21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3411 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_3411  putative integral membrane protein  100 
 
 		 110 aa  208  2e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0446  hypothetical protein  43.93 
 
 		 109 aa  87.4  7e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.311832 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0845  cyclic nucleotide-binding  47 
 
 		 116 aa  85.5  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.846806 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3084  Protein of unknown function DUF2516  47.52 
 
 		 112 aa  80.5  0.000000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000115295 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05000  Protein of unknown function (DUF2516)  47.78 
 
 		 111 aa  73.6  0.0000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0486  hypothetical protein  42.2 
 
 		 113 aa  72.8  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.526318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0886  putative integral membrane protein  42.86 
 
 		 115 aa  73.6  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.158506  hitchhiker  0.00123293 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0665  hypothetical protein  47.19 
 
 		 108 aa  69.3  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25720  Protein of unknown function (DUF2516)  43.62 
 
 		 105 aa  68.9  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0719  hypothetical protein  40.59 
 
 		 117 aa  65.9  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.918882  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4620  hypothetical protein  43.27 
 
 		 96 aa  57.8  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2918  hypothetical protein  33 
 
 		 104 aa  54.3  0.0000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0842  hypothetical protein  43.62 
 
 		 100 aa  53.9  0.0000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0946  hypothetical protein  36 
 
 		 108 aa  52.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.615167  normal  0.605499 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8229  hypothetical protein  40.66 
 
 		 108 aa  50.8  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3024  hypothetical protein  38 
 
 		 105 aa  46.6  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10484  transmembrane protein  38.46 
 
 		 87 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.363329  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4330  Protein of unknown function DUF2516  32.99 
 
 		 99 aa  42.7  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0381  hypothetical protein  38.46 
 
 		 105 aa  42.4  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0467572 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02500  Protein of unknown function (DUF2516)  32.32 
 
 		 99 aa  42  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.15354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4187  hypothetical protein  34.09 
 
 		 97 aa  40.4  0.008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>