83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_4271 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_4271  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  100 
 
 		 341 aa  685    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0416892  hitchhiker  0.000248822 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0424  hypothetical protein  46.02 
 
 		 344 aa  259  6e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.938992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0139  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III  45.32 
 
 		 340 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3801  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  33.53 
 
 		 351 aa  137  3.0000000000000003e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0418  hypothetical protein  30.03 
 
 		 330 aa  93.6  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0133  hypothetical protein  29.21 
 
 		 353 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3808  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein)-like protein  27.88 
 
 		 339 aa  77  0.0000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7424  hypothetical protein  29.49 
 
 		 363 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0373604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1183  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  25.84 
 
 		 325 aa  72  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.385882 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6137  hypothetical protein  27.12 
 
 		 363 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.295579  normal  0.0515826 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6506  hypothetical protein  30.04 
 
 		 364 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.995257 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0641  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  27.4 
 
 		 329 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1079  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  26.69 
 
 		 329 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.796482 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6015  hypothetical protein  29.11 
 
 		 364 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00375312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1121  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  26.69 
 
 		 329 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5650  hypothetical protein  29.11 
 
 		 364 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.16977  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1717  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  27.88 
 
 		 329 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2853  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  25.7 
 
 		 329 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.431701  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4233  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  26.39 
 
 		 329 aa  66.2  0.0000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.338438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2907  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  25.27 
 
 		 329 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.152596  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2802  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  25.27 
 
 		 329 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.206576  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2479  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  25.27 
 
 		 329 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.476916  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2792  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  25.27 
 
 		 329 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.95861  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0530  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  25.27 
 
 		 329 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1802  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  25.27 
 
 		 329 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.44344  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4277  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  33.13 
 
 		 346 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00141779 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3650  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  24.24 
 
 		 325 aa  62.4  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0611  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  22.42 
 
 		 330 aa  62  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000255652 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2183  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  26.39 
 
 		 329 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.415325  normal  0.0499855 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1389  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  25.38 
 
 		 325 aa  61.6  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1072  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  26.1 
 
 		 329 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0997  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  26.69 
 
 		 329 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1001  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  26.69 
 
 		 329 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2912  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  25.37 
 
 		 329 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.462456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3252  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  26.26 
 
 		 325 aa  58.5  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.182454  normal  0.0774583 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0828  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  26.1 
 
 		 329 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2328  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  23.76 
 
 		 321 aa  57.8  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.927154  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5272  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  23.86 
 
 		 325 aa  56.6  0.0000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1050  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  25 
 
 		 326 aa  56.6  0.0000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.682522  normal  0.412179 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1730  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  25.31 
 
 		 325 aa  55.5  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2889  hypothetical protein  32.81 
 
 		 346 aa  55.1  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0540  hypothetical protein  32.81 
 
 		 346 aa  55.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0522  hypothetical protein  32.81 
 
 		 346 aa  54.7  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.724316  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0127  hypothetical protein  32.81 
 
 		 346 aa  55.1  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1461  hypothetical protein  32.81 
 
 		 346 aa  55.1  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2633  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  23.6 
 
 		 325 aa  54.7  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3280  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  23.6 
 
 		 325 aa  54.7  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.577877 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3076  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  26.22 
 
 		 325 aa  54.7  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3157  hypothetical protein  32.81 
 
 		 346 aa  55.1  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0706  hypothetical protein  32.81 
 
 		 346 aa  55.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0663628  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1229  putative 3-oxoacyl-ACP synthase III  23.66 
 
 		 344 aa  53.9  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.577241  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0398  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  23.98 
 
 		 328 aa  53.1  0.000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0191225  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3802  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  25.38 
 
 		 316 aa  50.4  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0405  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  24.1 
 
 		 328 aa  50.1  0.00006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2430  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  24.44 
 
 		 326 aa  49.7  0.00008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1806  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  22.38 
 
 		 323 aa  49.3  0.00009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.278367  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0636  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  25.56 
 
 		 332 aa  48.9  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0643403 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1072  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  25.97 
 
 		 319 aa  49.3  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0229  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  21.36 
 
 		 330 aa  47  0.0005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2003  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  23.67 
 
 		 321 aa  46.2  0.0008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02706  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  26.53 
 
 		 325 aa  45.8  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1601  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  24.63 
 
 		 320 aa  45.8  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0233634  normal  0.552006 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1423  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  23.45 
 
 		 323 aa  45.8  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.495609  normal  0.708105 
 
 
-
 
NC_002978  WD0985  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  22.9 
 
 		 318 aa  45.4  0.001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1507  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  25.09 
 
 		 318 aa  45.8  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0140493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2124  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  25.53 
 
 		 319 aa  45.4  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0114121  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1601  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  24.31 
 
 		 319 aa  45.4  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000117796  hitchhiker  0.000966367 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1235  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  26.26 
 
 		 323 aa  44.7  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.226489  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6140  hypothetical protein  27.78 
 
 		 329 aa  44.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0927717 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6503  hypothetical protein  28.16 
 
 		 327 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.57028 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2496  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  23.68 
 
 		 319 aa  45.4  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000027329  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2265  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  23.05 
 
 		 326 aa  45.1  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.3727  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1583  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  23.53 
 
 		 319 aa  44.3  0.003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0414109  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0602  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  23.53 
 
 		 319 aa  44.3  0.003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000174189  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6012  hypothetical protein  27.17 
 
 		 327 aa  43.9  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0139074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5647  hypothetical protein  27.17 
 
 		 327 aa  43.9  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.210784  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1585  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  24.73 
 
 		 316 aa  43.9  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000421947  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1667  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  28.74 
 
 		 330 aa  43.9  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.290479  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0915  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  22.05 
 
 		 326 aa  43.5  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.170701 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7421  hypothetical protein  27.18 
 
 		 329 aa  43.1  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.399758  normal  0.885703 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0980  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  28.05 
 
 		 326 aa  43.1  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.107285 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2040  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  22.61 
 
 		 319 aa  42.7  0.009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000147656  normal  0.0175917 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2923  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  30.12 
 
 		 325 aa  42.7  0.01  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.437795  hitchhiker  0.000795877 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>