16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5725 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_5725  hypothetical protein  100 
 
 		 180 aa  358  2e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0156863  normal  0.729962 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5628  small permease component of tripartite tricarboxylate transporter (TctB)  38.41 
 
 		 179 aa  119  3e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0795679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0483  hypothetical protein  38.92 
 
 		 171 aa  116  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3050  small permease component of tripartite tricarboxylate transporter  43.37 
 
 		 196 aa  113  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0820746  normal  0.460517 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4225  hypothetical protein  34.36 
 
 		 166 aa  93.2  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.360299  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4492  hypothetical protein  35 
 
 		 199 aa  93.6  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.760748  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2796  hypothetical protein  32.73 
 
 		 173 aa  92  4e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.825323  normal  0.0868424 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2228  hypothetical protein  35.58 
 
 		 166 aa  91.3  6e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2025  hypothetical protein  35.48 
 
 		 165 aa  87.8  7e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0928756  normal  0.256497 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3082  hypothetical protein  42.86 
 
 		 176 aa  87.8  7e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.583252  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36150  hypothetical protein  40.34 
 
 		 176 aa  86.3  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000272635 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1852  hypothetical protein  34.57 
 
 		 165 aa  85.5  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.946732 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3429  hypothetical protein  34.84 
 
 		 165 aa  85.1  4e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0516258 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3099  hypothetical protein  32.52 
 
 		 166 aa  83.6  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0825077  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3635  hypothetical protein  27.81 
 
 		 163 aa  45.8  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6111  hypothetical protein  24.07 
 
 		 164 aa  42  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>