More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1061 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_1061  LacI family response repressor  100 
 
 		 328 aa  663    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.023904  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2405  LacI family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 333 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.475476 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3464  LacI family transcription regulator  34.93 
 
 		 340 aa  161  2e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2169  transcriptional regulator, LacI family  32.83 
 
 		 337 aa  152  8e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5557  transcriptional regulator, LacI family  34.37 
 
 		 327 aa  151  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.687181  normal  0.634318 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10110  transcriptional regulator  32.01 
 
 		 342 aa  149  6e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.625648 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0414  regulatory protein LacI  35.51 
 
 		 333 aa  149  8e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.265718 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17790  transcriptional regulator  40.61 
 
 		 332 aa  145  8.000000000000001e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.255976  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1296  LacI family transcription regulator  31 
 
 		 334 aa  145  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2988  transcriptional regulator, LacI family  33.56 
 
 		 328 aa  143  4e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.922053  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1083  transcriptional regulator, LacI family  31.82 
 
 		 335 aa  142  9e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0310257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0384  regulatory protein LacI  32.23 
 
 		 339 aa  140  1.9999999999999998e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.899866  normal  0.153938 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13620  transcriptional regulator  39.38 
 
 		 333 aa  137  3.0000000000000003e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2612  transcriptional regulator, LacI family  30.09 
 
 		 342 aa  135  9e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.109106  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1322  transcriptional regulator, LacI family  37.5 
 
 		 336 aa  134  3e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1191  transcriptional regulator, LacI family  29.79 
 
 		 336 aa  134  3e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.218553  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4675  transcriptional regulator, LacI family  31.02 
 
 		 335 aa  132  9e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4934  transcriptional regulator, LacI family  28.79 
 
 		 336 aa  129  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.129155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1242  LacI family transcription regulator  40.32 
 
 		 340 aa  127  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1766  transcriptional regulator, LacI family  27.97 
 
 		 340 aa  125  1e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0293304  normal  0.0298236 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1317  transcriptional regulator, LacI family  31.63 
 
 		 353 aa  123  5e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1842  transcriptional regulator, LacI family  31.72 
 
 		 323 aa  119  6e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.312267  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01800  transcriptional regulator  27.69 
 
 		 341 aa  114  3e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0183  transcriptional regulator, LacI family  35.6 
 
 		 344 aa  113  4.0000000000000004e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2870  transcriptional regulator, LacI family  37.81 
 
 		 342 aa  102  7e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6905  transcriptional regulator, LacI family  35.33 
 
 		 334 aa  100  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00908765  hitchhiker  0.00367965 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4931  transcriptional regulator, LacI family  31.69 
 
 		 340 aa  100  4e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.699714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0582  alanine racemase  34.5 
 
 		 337 aa  99.4  7e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000548778  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01470  transcriptional regulator  36.7 
 
 		 351 aa  98.6  1e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4919  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.67 
 
 		 349 aa  98.6  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.35548 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0699  transcriptional regulator, LacI family  29.46 
 
 		 341 aa  97.4  3e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0909  LacI family transcription regulator  32.42 
 
 		 338 aa  96.3  7e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3594  transcriptional regulator, LacI family  32.96 
 
 		 339 aa  95.5  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2863  putative catabolite control protein A  33.33 
 
 		 332 aa  94.7  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.953072  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4925  transcriptional regulator, LacI family  25.81 
 
 		 358 aa  94.4  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.344925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2548  catabolite control protein A, putative  32.84 
 
 		 332 aa  93.6  4e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1515  transcriptional regulator, LacI family  29.73 
 
 		 339 aa  93.2  5e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2711  alanine racemase  28.19 
 
 		 342 aa  93.2  6e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000872573  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0419  transcriptional regulator, LacI family  29.41 
 
 		 334 aa  92.8  8e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0275  transcriptional regulator, LacI family  35.79 
 
 		 339 aa  92  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.555598 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4061  maltose operon transcriptional repressor  26.57 
 
 		 343 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000600  sucrose operon repressor ScrR LacI family  28.48 
 
 		 328 aa  91.3  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0144892  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3919  maltose operon transcriptional repressor  26.57 
 
 		 343 aa  90.5  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3751  maltose operon transcriptional repressor  26.57 
 
 		 343 aa  90.5  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3767  maltose operon transcriptional repressor  26.57 
 
 		 343 aa  90.9  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4134  maltose operon transcriptional repressor  26.57 
 
 		 340 aa  90.5  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4226  maltose operon transcriptional repressor  26.57 
 
 		 343 aa  90.5  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3601  transcriptional regulator, LacI family  30.94 
 
 		 358 aa  90.9  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0229751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4028  maltose operon transcriptional repressor  26.57 
 
 		 343 aa  90.5  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4575  catabolite control protein A  30.09 
 
 		 332 aa  89.7  5e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4929  catabolite control protein A  30.09 
 
 		 332 aa  89.7  5e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4811  catabolite control protein A  30.09 
 
 		 332 aa  89.7  5e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3342  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  30.09 
 
 		 332 aa  90.1  5e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000152618  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4790  catabolite control protein A  30.09 
 
 		 332 aa  89.7  5e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4410  catabolite control protein A  31.82 
 
 		 332 aa  89.7  6e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4427  catabolite control protein A  31.82 
 
 		 332 aa  89.7  6e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0544  LacI family transcription regulator  37.57 
 
 		 335 aa  89.7  6e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4795  catabolite control protein A  31.82 
 
 		 332 aa  89.7  6e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0449  catabolite control protein A  31.82 
 
 		 332 aa  89.7  6e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.486602 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1565  maltose operon transcriptional repressor  24.26 
 
 		 339 aa  89.7  7e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1596  maltose operon transcriptional repressor  24.26 
 
 		 339 aa  89.7  7e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4813  catabolite control protein A  30.09 
 
 		 332 aa  89.4  8e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1440  maltose operon repressor MalR, putative  34.18 
 
 		 342 aa  89  1e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0132709  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5075  transcriptional regulator, LacI family  34.41 
 
 		 350 aa  89  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0325  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.05 
 
 		 335 aa  89  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2733  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  32.61 
 
 		 331 aa  89  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0352  transcriptional regulator, LacI family  36.22 
 
 		 347 aa  87.8  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00162695  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6569  transcriptional regulator, LacI family  33.33 
 
 		 347 aa  88.2  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0434919  normal  0.571175 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16200  transcriptional regulator, LacI family  34.39 
 
 		 336 aa  87.4  3e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00346268  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4580  LacI family transcription regulator  33.16 
 
 		 351 aa  87.4  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000821982 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3838  LacI family transcription regulator  26.27 
 
 		 343 aa  87.4  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5204  LacI family transcription regulator  33.16 
 
 		 351 aa  87  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.210784  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3896  LacI family transcription regulator  31.75 
 
 		 339 aa  87  4e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5655  LacI family transcription regulator  33.16 
 
 		 351 aa  87  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.447148  normal  0.330046 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0457  transcriptional regulator, LacI family  35.48 
 
 		 353 aa  87  4e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532528  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6153  transcriptional regulator, LacI family  27.34 
 
 		 347 aa  87  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.312144  hitchhiker  0.000597888 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4116  maltose operon transcriptional repressor  26.27 
 
 		 340 aa  86.7  5e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.271073  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5484  LacI family transcription regulator  33.16 
 
 		 345 aa  86.7  6e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00238485 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3390  hypothetical protein  36.04 
 
 		 346 aa  86.7  6e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.305361  normal  0.967701 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0679  catabolite control protein  30.81 
 
 		 333 aa  86.3  6e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.641859  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4929  LacI family transcription regulator  33.16 
 
 		 346 aa  85.9  8e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.33528  normal  0.200034 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2204  transcriptional regulator, LacI family  30.32 
 
 		 337 aa  85.9  9e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0698  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  33.15 
 
 		 330 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1846  LacI family transcription regulator  32.66 
 
 		 324 aa  85.1  0.000000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1713  transcriptional regulator, LacI family  31.25 
 
 		 326 aa  84.3  0.000000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.117717  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3179  transcriptional regulator, LacI family  36.91 
 
 		 355 aa  84.3  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.588941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1123  maltose operon transcriptional repressor  25.97 
 
 		 343 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0409  transcriptional regulator, LacI family  34.9 
 
 		 342 aa  84.7  0.000000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.521683  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15580  transcriptional regulator, LacI family  29.8 
 
 		 336 aa  84.7  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2822  LacI family transcription regulator  34.38 
 
 		 352 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531617  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0967  LacI family transcription regulator  32.09 
 
 		 352 aa  85.1  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.934127 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0617  transcriptional regulator, LacI family  35.94 
 
 		 334 aa  84.7  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.699811  normal  0.372748 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4506  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  31.35 
 
 		 332 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0038285  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0838  LacI family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 331 aa  84  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.620074  normal  0.213955 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07200  transcriptional regulator  37.89 
 
 		 341 aa  83.6  0.000000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0947559  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0566  transcriptional regulator, LacI family  32.04 
 
 		 328 aa  83.6  0.000000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3333  transcriptional regulator, LacI family  34.97 
 
 		 329 aa  83.6  0.000000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1187  LacI family regulatory protein  33.85 
 
 		 384 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.34285  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1119  LacI family transcription regulator  32.98 
 
 		 347 aa  83.6  0.000000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00140598 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3199  LacI family transcription regulator  33.51 
 
 		 338 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.13351 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>