33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_1695 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_1695  hypothetical protein  100 
 
 
162 aa  332  1e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.307378  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5287  hypothetical protein  82.4 
 
 
125 aa  217  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5570  hypothetical protein  85.26 
 
 
95 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1989  hypothetical protein  42.22 
 
 
172 aa  94.7  5e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.181266  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1246  hypothetical protein  46 
 
 
171 aa  88.6  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1533  hypothetical protein  44.12 
 
 
178 aa  88.2  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.914411 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2271  hypothetical protein  46.46 
 
 
171 aa  87.8  5e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.994316  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2279  hypothetical protein  45.36 
 
 
314 aa  86.7  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.989649  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2145  hypothetical protein  45.36 
 
 
171 aa  87  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.344092  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2088  hypothetical protein  45.36 
 
 
171 aa  86.7  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1647  hypothetical protein  43.14 
 
 
180 aa  84.3  6e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1647  hypothetical protein  43.14 
 
 
178 aa  84.3  7e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.349986  normal  0.491774 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1776  hypothetical protein  39 
 
 
168 aa  83.2  0.000000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.073575  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0257  hypothetical protein  40 
 
 
179 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.821198 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2113  hypothetical protein  41.58 
 
 
197 aa  80.1  0.00000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5022  hypothetical protein  42.72 
 
 
181 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.177279 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1739  hypothetical protein  42.72 
 
 
183 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.660293  normal  0.611186 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6353  hypothetical protein  42.72 
 
 
180 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1725  hypothetical protein  42.72 
 
 
180 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2997  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  34.69 
 
 
179 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.388571  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5590  hypothetical protein  35.92 
 
 
177 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.386943  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1388  hypothetical protein  30.97 
 
 
209 aa  55.8  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.610976 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2337  hypothetical protein  32.74 
 
 
192 aa  50.4  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3214  hypothetical protein  28.85 
 
 
221 aa  49.3  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2943  hypothetical protein  31.11 
 
 
152 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.61221 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0921  hypothetical protein  27.64 
 
 
152 aa  47  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.38389  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4888  hypothetical protein  30.21 
 
 
106 aa  46.2  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.503138  normal  0.689634 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3124  hypothetical protein  26.53 
 
 
155 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6040  hypothetical protein  33.94 
 
 
205 aa  44.3  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.152767  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3424  hypothetical protein  30.21 
 
 
138 aa  43.9  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2714  hypothetical protein  29.7 
 
 
196 aa  42  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3231  hypothetical protein  29.41 
 
 
185 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.114974  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2839  hypothetical protein  29.03 
 
 
165 aa  41.2  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>