More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4057 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_4057  alcohol dehydrogenase  100 
 
 		 332 aa  628  1e-179  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00526605  normal  0.609446 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4513  alcohol dehydrogenase  94.88 
 
 		 332 aa  578  1e-164  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5633  alcohol dehydrogenase  92.45 
 
 		 332 aa  560  1e-158  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.804975  normal  0.311663 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1156  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  91.57 
 
 		 332 aa  560  1e-158  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00489379  normal  0.510287 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3701  zinc-binding alcohol dehydrogenase  92.75 
 
 		 332 aa  560  1e-158  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4667  alcohol dehydrogenase  92.75 
 
 		 332 aa  560  1e-158  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.647601 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1347  alcohol dehydrogenase  50 
 
 		 324 aa  290  3e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.640537  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2985  alcohol dehydrogenase  51.7 
 
 		 323 aa  275  1.0000000000000001e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6194  alcohol dehydrogenase  55.3 
 
 		 322 aa  271  1e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5617  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  47.84 
 
 		 324 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0414164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2206  alcohol dehydrogenase  47.68 
 
 		 324 aa  269  5e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.889298  normal  0.771237 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2328  alcohol dehydrogenase  47.68 
 
 		 324 aa  269  5e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0875  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  47.85 
 
 		 324 aa  268  1e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1703  alcohol dehydrogenase  50 
 
 		 330 aa  268  1e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000163624 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3799  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  53.31 
 
 		 332 aa  265  5.999999999999999e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0978462 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2472  alcohol dehydrogenase  46.93 
 
 		 325 aa  265  5.999999999999999e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.439289  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1305  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  46.91 
 
 		 324 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.263394  normal  0.0862174 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3912  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  53.31 
 
 		 332 aa  265  5.999999999999999e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7355  putative quinone oxidoreductase  53.82 
 
 		 322 aa  264  2e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356896  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2381  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  46.88 
 
 		 326 aa  263  3e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.722017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1678  zinc-binding alcohol dehydrogenase  47.06 
 
 		 324 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.05574  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2290  alcohol dehydrogenase  47.06 
 
 		 324 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0674  alcohol dehydrogenase  49.07 
 
 		 322 aa  262  6e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.31757 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2313  alcohol dehydrogenase  47.06 
 
 		 324 aa  262  6e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.730105 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1644  alcohol dehydrogenase  46.3 
 
 		 325 aa  261  1e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.44369 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0363  quinone oxidoreductase  46.6 
 
 		 324 aa  260  2e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1238  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  46.6 
 
 		 324 aa  261  2e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1879  quinone oxidoreductase  46.6 
 
 		 324 aa  260  2e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0458768  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4272  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  47.26 
 
 		 323 aa  260  2e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0472622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1080  quinone oxidoreductase  46.6 
 
 		 324 aa  260  2e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.169344  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0787  quinone oxidoreductase  46.6 
 
 		 324 aa  260  2e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.399125  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1391  quinone oxidoreductase  46.6 
 
 		 324 aa  260  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1245  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  46.6 
 
 		 324 aa  260  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3853  zinc-binding alcohol dehydrogenase  44.14 
 
 		 344 aa  261  2e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0988  alcohol dehydrogenase  46.91 
 
 		 324 aa  259  3e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1019  quinone oxidoreductase  46.6 
 
 		 324 aa  259  4e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.527544  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1516  quinone oxidoreductase  47.98 
 
 		 324 aa  259  4e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000615527  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2184  NADPH:quinone reductase, zeta-crystallin homolog oxidoreductase protein  47.53 
 
 		 324 aa  259  5.0000000000000005e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.200214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3903  alcohol dehydrogenase  46.95 
 
 		 323 aa  259  6e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.221632  normal  0.178635 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1981  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  46.29 
 
 		 326 aa  259  6e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.642936 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3255  putative NADPH-quinone reductase  45.99 
 
 		 324 aa  258  1e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.953866 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1508  zinc-binding alcohol dehydrogenase  44.65 
 
 		 325 aa  255  7e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3010  zinc-binding alcohol dehydrogenase  49.07 
 
 		 322 aa  255  8e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0482  zinc-binding alcohol dehydrogenase  43.93 
 
 		 322 aa  254  1.0000000000000001e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4375  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  46.34 
 
 		 323 aa  253  3e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.313231 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3049  quinone oxidoreductase, putative  45.13 
 
 		 331 aa  252  5.000000000000001e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.658374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1526  alcohol dehydrogenase  45.68 
 
 		 326 aa  253  5.000000000000001e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1476  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  46.86 
 
 		 323 aa  251  1e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2060  alcohol dehydrogenase  44.75 
 
 		 324 aa  251  1e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.285411  normal  0.174232 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3232  alcohol dehydrogenase  42.77 
 
 		 331 aa  251  2e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1191  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.88 
 
 		 323 aa  249  3e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.87291  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5121  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.58 
 
 		 324 aa  249  7e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3109  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  48.15 
 
 		 322 aa  248  1e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.750258  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3210  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  48.15 
 
 		 322 aa  247  2e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2503  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  44.51 
 
 		 327 aa  246  3e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.731792  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5962  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  47.32 
 
 		 323 aa  246  4e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0181365 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1429  zinc-binding alcohol dehydrogenase  44.07 
 
 		 331 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3228  alcohol dehydrogenase  43.37 
 
 		 324 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.603844 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0571  quinone oxidoreductase  43.83 
 
 		 324 aa  243  3e-63  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3633  alcohol dehydrogenase  43.21 
 
 		 325 aa  242  7e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1614  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  53.19 
 
 		 260 aa  242  7.999999999999999e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1694  zinc-binding alcohol dehydrogenase  45.57 
 
 		 325 aa  241  9e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0377622  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2194  alcohol dehydrogenase  45.98 
 
 		 329 aa  241  1e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.482564  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1170  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.38 
 
 		 331 aa  240  2.9999999999999997e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.636549 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0091  alcohol dehydrogenase  43.43 
 
 		 325 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.547437  hitchhiker  0.0000221127 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2619  zinc-binding alcohol dehydrogenase  43.24 
 
 		 324 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.869285  normal  0.466568 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0088  alcohol dehydrogenase  43.43 
 
 		 325 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.654811 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0072  quinone oxidoreductase  42.9 
 
 		 325 aa  239  4e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.899686  hitchhiker  0.0000690857 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1228  alcohol dehydrogenase  44.98 
 
 		 327 aa  239  6.999999999999999e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00210  NADH-quinone oxidoreductase  44.65 
 
 		 325 aa  238  1e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.336084  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0245  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  45.18 
 
 		 326 aa  236  3e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3468  alcohol dehydrogenase  42.25 
 
 		 328 aa  236  3e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.92927  normal  0.411159 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0088  alcohol dehydrogenase  42.3 
 
 		 325 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000155478 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0548  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  42.9 
 
 		 324 aa  235  7e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.967786 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1504  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  43.67 
 
 		 324 aa  235  7e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0905187 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0197  zinc-binding alcohol dehydrogenase  43.84 
 
 		 327 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2044  zinc-binding alcohol dehydrogenase  42.94 
 
 		 324 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0710  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  40.73 
 
 		 331 aa  233  3e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.384403  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2740  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.25 
 
 		 328 aa  232  5e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.42219  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1715  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.36 
 
 		 326 aa  232  5e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4840  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  43.21 
 
 		 326 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0102128  hitchhiker  0.00303362 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2841  alcohol dehydrogenase  44.77 
 
 		 324 aa  232  8.000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.397829  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3942  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.82 
 
 		 327 aa  231  1e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0553  alcohol dehydrogenase  47.84 
 
 		 325 aa  231  1e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0307226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3872  alcohol dehydrogenase  42.9 
 
 		 324 aa  231  1e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.772345 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1258  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.28 
 
 		 328 aa  231  1e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.292182  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7175  alcohol dehydrogenase  42.9 
 
 		 327 aa  230  2e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4146  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  44.3 
 
 		 315 aa  231  2e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.768272  normal  0.178855 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5553  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  39.51 
 
 		 327 aa  230  2e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4291  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  39.51 
 
 		 327 aa  230  2e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4603  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  39.51 
 
 		 327 aa  230  2e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3432  quinone oxidoreductase  47.78 
 
 		 320 aa  230  3e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.298467  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03923  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  39.51 
 
 		 327 aa  229  4e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.797763  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03883  hypothetical protein  39.51 
 
 		 327 aa  229  4e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.82301  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3977  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  39.51 
 
 		 327 aa  229  4e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.250547 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2632  zinc-binding alcohol dehydrogenase  43.03 
 
 		 324 aa  229  6e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.40031  decreased coverage  0.0000390702 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3381  NAD(P)H -dependent quinone oxidoreductase  45.17 
 
 		 324 aa  229  7e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.41624  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2949  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.6 
 
 		 324 aa  228  8e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1264  alcohol dehydrogenase  41.36 
 
 		 327 aa  228  9e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4512  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  39.21 
 
 		 327 aa  228  1e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>