21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_6488 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008392  Bamb_6488  O-antigen polymerase  100 
 
 		 442 aa  890    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1123  O-antigen polymerase  97.74 
 
 		 442 aa  828    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.801174  normal  0.617722 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3726  O-antigen polymerase  56.66 
 
 		 438 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.114038 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1654  O-antigen polymerase  25.25 
 
 		 754 aa  52.4  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04059  O-Antigen Polymerase family  23.7 
 
 		 425 aa  51.6  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2009  O-antigen polymerase  27.1 
 
 		 459 aa  47.8  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3579  O-antigen polymerase  23.78 
 
 		 501 aa  47.8  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0161  O-antigen polymerase  24.57 
 
 		 440 aa  47  0.0006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.971054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0152  hypothetical protein  22.98 
 
 		 389 aa  47  0.0007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2384  O-antigen polymerase  23.44 
 
 		 436 aa  46.6  0.0008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.486663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5652  O-antigen polymerase  28.36 
 
 		 426 aa  46.2  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2813  O-antigen polymerase  23.01 
 
 		 773 aa  45.8  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.192356  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2638  O-antigen polymerase  21.21 
 
 		 428 aa  44.7  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1087  O-antigen polymerase  23.88 
 
 		 612 aa  44.7  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2310  O-antigen polymerase  24.48 
 
 		 426 aa  43.9  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1698  O-antigen polymerase  24.48 
 
 		 426 aa  43.9  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2333  O-antigen polymerase  24.48 
 
 		 426 aa  43.9  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0425881 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4116  O-antigen polymerase  26.39 
 
 		 540 aa  43.9  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0014553  hitchhiker  0.00000561153 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3113  O-antigen polymerase  30.86 
 
 		 467 aa  43.5  0.007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000265772  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2212  O-antigen polymerase  28.96 
 
 		 415 aa  43.5  0.008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0880149  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2006  O-antigen polymerase  27.56 
 
 		 426 aa  43.1  0.01  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.188841  normal  0.439827 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>