138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA0151 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004311  BRA0151  flagellar basal body rod protein FlgB  100 
 
 
126 aa  260  4e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0135  flagellar basal body rod protein FlgB  99.21 
 
 
126 aa  258  1e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0263191  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4212  flagellar basal body rod protein FlgB  94.44 
 
 
126 aa  248  1e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1144  flagellar basal body rod protein FlgB  53.54 
 
 
128 aa  142  2e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1094  flagellar basal body rod protein FlgB  51.56 
 
 
125 aa  140  6e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.376721 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1692  flagellar basal body rod protein FlgB  53.54 
 
 
128 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.315615  normal  0.0176326 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3673  flagellar basal body rod protein FlgB  54.92 
 
 
127 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00533118 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0024  flagellar basal body rod protein FlgB  50 
 
 
126 aa  137  4.999999999999999e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0255  flagellar basal body rod protein FlgB  56.56 
 
 
126 aa  137  7e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0629  flagellar basal body rod protein FlgB  48 
 
 
129 aa  136  1e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.148561 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0618  flagellar basal body rod protein FlgB  48 
 
 
129 aa  136  1e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0896138  normal  0.0941281 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0317  flagellar basal body rod protein FlgB  52.8 
 
 
130 aa  130  7.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.763946  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0596  flagellar basal body rod protein FlgB  46.77 
 
 
129 aa  129  9e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.244257 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0298  flagellar basal body rod protein FlgB  50.78 
 
 
135 aa  125  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0349  flagellar basal body rod protein FlgB  48.8 
 
 
130 aa  124  6e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0740426 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3656  flagellar basal body rod protein FlgB  46.4 
 
 
126 aa  121  3e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.306825  normal  0.434285 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0735  flagellar basal body rod protein FlgB  45.26 
 
 
130 aa  114  3e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4524  flagellar basal body rod protein  65.96 
 
 
119 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.996777  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2235  flagellar basal body rod protein FlgB  39.05 
 
 
133 aa  63.9  0.0000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2110  flagellar basal body rod protein FlgB  38.14 
 
 
129 aa  63.5  0.0000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.132503 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3437  putative flagellar basal-body rod protein FlgB  29.41 
 
 
139 aa  58.5  0.00000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5155  flagellar basal body rod protein FlgB  33.33 
 
 
133 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.18507  normal  0.0554322 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5538  flagellar basal body rod protein FlgB  32.09 
 
 
134 aa  57  0.00000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.407776  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2570  flagellar basal-body rod protein FlgB  28.57 
 
 
142 aa  56.6  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.15376 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2831  flagellar basal body rod protein FlgB  29.79 
 
 
138 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0664971  normal  0.159517 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2608  flagellar basal body rod protein FlgB  29.08 
 
 
138 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0696754  normal  0.269497 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2000  flagellar basal body rod protein FlgB  31.03 
 
 
129 aa  55.5  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2318  flagellar basal body rod protein FlgB  30.83 
 
 
132 aa  52  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.361668 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2638  flagellar basal body rod protein FlgB  29.08 
 
 
138 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.164325  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4198  flagellar basal body rod protein FlgB  37.74 
 
 
117 aa  51.2  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1768  flagellar basal-body rod protein FlgB  37.5 
 
 
132 aa  51.6  0.000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.144654  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1978  flagellar basal-body rod protein FlgB  34.62 
 
 
139 aa  50.8  0.000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1587  flagellar basal body rod protein FlgB  30.43 
 
 
138 aa  50.4  0.000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1224  flagellar basal body rod protein FlgB  33.33 
 
 
130 aa  49.7  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1224  flagellar basal body rod protein FlgB  33.33 
 
 
130 aa  49.7  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1525  flagellar basal-body rod protein FlgB  30.09 
 
 
137 aa  50.1  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1637  flagellar basal-body rod protein FlgB  33.63 
 
 
133 aa  49.3  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2014  flagellar basal body rod protein FlgB  29.31 
 
 
138 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2965  flagellar basal body rod protein FlgB  25.64 
 
 
129 aa  49.3  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.157354 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2198  flagellar basal body rod protein FlgB  29.31 
 
 
138 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000944408 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2992  flagellar basal body rod protein FlgB  28.21 
 
 
127 aa  48.9  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1242  flagellar basal body rod protein FlgB  29.31 
 
 
138 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.217975 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1271  flagellar basal body rod protein FlgB  29.31 
 
 
138 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0101569 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1286  flagellar basal body rod protein FlgB  29.31 
 
 
138 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.468061  normal  0.0305834 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2826  flagellar basal-body rod protein FlgB  26.32 
 
 
152 aa  48.5  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2411  flagellar basal-body rod protein FlgB  32.71 
 
 
132 aa  48.5  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5497  flagellar basal body rod protein FlgB  31.67 
 
 
135 aa  48.5  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0469396  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1321  flagellar basal-body rod protein FlgB  27.91 
 
 
134 aa  47.8  0.00005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3100  flagellar basal-body rod protein FlgB  31.91 
 
 
133 aa  47.4  0.00006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0399315  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0685  flagellar basal-body rod protein FlgB  38.2 
 
 
134 aa  47.8  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1954  flagellar basal-body rod protein FlgB  29.2 
 
 
131 aa  47.4  0.00007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2573  flagellar basal-body rod protein FlgB  31.03 
 
 
138 aa  47  0.00009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.368531  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1331  flagellar basal body rod protein FlgB  28.7 
 
 
127 aa  47  0.00009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.754656  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1196  flagellar basal body rod protein FlgB  31.03 
 
 
138 aa  47  0.00009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1196  flagellar basal body rod protein FlgB  31.03 
 
 
138 aa  47  0.00009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2527  flagellar basal body rod protein FlgB  31.03 
 
 
138 aa  47  0.00009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.30096  normal  0.0169565 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2055  flagellar basal body rod protein FlgB  31.03 
 
 
138 aa  47  0.00009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.176072 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2252  flagellar basal body rod protein FlgB  31.03 
 
 
138 aa  47  0.00009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01069  flagellar basal-body rod protein B  31.03 
 
 
138 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01077  hypothetical protein  31.03 
 
 
138 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4122  flagellar basal-body rod protein FlgB  31.07 
 
 
133 aa  46.6  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.271092  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1303  flagellar basal body rod protein FlgB  28.03 
 
 
132 aa  46.6  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0266  flagellar basal-body rod protein FlgB  32.5 
 
 
137 aa  46.6  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3583  flagellar basal-body rod protein FlgB  31.33 
 
 
130 aa  46.6  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0676749  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4199  flagellar basal-body rod protein FlgB  31.9 
 
 
136 aa  46.6  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1553  flagellar basal-body rod protein FlgB  29.2 
 
 
139 aa  46.6  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.809609  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1452  flagellar basal body rod protein FlgB  31.03 
 
 
138 aa  47  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00156749 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3714  flagellar basal-body rod protein FlgB  27.66 
 
 
151 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.202019 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0768  flagellar basal-body rod protein FlgB  35.29 
 
 
132 aa  45.4  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00183103 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2324  flagellar basal body rod protein FlgB  29.17 
 
 
137 aa  45.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1998  flagellar basal body rod protein FlgB  29.17 
 
 
137 aa  45.8  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2425  flagellar basal body rod protein FlgB  29.17 
 
 
137 aa  45.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.395558  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4791  flagellar basal-body rod protein FlgB  27.66 
 
 
151 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.301769 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0300  flagellar basal body rod protein FlgB  25.86 
 
 
135 aa  45.4  0.0002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0749  flagellar basal-body rod protein FlgB  29.41 
 
 
135 aa  45.4  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1108  flagellar basal body rod protein FlgB  30.68 
 
 
130 aa  45.4  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00049744  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1776  flagellar basal-body rod protein FlgB  30 
 
 
132 aa  45.1  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1693  flagellar basal body rod protein FlgB  31.78 
 
 
136 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.235256  normal  0.633905 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1645  flagellar basal-body rod protein FlgB  29.25 
 
 
122 aa  45.4  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000413162  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0342  flagellar basal-body rod protein FlgB  30.77 
 
 
165 aa  44.7  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.395119  normal  0.980929 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1161  flagellar basal body rod protein FlgB  26.56 
 
 
132 aa  45.1  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4391  flagellar basal body rod protein FlgB  29.57 
 
 
136 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.117081  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3250  flagellar basal body rod protein FlgB  27.41 
 
 
134 aa  44.7  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1719  flagellar basal-body rod protein FlgB  31.31 
 
 
129 aa  44.7  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.292861 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1340  flagellar basal-body rod protein FlgB  36.26 
 
 
134 aa  44.3  0.0006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00164532  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2176  flagellar basal-body rod protein FlgB  29.09 
 
 
133 aa  43.9  0.0007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.873568  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1597  flagellar basal body rod protein FlgB  28.57 
 
 
132 aa  43.9  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1217  flagellar basal-body rod protein FlgB  29.06 
 
 
130 aa  43.9  0.0007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.284991  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1259  flagellar basal body rod protein FlgB  30.08 
 
 
135 aa  43.5  0.0009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1329  flagellar basal body rod protein FlgB  30.08 
 
 
135 aa  43.5  0.0009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1819  flagellar basal body rod protein FlgB  31.07 
 
 
135 aa  43.5  0.0009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4251  flagellar basal body rod protein FlgB  26.32 
 
 
135 aa  43.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.829711 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2600  flagellar basal body rod protein FlgB  26.4 
 
 
127 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000530741 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3247  flagellar basal body rod protein FlgB  27.27 
 
 
126 aa  43.5  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.896474  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3952  flagellar basal body rod protein FlgB  28.7 
 
 
136 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3732  flagellar basal body rod protein FlgB  29.57 
 
 
136 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.318315  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2054  flagellar basal-body rod protein FlgB  24.59 
 
 
137 aa  42.7  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3777  flagellar basal body rod protein FlgB  31.86 
 
 
145 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0109555  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1345  flagellar basal body rod protein FlgB  27.27 
 
 
132 aa  42.4  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2134  flagellar basal body protein-like protein  26.45 
 
 
126 aa  42.4  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>