15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_5954 on replicon NC_010557
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010557  BamMC406_5954  hypothetical protein  100 
 
 		 160 aa  334  2.9999999999999997e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6259  hypothetical protein  93.12 
 
 		 160 aa  313  5e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4723  hypothetical protein  83.33 
 
 		 157 aa  271  3e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3640  hypothetical protein  83.33 
 
 		 157 aa  271  3e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0498973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3881  nuclear transport factor 2  81.41 
 
 		 157 aa  267  5.9999999999999995e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.601684 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7237  hypothetical protein  76.88 
 
 		 196 aa  227  5e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.533194  normal  0.0625132 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3910  hypothetical protein  32.03 
 
 		 170 aa  66.2  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.257204  normal  0.0784799 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3902  hypothetical protein  32.33 
 
 		 170 aa  61.6  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0447997 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3898  hypothetical protein  30.25 
 
 		 164 aa  57  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.128161 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4734  hypothetical protein  28.24 
 
 		 141 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4181  calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain-containing protein  27.48 
 
 		 168 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2358  putative signal peptide protein  28.46 
 
 		 155 aa  49.7  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.010084  normal  0.35807 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04599  hypothetical protein  28.67 
 
 		 149 aa  46.2  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3899  hypothetical protein  28.08 
 
 		 154 aa  45.1  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0897201 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5240  hypothetical protein  29.91 
 
 		 133 aa  42.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>