73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0761 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_0761  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 
327 aa  648    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0110589 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1149  aminoglycoside phosphotransferase  29.49 
 
 
337 aa  66.6  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5980  aminoglycoside phosphotransferase  28.52 
 
 
353 aa  57.8  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.913808  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4584  aminoglycoside phosphotransferase  29.63 
 
 
475 aa  57.4  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2908  aminoglycoside phosphotransferase  29.69 
 
 
347 aa  54.7  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  0.1681 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1844  hypothetical protein  30.93 
 
 
339 aa  51.6  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00606035  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1097  aminoglycoside phosphotransferase  26.69 
 
 
348 aa  50.1  0.00006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.627512  normal  0.0663578 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3038  aminoglycoside phosphotransferase  45.45 
 
 
343 aa  49.7  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.145633  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3187  putative tyrosine protein kinase/aminoglycoside phosphotransferase  25.37 
 
 
368 aa  49.7  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2700  aminoglycoside phosphotransferase  27.04 
 
 
315 aa  49.7  0.00007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1388  aminoglycoside phosphotransferase  24.39 
 
 
411 aa  48.9  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.450425  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0649  aminoglycoside phosphotransferase  23.1 
 
 
356 aa  48.9  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0418435  normal  0.791945 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13550  aminoglycoside phosphotransferase  26.67 
 
 
312 aa  48.5  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.669259  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3460  aminoglycoside phosphotransferase  27.24 
 
 
344 aa  49.3  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.142226  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00272  Phosphotransferase enzyme family domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G02880)  24.74 
 
 
364 aa  47.8  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0403488 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1259  aminoglycoside phosphotransferase  29.18 
 
 
359 aa  48.5  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0160608  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2920  aminoglycoside phosphotransferase  27.46 
 
 
341 aa  47.8  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.252097 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0222  aminoglycoside phosphotransferase  30.6 
 
 
355 aa  48.5  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.193801  normal  0.0244768 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0011  aminoglycoside phosphotransferase  24.47 
 
 
337 aa  48.1  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.477677  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1108  aminoglycoside phosphotransferase  28.64 
 
 
362 aa  48.1  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0793428  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2483  aminoglycoside phosphotransferase  34.07 
 
 
323 aa  47.4  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0370489  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4407  aminoglycoside phosphotransferase  26.58 
 
 
340 aa  47.4  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.219591  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3214  aminoglycoside phosphotransferase  26.38 
 
 
355 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.457678 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1910  aminoglycoside phosphotransferase  26.78 
 
 
355 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107516  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2519  aminoglycoside phosphotransferase  30.73 
 
 
349 aa  47.8  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0177703  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16770  predicted aminoglycoside phosphotransferase  27.08 
 
 
338 aa  47.8  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18680  predicted aminoglycoside phosphotransferase  27.54 
 
 
357 aa  47.8  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.571289 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2629  aminoglycoside phosphotransferase  25.51 
 
 
368 aa  47  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0566206  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1393  aminoglycoside phosphotransferase  24.32 
 
 
363 aa  47.4  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.330539 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3748  aminoglycoside phosphotransferase  26.82 
 
 
350 aa  47  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1805  aminoglycoside phosphotransferase  27.06 
 
 
354 aa  47.4  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.726443  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1852  aminoglycoside phosphotransferase  27.06 
 
 
354 aa  47.4  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.906902  normal  0.283402 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7669  phosphotransferase family protein  29.44 
 
 
349 aa  47  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.799733  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6920  aminoglycoside phosphotransferase  30.69 
 
 
348 aa  47  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3559  aminoglycoside phosphotransferase  26.29 
 
 
355 aa  47  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.595969  normal  0.25426 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3809  aminoglycoside phosphotransferase  26.82 
 
 
350 aa  46.6  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.274581 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2450  aminoglycoside phosphotransferase  25 
 
 
343 aa  47  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3736  aminoglycoside phosphotransferase  26.82 
 
 
350 aa  46.6  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3925  aminoglycoside phosphotransferase  26.29 
 
 
355 aa  46.6  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.138496  normal  0.0994806 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4078  aminoglycoside phosphotransferase  28.69 
 
 
358 aa  46.6  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.694545  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4532  aminoglycoside phosphotransferase  25.82 
 
 
333 aa  46.6  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.464676  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2514  aminoglycoside phosphotransferase  39.18 
 
 
365 aa  46.2  0.0007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0250  aminoglycoside phosphotransferase  25.17 
 
 
330 aa  46.2  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5019  aminoglycoside phosphotransferase  43.66 
 
 
343 aa  46.2  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5841  aminoglycoside phosphotransferase  43.66 
 
 
343 aa  46.2  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40880  hypothetical protein  22.99 
 
 
356 aa  46.2  0.0008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4338  aminoglycoside phosphotransferase  45.07 
 
 
343 aa  45.8  0.0009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1368  aminoglycoside phosphotransferase  24.75 
 
 
368 aa  46.2  0.0009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.544786  hitchhiker  0.00183478 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1523  hypothetical protein  25.79 
 
 
302 aa  45.4  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.167835 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1786  aminoglycoside phosphotransferase  26.73 
 
 
354 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0286679  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5078  aminoglycoside phosphotransferase  43.21 
 
 
357 aa  45.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.114652  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5102  hypothetical protein  26.22 
 
 
319 aa  44.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2229  aminoglycoside phosphotransferase  29.65 
 
 
356 aa  44.7  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01062  aminoglycoside phosphotransferase  25.64 
 
 
352 aa  44.7  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.533136  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3218  aminoglycoside phosphotransferase  42.86 
 
 
343 aa  44.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.466338  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1912  aminoglycoside phosphotransferase  24.21 
 
 
363 aa  45.1  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.143156  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4201  aminoglycoside phosphotransferase  24.31 
 
 
343 aa  45.1  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0097  aminoglycoside phosphotransferase  24.22 
 
 
340 aa  43.9  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.92974  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3467  hypothetical protein  22.61 
 
 
356 aa  44.3  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.962273  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3286  aminoglycoside phosphotransferase  26.74 
 
 
361 aa  44.3  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.597573 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1003  aminoglycoside phosphotransferase  24.78 
 
 
291 aa  43.9  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2291  aminoglycoside phosphotransferase  29.32 
 
 
348 aa  43.9  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2075  aminoglycoside phosphotransferase  23.41 
 
 
355 aa  43.5  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0283964  normal  0.0813065 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2397  aminoglycoside phosphotransferase  26.5 
 
 
362 aa  43.5  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0626006  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2137  aminoglycoside phosphotransferase family protein  26.34 
 
 
293 aa  43.1  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2466  aminoglycoside phosphotransferase  23.83 
 
 
338 aa  42.7  0.007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1947  aminoglycoside phosphotransferase  26.98 
 
 
327 aa  43.1  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1563  aminoglycoside phosphotransferase  27.85 
 
 
354 aa  42.7  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.364356  normal  0.663698 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1901  aminoglycoside phosphotransferase  26.98 
 
 
327 aa  43.1  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.05669  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1478  aminoglycoside phosphotransferase  26.92 
 
 
353 aa  42.7  0.008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2064  aminoglycoside phosphotransferase  27.2 
 
 
361 aa  42.7  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.449993  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2028  aminoglycoside phosphotransferase  26.32 
 
 
350 aa  42.7  0.009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00704541  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0182  aminoglycoside phosphotransferase  26.29 
 
 
339 aa  42.4  0.01  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.55964 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>