39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_1717 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_1717  prohead protease  100 
 
 
525 aa  1066    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.155167  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1641  prohead protease  72.15 
 
 
197 aa  228  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.627569  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4115  peptidase U35, phage prohead HK97  28.91 
 
 
649 aa  176  7e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2613  peptidase U35 phage prohead HK97  29.3 
 
 
661 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.846097  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4282  peptidase U35 phage prohead HK97  29.3 
 
 
661 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0239  peptidase U35 phage prohead HK97  47.95 
 
 
206 aa  151  4e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5067  peptidase U35 phage prohead HK97  44.81 
 
 
659 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4080  peptidase U35 phage prohead HK97  45.45 
 
 
659 aa  147  3e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2238  peptidase U35, phage prohead HK97  41.03 
 
 
646 aa  114  6e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1539  putative prohead protease  37.42 
 
 
645 aa  103  7e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2246  putative prohead protease  37.42 
 
 
645 aa  103  7e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000101798 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2892  putative prohead protease  37.42 
 
 
645 aa  103  7e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000204536 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1640  hypothetical protein  28.08 
 
 
431 aa  82  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.891376  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1518  prohead protease  30.18 
 
 
224 aa  73.9  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1358  HK97 family phage prohead protease  32.33 
 
 
171 aa  64.7  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.272379 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0276  HK97 family phage prohead protease  29.61 
 
 
168 aa  62.4  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3485  HK97 family phage prohead protease  30.45 
 
 
244 aa  60.1  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.41974  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0554  HK97 family phage prohead protease  30.89 
 
 
172 aa  59.3  0.0000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2015  putative phage-related protein  23.56 
 
 
446 aa  56.6  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0608266 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2490  peptidase U35, phage prohead HK97  33.07 
 
 
165 aa  55.1  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.810682  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0588  protease, putative  31.43 
 
 
222 aa  53.9  0.000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.688885  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0589  prohead protease  31.43 
 
 
222 aa  53.5  0.000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1601  phage prohead protease, HK97 family  27.67 
 
 
240 aa  51.2  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1853  prophage LambdaSa2, protease, putative  26.62 
 
 
180 aa  48.1  0.0004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.812797  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0958  putative major phage head protein/prohead proteinase  23.9 
 
 
357 aa  47.8  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0701578 
 
 
-
 
NC_002978  WD0447  phage prohead protease  29.3 
 
 
177 aa  47.8  0.0005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0713063  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2175  putative phage prohead protease  28.47 
 
 
205 aa  46.6  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5466  hypothetical protein  27.41 
 
 
167 aa  46.6  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0240  putative major head protein/prohead protease  25.35 
 
 
469 aa  45.8  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2974  putative major phage head protein/prohead proteinase  24.2 
 
 
360 aa  46.2  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.594334  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1634  prohead peptidase  26.29 
 
 
183 aa  45.4  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.457432  normal  0.754513 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0648  prohead peptidase  28.23 
 
 
231 aa  45.8  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.857863  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3979  phage prohead protease, HK97 family  29.14 
 
 
165 aa  45.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0921  HK97 family phage prohead protease  29.25 
 
 
144 aa  44.3  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.340053 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2917  HK97 family phage prohead protease  28.93 
 
 
579 aa  44.3  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.595306  normal  0.164671 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3514  prohead peptidase  29.91 
 
 
526 aa  43.9  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3586  prohead peptidase  29.91 
 
 
526 aa  43.9  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.286744  normal  0.0669671 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2687  peptidase U35 phage prohead HK97  28.9 
 
 
409 aa  43.9  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3562  prohead peptidase  29.91 
 
 
526 aa  43.5  0.009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.530159 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>