20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1494 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_1494  hypothetical protein  100 
 
 
364 aa  735    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6043  hypothetical protein  37.6 
 
 
358 aa  216  4e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2700  hypothetical protein  29.58 
 
 
361 aa  151  1e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0141  hypothetical protein  32.6 
 
 
402 aa  125  1e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0223  hypothetical protein  49.51 
 
 
117 aa  100  5e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.178358  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1622  hypothetical protein  34.68 
 
 
345 aa  93.6  5e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.324666  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0372  hypothetical protein  33.54 
 
 
345 aa  86.3  8e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00467863 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1904  hypothetical protein  29.82 
 
 
362 aa  79.3  0.00000000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1784  hypothetical protein  30.86 
 
 
292 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.288665 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1260  hypothetical protein  29.25 
 
 
372 aa  65.9  0.000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4471  hypothetical protein  35.24 
 
 
382 aa  63.9  0.000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.623888 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2394  hypothetical protein  29.25 
 
 
385 aa  63.5  0.000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0288  hypothetical protein  27.92 
 
 
395 aa  54.3  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0807  hypothetical protein  27.6 
 
 
402 aa  50.1  0.00007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.70353  hitchhiker  0.0000627115 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0174  hypothetical protein  38.81 
 
 
243 aa  47  0.0005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.263506 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2860  hypothetical protein  29.82 
 
 
332 aa  47  0.0005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.790409 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0636  hypothetical protein  37.1 
 
 
354 aa  45.1  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.968148  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf267  hypothetical protein  34.21 
 
 
244 aa  44.3  0.003  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4409  hypothetical protein  29.22 
 
 
401 aa  43.5  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0854  hypothetical protein  33.8 
 
 
240 aa  43.9  0.005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.289907  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>