21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BbuZS7_0142 on replicon NC_011728
Organism: Borrelia burgdorferi ZS7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011728  BbuZS7_0142  outer membrane efflux protein  100 
 
 
440 aa  870    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1581  outer membrane efflux protein  26.09 
 
 
454 aa  73.2  0.000000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3233  outer membrane efflux protein  22.86 
 
 
462 aa  57  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.367218  normal  0.578966 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0903  outer membrane efflux protein  21.3 
 
 
436 aa  56.6  0.0000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.331424  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1177  outer membrane efflux protein  21.14 
 
 
427 aa  55.5  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0836  outer membrane efflux protein  26.35 
 
 
446 aa  51.2  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2883  TolC family type I secretion outer membrane protein  21.89 
 
 
442 aa  50.1  0.00009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00170075  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0538  outer membrane efflux protein  21.39 
 
 
462 aa  49.7  0.0001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0063  outer membrane efflux protein  20.28 
 
 
408 aa  48.9  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0180654  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4142  outer membrane efflux protein  21.13 
 
 
497 aa  48.9  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.958426  hitchhiker  0.00365026 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3706  outer membrane efflux protein  22.39 
 
 
447 aa  48.9  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1617  outer membrane efflux protein  21.74 
 
 
467 aa  47  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3298  outer membrane efflux protein  22.02 
 
 
418 aa  47  0.0007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000531453  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3096  outer membrane efflux protein  21.95 
 
 
497 aa  46.6  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0733  outer membrane efflux protein, putative  20.49 
 
 
463 aa  46.2  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1143  outer membrane efflux protein  23.33 
 
 
455 aa  45.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0286987  normal  0.128527 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0162  outer membrane efflux protein  18.9 
 
 
433 aa  45.1  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4833  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  25.32 
 
 
474 aa  44.7  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.820871  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0366  outer membrane efflux protein  22.72 
 
 
437 aa  43.5  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1884  outer membrane efflux protein  20.37 
 
 
483 aa  43.5  0.008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0042  outer membrane efflux protein  22.57 
 
 
454 aa  43.5  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.293166 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>