39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR0106 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR0106  hypothetical protein  100 
 
 
272 aa  560  1e-158  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0103  hypothetical protein  99.24 
 
 
263 aa  536  1e-151  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0119  hypothetical protein  59.2 
 
 
277 aa  306  2.0000000000000002e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.420493  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2400  hypothetical protein  30.31 
 
 
255 aa  122  8e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.115236  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1895  hypothetical protein  30.31 
 
 
255 aa  122  8e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.845232  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2263  hypothetical protein  30.31 
 
 
255 aa  122  8e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.338192  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1688  hypothetical protein  30.31 
 
 
255 aa  122  8e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.330152  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0567  hypothetical protein  30.31 
 
 
255 aa  122  8e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.323416  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0733  hypothetical protein  30.31 
 
 
255 aa  122  8e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1685  hypothetical protein  30.31 
 
 
255 aa  122  8e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.730157  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0706  hypothetical protein  30.68 
 
 
255 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0146  lipoprotein transmembrane  31.9 
 
 
251 aa  104  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.207162  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0039  protein of unknown function DUF218  29.07 
 
 
251 aa  101  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0045  protein of unknown function DUF218  29.91 
 
 
266 aa  98.2  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.164009 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00180  transmembrane  31.22 
 
 
253 aa  95.5  7e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.384115  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4472  hypothetical protein  25.4 
 
 
263 aa  78.2  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.875685  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1189  hypothetical protein  25 
 
 
258 aa  76.6  0.0000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1765  hypothetical protein  25.29 
 
 
281 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.280276  normal  0.0749745 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2573  hypothetical protein  23.98 
 
 
301 aa  72  0.000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1908  hypothetical protein  28.66 
 
 
240 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.676098  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1731  hypothetical protein  28.66 
 
 
240 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.138234  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0183  hypothetical protein  28.66 
 
 
240 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00678491  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1516  hypothetical protein  28.66 
 
 
240 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.746081  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1753  hypothetical protein  28.66 
 
 
240 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245002  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1073  hypothetical protein  28.66 
 
 
240 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1739  hypothetical protein  23.79 
 
 
228 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1622  protein of unknown function DUF218  21.16 
 
 
262 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.278756 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1466  hypothetical protein  23.53 
 
 
260 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1490  hypothetical protein  25 
 
 
224 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1009  hypothetical protein  25 
 
 
224 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2830  putative lipoprotein transmembrane  23.43 
 
 
225 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.160067  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1372  hypothetical protein  23.16 
 
 
224 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.564686  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1412  hypothetical protein  23.16 
 
 
224 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4631  hypothetical protein  22.17 
 
 
224 aa  53.5  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.189106  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1322  hypothetical protein  23.21 
 
 
252 aa  50.1  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2202  hypothetical protein  25.1 
 
 
259 aa  45.4  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1256  hypothetical protein  36.11 
 
 
195 aa  44.3  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.202454  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4365  hypothetical protein  24.87 
 
 
210 aa  42.7  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.980357  hitchhiker  0.000669718 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4882  hypothetical protein  24.87 
 
 
219 aa  42.7  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000000206501 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>