47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5102 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_5102  hypothetical protein  100 
 
 		 319 aa  641    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0461  aminoglycoside phosphotransferase  25.7 
 
 		 325 aa  76.3  0.0000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4279  aminoglycoside phosphotransferase  30.61 
 
 		 328 aa  69.7  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3302  aminoglycoside phosphotransferase  28.47 
 
 		 331 aa  68.9  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.595225 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1642  hypothetical protein  23.08 
 
 		 325 aa  68.2  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01400  phosphotransferase family protein  27.78 
 
 		 355 aa  64.7  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2765  aminoglycoside phosphotransferase  26.26 
 
 		 338 aa  64.7  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4532  aminoglycoside phosphotransferase  28.9 
 
 		 333 aa  63.5  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.464676  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2754  aminoglycoside phosphotransferase  30.77 
 
 		 320 aa  57.4  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1500  hypothetical protein  29.38 
 
 		 320 aa  57.8  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.584713  normal  0.46324 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3611  aminoglycoside phosphotransferase  32.54 
 
 		 294 aa  56.6  0.0000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2943  aminoglycoside phosphotransferase  24.86 
 
 		 346 aa  57  0.0000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2466  aminoglycoside phosphotransferase  24.91 
 
 		 338 aa  52.4  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2700  aminoglycoside phosphotransferase  28.06 
 
 		 315 aa  52  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5731  hypothetical protein  26.53 
 
 		 331 aa  51.6  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.716912  normal  0.682082 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1248  aminoglycoside phosphotransferase  26.62 
 
 		 354 aa  50.1  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.437649  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3733  hypothetical protein  29.77 
 
 		 331 aa  49.3  0.00009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.888327  normal  0.0105628 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1259  aminoglycoside phosphotransferase  28.08 
 
 		 359 aa  48.9  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0160608  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3559  aminoglycoside phosphotransferase  26.12 
 
 		 355 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.595969  normal  0.25426 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2104  aminoglycoside phosphotransferase  35.58 
 
 		 305 aa  48.5  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.714313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5432  aminoglycoside phosphotransferase  41.94 
 
 		 299 aa  47  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.583011 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3260  hypothetical protein  39.39 
 
 		 300 aa  47  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.913929  normal  0.957534 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1715  aminoglycoside phosphotransferase  39.24 
 
 		 298 aa  46.6  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.39264 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1393  aminoglycoside phosphotransferase  24.35 
 
 		 363 aa  46.6  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.330539 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0682  aminoglycoside phosphotransferase  35.37 
 
 		 260 aa  46.2  0.0006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0393  aminoglycoside phosphotransferase  44.26 
 
 		 301 aa  45.1  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.948995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2624  aminoglycoside phosphotransferase  37.31 
 
 		 319 aa  45.4  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000546322  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2318  aminoglycoside phosphotransferase  31.19 
 
 		 356 aa  45.8  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0370  aminoglycoside phosphotransferase  29.53 
 
 		 345 aa  45.1  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.380981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01062  aminoglycoside phosphotransferase  20.62 
 
 		 352 aa  43.9  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.533136  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1044  phosphotransferase enzyme family, putative  23.18 
 
 		 296 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.9915e-20 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2091  aminoglycoside phosphotransferase  41.18 
 
 		 308 aa  43.9  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.100856  normal  0.0330473 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1755  aminoglycoside phosphotransferase  41.18 
 
 		 307 aa  43.9  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2805  aminoglycoside phosphotransferase  24.02 
 
 		 345 aa  43.5  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.34105  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4380  aminoglycoside phosphotransferase  37.35 
 
 		 332 aa  43.9  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.113804 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0761  aminoglycoside phosphotransferase  26.22 
 
 		 327 aa  43.1  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0110589 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0284  putative aminoglycoside phosphotransferase  31.33 
 
 		 351 aa  43.1  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.846831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1839  hypothetical protein  31.11 
 
 		 263 aa  43.1  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1804  hypothetical protein  31.11 
 
 		 263 aa  43.1  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4129  aminoglycoside phosphotransferase  44.26 
 
 		 339 aa  43.1  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.753306  normal  0.346085 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1910  aminoglycoside phosphotransferase  26.69 
 
 		 355 aa  42.7  0.008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1860  aminoglycoside phosphotransferase  28.8 
 
 		 447 aa  42.7  0.008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.257775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1539  aminoglycoside phosphotransferase  41.18 
 
 		 303 aa  42.7  0.009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.791397  normal  0.0213289 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40880  hypothetical protein  26.11 
 
 		 356 aa  42.7  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1831  aminoglycoside phosphotransferase  33.33 
 
 		 353 aa  42.4  0.01  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0556162  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1324  aminoglycoside phosphotransferase  48.08 
 
 		 305 aa  42.4  0.01  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.547927  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3925  aminoglycoside phosphotransferase  26.69 
 
 		 355 aa  42.4  0.01  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.138496  normal  0.0994806 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>