodium solute transporter superfamily protein  59.01 
 
 		 551 aa  554  1e-156  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.535704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0347  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  58.67 
 
 		 534 aa  538  1e-151  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3815  Na+/solute symporter  56.29 
 
 		 584 aa  527  1e-148  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00808534 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4127  SSS sodium solute transporter superfamily  56.15 
 
 		 561 aa  525  1e-148  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1760  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  50.38 
 
 		 530 aa  470  1.0000000000000001e-131  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.983666  normal  0.122546 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1021  SSS sodium solute transporter superfamily  48.95 
 
 		 515 aa  461  9.999999999999999e-129  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.359049  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1330  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  49.22 
 
 		 516 aa  458  9.999999999999999e-129  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.892115  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1726  sodium/solute symporter family protein  48.06 
 
 		 516 aa  455  1e-127  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1523  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  48.26 
 
 		 516 aa  456  1e-127  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.292925  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1672  sodium/solute symporter family protein  48.26 
 
 		 516 aa  456  1e-127  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.206426  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1777  sodium/solute symporter family protein  48.06 
 
 		 516 aa  455  1e-127  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.165855  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1518  sodium/solute symporter family protein  48.06 
 
 		 516 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.782594  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1490  sodium/solute symporter family protein; sodium/proline symporter  47.87 
 
 		 516 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0960795  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1480  sodium/solute symporter family protein; sodium/proline symporter  48.06 
 
 		 516 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1703  sodium/solute symporter family protein  48.06 
 
 		 516 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3672  sodium/solute symporter family protein  48.06 
 
 		 516 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0653794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1635  sodium/solute symporter family protein  48.06 
 
 		 516 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0315  SSS sodium solute transporter superfamily  49.14 
 
 		 519 aa  454  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.721086 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2490  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  47.02 
 
 		 515 aa  444  1e-123  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0635  acetate permease  47.24 
 
 		 559 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.953483  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0827  SSS sodium solute transporter superfamily  47.15 
 
 		 513 aa  437  1e-121  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2623  acetate permease  47.01 
 
 		 563 aa  434  1e-120  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1891  acetate permease  45.49 
 
 		 551 aa  432  1e-120  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.45053  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22350  acetate permease  45.68 
 
 		 551 aa  433  1e-120  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000316225 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3836  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  47.24 
 
 		 539 aa  433  1e-120  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.808948 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1624  sodium:solute symporter family protein  45.68 
 
 		 552 aa  430  1e-119  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.484288  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3756  acetate permease  45.68 
 
 		 552 aa  431  1e-119  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.574544  normal  0.130195 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3976  acetate permease  46.27 
 
 		 554 aa  431  1e-119  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.900001  normal  0.864966 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0295  acetate permease  44.99 
 
 		 550 aa  429  1e-119  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.510607  hitchhiker  0.000229004 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0556  acetate permease  47.68 
 
 		 572 aa  430  1e-119  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1743  acetate permease  46.08 
 
 		 554 aa  428  1e-118  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0683  acetate permease  45.3 
 
 		 552 aa  426  1e-118  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0912  acetate permease  45.49 
 
 		 552 aa  427  1e-118  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1335  acetate permease  45.71 
 
 		 554 aa  426  1e-118  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.384462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3923  acetate permease  44.78 
 
 		 551 aa  425  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.281224  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1293  acetate permease  45.9 
 
 		 554 aa  427  1e-118  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3837  acetate permease  44.78 
 
 		 551 aa  426  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0353587  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1608  acetate permease  45.86 
 
 		 552 aa  422  1e-117  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.409391 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1454  acetate permease  45.49 
 
 		 554 aa  425  1e-117  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.253764  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1718  SSS sodium solute transporter superfamily  47.16 
 
 		 511 aa  423  1e-117  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3703  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  45.9 
 
 		 541 aa  422  1e-117  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3377  acetate permease  43.86 
 
 		 552 aa  422  1e-117  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0784287  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5783  acetate permease  46.83 
 
 		 553 aa  422  1e-117  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.061822 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3949  acetate permease  44.78 
 
 		 551 aa  425  1e-117  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.739246 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3960  acetate permease  44.97 
 
 		 549 aa  419  1e-116  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.221467 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4311  acetate permease  44.97 
 
 		 549 aa  419  1e-116  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0375  acetate permease  47.04 
 
 		 553 aa  422  1e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3843  SSS sodium solute transporter superfamily  46.1 
 
 		 541 aa  421  1e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4622  acetate permease  44.97 
 
 		 549 aa  419  1e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3760  SSS sodium solute transporter superfamily  46.48 
 
 		 541 aa  422  1e-116  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0887  SSS sodium solute transporter superfamily  44.57 
 
 		 553 aa  420  1e-116  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03939  acetate permease  44.78 
 
 		 549 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.68156  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3925  cation/acetate symporter ActP  44.78 
 
 		 549 aa  418  9.999999999999999e-116  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1850  SSS sodium solute transporter superfamily  47.04 
 
 		 513 aa  417  9.999999999999999e-116  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5873  acetate permease  46.65 
 
 		 553 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2431  acetate permease  45.44 
 
 		 577 aa  416  9.999999999999999e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.157146  normal  0.21776 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0465  SSS sodium solute transporter superfamily  45.56 
 
 		 576 aa  416  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4619  acetate permease  44.97 
 
 		 549 aa  417  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0535  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  45.74 
 
 		 575 aa  417  9.999999999999999e-116  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1980  Na+/solute symporter  45.4 
 
 		 576 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03899  hypothetical protein  44.78 
 
 		 549 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.790578  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4586  acetate permease  44.78 
 
 		 549 aa  418  9.999999999999999e-116  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.781469  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4668  acetate permease  44.97 
 
 		 549 aa  417  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.962936  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0449  SSS sodium solute transporter superfamily  45.56 
 
 		 576 aa  416  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.254616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4617  acetate permease  44.78 
 
 		 549 aa  416  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.825598  normal  0.309264 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4529  acetate permease  44.78 
 
 		 549 aa  418  9.999999999999999e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5572  acetate permease  44.78 
 
 		 549 aa  418  9.999999999999999e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4533  acetate permease  44.78 
 
 		 549 aa  416  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.612121  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4526  acetate permease  44.78 
 
 		 549 aa  416  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2994  Na+/solute symporter  48.24 
 
 		 632 aa  412  1e-114  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.77047  normal  0.396474 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3262  acetate permease  43.48 
 
 		 552 aa  414  1e-114  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1542  SSS sodium solute transporter superfamily  44.36 
 
 		 577 aa  408  1.0000000000000001e-112  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000862893  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1420  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  42.3 
 
 		 659 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000140042  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>