31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4329 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006349  BMAA0177  BNR/Asp-box repeat-containing protein  80.7 
 
 		 428 aa  704    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5856  BNR/Asp-box repeat-containing protein  72.67 
 
 		 477 aa  702    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.248978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4329  BNR/Asp-box repeat-containing protein  100 
 
 		 480 aa  977    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.113261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1008  BNR/Asp-box repeat-containing protein  78.79 
 
 		 479 aa  754    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5868  BNR/Asp-box repeat-containing protein  93.35 
 
 		 481 aa  884    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.636475 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4186  BNR/Asp-box repeat-containing protein  92.52 
 
 		 481 aa  886    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.128008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3929  BNR/Asp-box repeat-containing protein  93.56 
 
 		 481 aa  887    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0204  BNR/Asp-box repeat-containing protein  78.79 
 
 		 479 aa  754    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.148464  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3869  BNR/Asp-box repeat-containing protein  98.75 
 
 		 480 aa  967    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.38541 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4437  BNR/Asp-box repeat-containing protein  93.56 
 
 		 481 aa  887    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2593  BNR/Asp-box repeat-containing protein  78.79 
 
 		 479 aa  754    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1349  BNR/Asp-box repeat-containing protein  78.79 
 
 		 479 aa  754    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2736  BNR/Asp-box repeat-containing protein  78.79 
 
 		 479 aa  754    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1545  BNR/Asp-box repeat-containing protein  80.83 
 
 		 458 aa  753    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6979  hypothetical protein  26.52 
 
 		 476 aa  77  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.960065 
 
 
-
 
NC_003296  RS05315  putative signal peptide protein  30.89 
 
 		 417 aa  58.5  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.639819  normal  0.559524 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4137  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  31.02 
 
 		 421 aa  57  0.0000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.56922  normal  0.429786 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4249  putative signal peptide protein  31.02 
 
 		 421 aa  57  0.0000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0577112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2387  hypothetical protein  29.19 
 
 		 419 aa  47  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0871  hypothetical protein  31.5 
 
 		 419 aa  46.2  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0883  hypothetical protein  31.5 
 
 		 419 aa  46.2  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0724858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0999  hypothetical protein  31.5 
 
 		 416 aa  45.1  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2629  hypothetical protein  31.5 
 
 		 416 aa  45.1  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.201415  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2998  hypothetical protein  31.5 
 
 		 416 aa  44.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.734005  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4524  hypothetical protein  23.43 
 
 		 617 aa  45.1  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.691049  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0147  hypothetical protein  31.5 
 
 		 416 aa  45.1  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4091  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  22.84 
 
 		 402 aa  45.1  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3036  putative lipoprotein  31.5 
 
 		 385 aa  44.7  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101874  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4119  hypothetical protein  29.92 
 
 		 422 aa  44.3  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000696005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1253  hypothetical protein  25.28 
 
 		 437 aa  43.9  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.237005 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1599  BNR/Asp-box repeat-containing protein  27.95 
 
 		 423 aa  43.5  0.008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.157669  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>