131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4572 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008391  Bamb_4572  NADPH-dependent FMN reductase  100 
 
 
285 aa  573  1.0000000000000001e-163  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3190  NADPH-dependent FMN reductase  90.88 
 
 
285 aa  494  1e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5177  NADPH-dependent FMN reductase  90.88 
 
 
285 aa  494  1e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0196173 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3481  NADPH-dependent FMN reductase  88.46 
 
 
283 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.236769 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5096  NADPH-dependent FMN reductase  99.07 
 
 
216 aa  432  1e-120  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.332097 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0563  NADPH-dependent FMN reductase family protein  79.06 
 
 
423 aa  421  1e-117  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.50284  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5102  NADPH-dependent FMN reductase  95.83 
 
 
216 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0451  NADPH-dependent FMN reductase family protein  87.56 
 
 
220 aa  381  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0965  NADPH-dependent FMN reductase family protein  86.3 
 
 
220 aa  382  1e-105  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2029  NADPH-dependent FMN reductase  86.92 
 
 
216 aa  375  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1934  NADPH-dependent FMN reductase  87.38 
 
 
216 aa  376  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1873  NADPH-dependent FMN reductase family protein  86.92 
 
 
216 aa  375  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0904  NADPH-dependent FMN reductase family protein  86.45 
 
 
216 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3471  NADPH-dependent FMN reductase  74.78 
 
 
239 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.155268 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5706  NADPH-dependent FMN reductase  81.63 
 
 
219 aa  331  7.000000000000001e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.311167  normal  0.729619 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1014  NADPH-dependent FMN reductase family protein  82.65 
 
 
248 aa  329  3e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.065516 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0225  NADPH-dependent FMN reductase  61.8 
 
 
188 aa  216  4e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3268  NADPH-dependent FMN reductase  56.52 
 
 
209 aa  192  5e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.73404  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3042  NADPH-dependent FMN reductase  55.49 
 
 
204 aa  186  4e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.953695 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3711  NADPH-dependent FMN reductase  49.72 
 
 
202 aa  183  3e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0350299  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1286  NADPH-dependent FMN reductase  53.09 
 
 
254 aa  182  6e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.138321  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3780  NADPH-dependent FMN reductase  50 
 
 
193 aa  180  2e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3853  NADPH-dependent FMN reductase  50 
 
 
193 aa  180  2e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.201053  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3784  NADPH-dependent FMN reductase  50 
 
 
193 aa  180  2e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0598804  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3454  NADPH-dependent FMN reductase  54.26 
 
 
254 aa  178  1e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.742849  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2407  NADPH-dependent FMN reductase  51.89 
 
 
199 aa  178  1e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36310  predicted flavoprotein  55.19 
 
 
199 aa  175  8e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.5893 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4239  NADPH-dependent FMN reductase  50 
 
 
197 aa  175  9e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0700  NADPH-dependent FMN reductase  50 
 
 
189 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1658  NADPH-dependent FMN reductase  53.23 
 
 
191 aa  157  1e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0411854  normal  0.745478 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2460  NADPH-dependent FMN reductase  41.99 
 
 
184 aa  119  7e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.345085  normal  0.908129 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3596  NADPH-dependent FMN reductase  33.94 
 
 
182 aa  86.3  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0041425 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2443  NADPH-dependent FMN reductase  35.12 
 
 
181 aa  81.3  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000556188  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5221  NADPH-dependent FMN reductase  34.55 
 
 
181 aa  81.3  0.00000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.681461  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1148  NADPH-dependent FMN reductase  36.87 
 
 
183 aa  80.9  0.00000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.148322  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1209  NADPH-dependent FMN reductase  31.49 
 
 
178 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.398718  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1182  NADPH-dependent FMN reductase  31.49 
 
 
178 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3252  NADPH-dependent FMN reductase  30.34 
 
 
192 aa  77  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.399467  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3750  NADPH-dependent FMN reductase  33.01 
 
 
199 aa  75.1  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1275  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 
192 aa  72.4  0.000000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3996  NADPH-dependent FMN reductase  30.81 
 
 
188 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.938741  hitchhiker  0.00000030757 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2199  NADPH-dependent FMN reductase  34.25 
 
 
192 aa  70.9  0.00000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2933  NADPH-dependent FMN reductase  31.46 
 
 
192 aa  68.9  0.00000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.89226  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3357  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 
193 aa  68.6  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0315323  normal  0.261185 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2123  NADPH-dependent FMN reductase  31.11 
 
 
195 aa  66.6  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1954  NADPH-dependent FMN reductase  35.35 
 
 
197 aa  62.8  0.000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.867559  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1159  NADPH-dependent FMN reductase  31.43 
 
 
189 aa  56.2  0.0000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.310294  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2656  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 
179 aa  56.2  0.0000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02783  redicted flavoprotein  22.95 
 
 
188 aa  52.8  0.000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.690393  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0206  azoreductase  32.41 
 
 
188 aa  52.4  0.000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.525066  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4706  NADPH-dependent FMN reductase  38.78 
 
 
190 aa  52  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.781417  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3657  NADPH-dependent FMN reductase  38.78 
 
 
190 aa  52  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0164718  normal  0.508922 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0718  NADPH-dependent FMN reductase  29.2 
 
 
193 aa  52  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0038  NADPH-dependent FMN reductase  30.16 
 
 
193 aa  52  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4080  NADPH-dependent FMN reductase  38.78 
 
 
186 aa  51.6  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0440178  normal  0.0878712 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0158  NADPH-dependent FMN reductase  28.47 
 
 
193 aa  51.2  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0621741 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2518  NADPH-dependent FMN reductase  34.04 
 
 
180 aa  50.8  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.487931 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3562  NADPH-dependent FMN reductase  37.76 
 
 
190 aa  51.2  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0479753  normal  0.0938682 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1073  NADPH-dependent FMN reductase  27.85 
 
 
248 aa  50.8  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0282724  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0583  hypothetical protein  33.33 
 
 
188 aa  50.4  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.600123  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0597  hypothetical protein  33.33 
 
 
188 aa  50.4  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2685  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.25 
 
 
187 aa  50.8  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1480  NADPH-dependent FMN reductase  35.87 
 
 
179 aa  50.4  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.109308 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2220  NADPH-dependent FMN reductase  25.85 
 
 
237 aa  50.1  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.295954  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3523  NADPH-dependent FMN reductase  33.01 
 
 
218 aa  50.1  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1668  azobenzene reductase  29.92 
 
 
178 aa  50.1  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3864  NADPH-dependent FMN reductase  38.78 
 
 
190 aa  50.4  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2349  NADPH-dependent FMN reductase  37.11 
 
 
186 aa  49.3  0.00007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35080  putative arsenical resistance protein  30.19 
 
 
230 aa  49.3  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2136  arsenical resistance protein ArsH  25.97 
 
 
251 aa  48.9  0.00009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0138  NADPH-dependent FMN reductase  29.5 
 
 
173 aa  48.9  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.044565  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5403  NADPH-dependent FMN reductase  38.38 
 
 
190 aa  48.5  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1744  NADPH-dependent FMN reductase  27.74 
 
 
193 aa  48.5  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0255848  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2310  azoreductase  28.33 
 
 
179 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.702721  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0755  NADPH-dependent FMN reductase  31.5 
 
 
213 aa  47.4  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.263848  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2505  NADPH-dependent FMN reductase  31.29 
 
 
186 aa  46.6  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2386  azoreductase  27.05 
 
 
178 aa  46.6  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2259  azoreductase  27.05 
 
 
178 aa  47  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3066  azoreductase  27.05 
 
 
178 aa  47  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2056  azoreductase ( NAD(P)H oxidoreductase, quinone reductase )  27.05 
 
 
178 aa  46.6  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0521  NADPH-dependent FMN reductase  30.1 
 
 
217 aa  46.6  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2961  arsenical resistance protein ArsH  28.48 
 
 
230 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2279  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 
221 aa  46.2  0.0005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0533  NADPH-dependent FMN reductase  29.27 
 
 
176 aa  46.2  0.0006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2187  NADPH-dependent FMN reductase  30.43 
 
 
179 aa  46.2  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.171107  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5357  NADPH-dependent FMN reductase  38.04 
 
 
185 aa  46.2  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2096  azobenzene reductase  28.18 
 
 
178 aa  46.2  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0284733  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2122  azoreductase  27.05 
 
 
178 aa  45.8  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.120348  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2060  azoreductase ( NAD(P)H oxidoreductase, quinone reductase )  27.05 
 
 
178 aa  46.2  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2276  azoreductase  27.05 
 
 
178 aa  45.8  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.39855  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2302  azoreductase  27.05 
 
 
178 aa  46.2  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00698178 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2241  arsenate resistance ArsH  25.26 
 
 
248 aa  45.4  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.192404  normal  0.613999 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5053  arsenate resistance ArsH  23.81 
 
 
251 aa  45.4  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0010  NADPH-dependent FMN reductase  27.18 
 
 
194 aa  45.4  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.21951  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2403  NADPH-dependent FMN reductase  26.13 
 
 
185 aa  45.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.420707  normal  0.039915 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4174  hypothetical protein  32.69 
 
 
186 aa  45.4  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.469146  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1125  NADPH-dependent FMN reductase  29.13 
 
 
217 aa  45.4  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000715162  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2647  NADPH-dependent FMN reductase  31.9 
 
 
209 aa  44.3  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000475353  normal  0.334507 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0682  NADPH-dependent FMN reductase  25 
 
 
197 aa  44.7  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1184  NADPH-dependent FMN reductase  28.95 
 
 
223 aa  44.7  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.44131  normal  0.152042 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>