More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_4179 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_4179  late competence protein ComER  100 
 
 
275 aa  566  1e-160  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.427252  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0789  late competence protein ComER  96 
 
 
275 aa  549  1e-155  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0125118  hitchhiker  0.000000168646 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4448  late competence protein ComER  96 
 
 
275 aa  549  1e-155  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0500501  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4409  late competence protein ComER  94.91 
 
 
275 aa  543  1e-153  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4225  late competence protein ComER  94.55 
 
 
275 aa  542  1e-153  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.755037  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4461  late competence protein ComER  94.55 
 
 
275 aa  542  1e-153  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000265732  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4350  late competence protein ComER  94.55 
 
 
275 aa  542  1e-153  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000932909 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4063  late competence protein ComER  94.34 
 
 
265 aa  521  1e-147  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00294057  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4554  late competence protein ComER  94.34 
 
 
265 aa  521  1e-147  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00155928  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4073  late competence protein ComER  94.34 
 
 
265 aa  520  1e-146  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3054  late competence protein ComER  81.45 
 
 
283 aa  476  1e-133  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.126852  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2452  late competence protein ComER  55.15 
 
 
273 aa  332  5e-90  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00347201  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0999  late competence protein ComER  57.72 
 
 
272 aa  322  4e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0740  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  30.23 
 
 
266 aa  133  3e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0197  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.35 
 
 
271 aa  102  5e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.625905 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1294  pyrroline-5-carboxylate reductase  23.64 
 
 
266 aa  98.2  1e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0466034  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1084  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.64 
 
 
272 aa  93.2  4e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000115496  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1339  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.03 
 
 
260 aa  92  1e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000013369  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4045  pyrroline-5-carboxylate reductase  23.98 
 
 
279 aa  89  7e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4160  pyrroline-5-carboxylate reductase  23.98 
 
 
279 aa  89  7e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4359  pyrroline-5-carboxylate reductase  23.98 
 
 
279 aa  89  7e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2889  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.83 
 
 
263 aa  89  9e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.792584  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2788  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.47 
 
 
267 aa  88.2  1e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.510272  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1990  pyrroline-5-carboxylate reductase  23.67 
 
 
268 aa  87  3e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.307416  normal  0.0845217 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0990  pyrroline-5-carboxylate reductase  23.79 
 
 
279 aa  86.7  4e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0955  pyrroline-5-carboxylate reductase  24.9 
 
 
268 aa  86.7  4e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00507177  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4270  pyrroline-5-carboxylate reductase  23.79 
 
 
279 aa  86.7  4e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4207  pyrroline-5-carboxylate reductase  23.79 
 
 
279 aa  86.3  5e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1560  pyrroline-5-carboxylate reductase  19.92 
 
 
271 aa  85.9  7e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1591  pyrroline-5-carboxylate reductase  19.92 
 
 
271 aa  85.9  7e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.542634  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2500  pyrroline-5-carboxylate reductase  23.16 
 
 
267 aa  85.5  8e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000695337  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02750  pyrroline-5-carboxylate reductase  25.31 
 
 
270 aa  85.5  8e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1615  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.83 
 
 
264 aa  85.5  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133748  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0397  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.64 
 
 
270 aa  85.5  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0481  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.34 
 
 
267 aa  85.1  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.790225  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3883  pyrroline-5-carboxylate reductase  22.76 
 
 
279 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3891  pyrroline-5-carboxylate reductase  22.98 
 
 
279 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4246  pyrroline-5-carboxylate reductase  23.39 
 
 
279 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0610  pyrroline-5-carboxylate reductase  24.08 
 
 
267 aa  84.7  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0436215 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0533  Pyrroline-5-carboxylate reductase  25.51 
 
 
264 aa  84.3  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1439  pyrroline-5-carboxylate reductase  25.82 
 
 
262 aa  82.8  0.000000000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0460  pyrroline-5-carboxylate reductase  25.31 
 
 
269 aa  82.8  0.000000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3969  pyrroline-5-carboxylate reductase  22.98 
 
 
279 aa  82  0.000000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0480  pyrroline-5-carboxylate reductase  23.87 
 
 
272 aa  81.6  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.904578 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0416  pyrroline-5-carboxylate reductase  25.31 
 
 
269 aa  81.6  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00333  pyrroline-5-carboxylate reductase  24.9 
 
 
269 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3222  pyrroline-5-carboxylate reductase  24.9 
 
 
269 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0422  pyrroline-5-carboxylate reductase  24.39 
 
 
269 aa  81.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3383  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.04 
 
 
267 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00337  hypothetical protein  24.9 
 
 
269 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0428  pyrroline-5-carboxylate reductase  24.39 
 
 
269 aa  81.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0454  pyrroline-5-carboxylate reductase  24.9 
 
 
269 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0413  pyrroline-5-carboxylate reductase  24.9 
 
 
269 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0423  pyrroline-5-carboxylate reductase  24.39 
 
 
269 aa  81.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.244975 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0303  pyrroline-5-carboxylate reductase  25 
 
 
269 aa  81.3  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0441  pyrroline-5-carboxylate reductase  24.39 
 
 
269 aa  81.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0483  pyrroline-5-carboxylate reductase  24.39 
 
 
269 aa  81.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3246  pyrroline-5-carboxylate reductase  24.9 
 
 
269 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0855673 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0893  pyrroline-5-carboxylate reductase  25.29 
 
 
276 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.585306  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0660  pyrroline-5-carboxylate reductase  25.2 
 
 
271 aa  80.1  0.00000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0857  pyrroline-5-carboxylate reductase  23.36 
 
 
269 aa  80.5  0.00000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.236011 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0197  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.52 
 
 
267 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_181  pyrroline-5-carboxylate reductase  24.07 
 
 
267 aa  78.2  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.136848  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0160  pyrroline-5-carboxylate reductase  24.6 
 
 
267 aa  77.8  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5103  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.25 
 
 
267 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0898  pyrroline-5-carboxylate reductase  25.2 
 
 
270 aa  76.6  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2901  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.1 
 
 
270 aa  77  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000081741  unclonable  0.000000152537 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3168  pyrroline-5-carboxylate reductase  23.16 
 
 
273 aa  77  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.624032  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4459  pyrroline-5-carboxylate reductase  24.7 
 
 
267 aa  77.4  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0937  pyrroline-5-carboxylate reductase  23.98 
 
 
268 aa  77.4  0.0000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0247  pyrroline-5-carboxylate reductase  24.08 
 
 
276 aa  77.4  0.0000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0642346  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2466  pyrroline-5-carboxylate reductase  24.49 
 
 
266 aa  76.6  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.391449  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1065  pyrroline-5-carboxylate reductase  18.55 
 
 
271 aa  76.3  0.0000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.378355  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_13156  predicted protein  24.51 
 
 
276 aa  76.3  0.0000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.37833  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0863  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.61 
 
 
267 aa  76.6  0.0000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16300  pyrroline-5-carboxylate reductase  23.46 
 
 
263 aa  75.5  0.0000000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000034622  hitchhiker  0.000154585 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0351  pyrroline-5-carboxylate reductase  24.5 
 
 
280 aa  75.5  0.0000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0979  pyrroline-5-carboxylate reductase  23.46 
 
 
270 aa  75.5  0.0000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000628805  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23950  pyrroline-5-carboxylate reductase  24.11 
 
 
275 aa  75.5  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.264409  normal  0.813225 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12663  pyrroline-5-carboxylate reductase  23.17 
 
 
266 aa  75.1  0.000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.549877  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3146  pyrroline-5-carboxylate reductase  22.8 
 
 
277 aa  74.3  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.363144 
 
 
-
 
NC_002936  DET0193  pyrroline-5-carboxylate reductase  23.7 
 
 
267 aa  74.7  0.000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0459  pyrroline-5-carboxylate reductase  23.22 
 
 
263 aa  74.3  0.000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000279105  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0249  pyrroline-5-carboxylate reductase  23.17 
 
 
264 aa  73.6  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.236328  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0926  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.05 
 
 
265 aa  73.9  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.415522 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0837  pyrroline-5-carboxylate reductase  23.53 
 
 
306 aa  73.2  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.60816 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2111  pyrroline-5-carboxylate reductase  23.81 
 
 
269 aa  72.8  0.000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.778537  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6743  pyrroline-5-carboxylate reductase  22.86 
 
 
270 aa  72.8  0.000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0661  pyrroline-5-carboxylate reductase  23.6 
 
 
294 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.738548 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0217  pyrroline-5-carboxylate reductase  25.86 
 
 
267 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1570  pyrroline-5-carboxylate reductase  21.72 
 
 
281 aa  72  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2899  pyrroline-5-carboxylate reductase  23.67 
 
 
272 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00203272  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3161  pyrroline-5-carboxylate reductase  25.94 
 
 
269 aa  71.6  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00631355 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0668  pyrroline-5-carboxylate reductase  23.6 
 
 
294 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0974  pyrroline-5-carboxylate reductase  20.36 
 
 
278 aa  72  0.00000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.917408 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0075  pyrroline-5-carboxylate reductase  22.78 
 
 
293 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.505458  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0681  pyrroline-5-carboxylate reductase  23.6 
 
 
294 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.128651  normal  0.214546 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0188  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.24 
 
 
267 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0223  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.46 
 
 
253 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0732  pyrroline-5-carboxylate reductase  23.08 
 
 
271 aa  70.9  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>