27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_3153 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008543  Bcen2424_5215  hypothetical protein  100 
 
 
261 aa  544  1e-154  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.197637 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3153  hypothetical protein  100 
 
 
261 aa  544  1e-154  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5059  hypothetical protein  99.62 
 
 
268 aa  543  1e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4392  hypothetical protein  26.67 
 
 
344 aa  62.4  0.000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.537919  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4978  hypothetical protein  31.01 
 
 
357 aa  62  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00760749 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2522  hypothetical protein  31.82 
 
 
357 aa  60.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.716097  normal  0.197177 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1578  hypothetical protein  27.15 
 
 
356 aa  59.3  0.00000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.223334  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1592  hypothetical protein  24.72 
 
 
378 aa  56.6  0.0000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.350355  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0695  hypothetical protein  24.72 
 
 
378 aa  56.6  0.0000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.513596  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5593  hypothetical protein  27.34 
 
 
849 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5415  hypothetical protein  27.34 
 
 
849 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.590405  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2128  hypothetical protein  24.7 
 
 
331 aa  52.4  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0161775 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2503  hypothetical protein  24.7 
 
 
342 aa  52.4  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0217  hypothetical protein  29.46 
 
 
433 aa  50.8  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.289698  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1645  hypothetical protein  24.81 
 
 
342 aa  50.4  0.00003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4508  hypothetical protein  26.67 
 
 
306 aa  50.4  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1705  hypothetical protein  28.21 
 
 
193 aa  49.3  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.614952 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0123  hypothetical protein  45.24 
 
 
366 aa  48.5  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0542  hypothetical protein  34.07 
 
 
455 aa  46.6  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1348  hypothetical protein  22.96 
 
 
472 aa  46.2  0.0005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1224  hypothetical protein  22.96 
 
 
472 aa  46.2  0.0005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2646  hypothetical protein  22.96 
 
 
497 aa  46.2  0.0006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.676397  normal  0.0791481 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2173  hypothetical protein  22.96 
 
 
497 aa  46.2  0.0006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0687306  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3049  hypothetical protein  25.95 
 
 
397 aa  45.8  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.356075 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0880  hypothetical protein  34.57 
 
 
568 aa  45.4  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.889726  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0189  hypothetical protein  32.32 
 
 
307 aa  44.3  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0498  hypothetical protein  39.53 
 
 
269 aa  42.7  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.167993  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>