44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4014 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007650  BTH_II1426  cupin family protein  88.97 
 
 		 418 aa  742    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1067  oxalate decarboxylase  88.73 
 
 		 418 aa  736    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.209096  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1331  oxalate decarboxylase  88.73 
 
 		 418 aa  736    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.223306  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1413  oxalate decarboxylase  88.73 
 
 		 418 aa  736    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00642683  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0503  oxalate decarboxylase  88.73 
 
 		 418 aa  736    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0231  oxalate decarboxylase  88.73 
 
 		 418 aa  736    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.842819  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4588  oxalate decarboxylase  93.78 
 
 		 418 aa  796    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.576029  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4014  oxalate decarboxylase  100 
 
 		 418 aa  859    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.553342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3780  twin-arginine translocation pathway signal  93.78 
 
 		 418 aa  796    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.150369  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4476  oxalate decarboxylase  99.28 
 
 		 418 aa  855    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.937895  normal  0.867974 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5717  oxalate decarboxylase  93.78 
 
 		 418 aa  796    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.619712  normal  0.130758 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1256  glucose-6-phosphate isomerase and related metalloenzyme  93.54 
 
 		 418 aa  796    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2575  cupin family protein  88.73 
 
 		 418 aa  736    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.97464  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1259  cupin family protein  88.73 
 
 		 418 aa  736    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0758699  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2678  bicupin, oxalate decarboxylase family  61.58 
 
 		 418 aa  548  1e-155  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1525  oxalate decarboxylase  52.66 
 
 		 408 aa  397  1e-109  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0264195 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1062  oxalate decarboxylase OxdD  51.92 
 
 		 398 aa  386  1e-106  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000538183  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4237  oxalate decarboxylase OxdD  51.65 
 
 		 398 aa  382  1e-105  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000976291  hitchhiker  0.0000000132545 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0371  bicupin, oxalate decarboxylase family  47.49 
 
 		 404 aa  378  1e-103  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.571775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0402  bicupin, oxalate decarboxylase family  49.87 
 
 		 404 aa  373  1e-102  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.861289  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0985  oxalate decarboxylase  46.52 
 
 		 405 aa  364  2e-99  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0110  bicupin, oxalate decarboxylase family  47.44 
 
 		 402 aa  342  5.999999999999999e-93  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2183  bicupin, oxalate decarboxylase family  45.7 
 
 		 384 aa  333  2e-90  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0200  oxalate decarboxylase  45.92 
 
 		 378 aa  330  4e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.284083 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1526  bicupin, oxalate decarboxylase family  45.79 
 
 		 658 aa  325  7e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08099  oxalate decarboxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G14610)  39.74 
 
 		 477 aa  291  2e-77  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.361819  normal  0.0552946 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2322  oxalate decarboxylase  43.88 
 
 		 389 aa  278  1e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03563  conserved hypothetical protein  40.12 
 
 		 407 aa  255  8e-67  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.86517  normal  0.801175 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2388  oxalate decarboxylase  35.67 
 
 		 389 aa  232  1e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00510235 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0722  bicupin, oxalate decarboxylase family  48.08 
 
 		 234 aa  204  2e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1922  cupin 2 domain-containing protein  27.94 
 
 		 347 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.249261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4437  cupin domain-containing protein  29.27 
 
 		 271 aa  84.3  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2283  Cupin domain protein  23.13 
 
 		 345 aa  76.6  0.0000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000254412  hitchhiker  0.00375901 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1792  hypothetical protein  28.19 
 
 		 211 aa  53.1  0.000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1577  hypothetical protein  28.19 
 
 		 224 aa  53.1  0.000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000455455  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1742  hypothetical protein  27.52 
 
 		 211 aa  50.8  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.614023  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1568  hypothetical protein  27.52 
 
 		 211 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1616  hypothetical protein  27.52 
 
 		 211 aa  50.8  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.751864  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1873  hypothetical protein  27.52 
 
 		 211 aa  50.4  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1617  cupin domain-containing protein  27.7 
 
 		 211 aa  50.1  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.240608  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1819  hypothetical protein  30.19 
 
 		 211 aa  50.1  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3988  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.91 
 
 		 146 aa  50.1  0.00008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.507618  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4149  hypothetical protein  32.61 
 
 		 150 aa  46.6  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.26535  decreased coverage  0.0023385 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0819  cupin 2 domain-containing protein  35.38 
 
 		 123 aa  43.1  0.008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>