41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4532 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_4532  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 
333 aa  659    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.464676  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3302  aminoglycoside phosphotransferase  47.74 
 
 
331 aa  236  6e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.595225 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0461  aminoglycoside phosphotransferase  29.88 
 
 
325 aa  144  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01400  phosphotransferase family protein  34.78 
 
 
355 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4279  aminoglycoside phosphotransferase  33.33 
 
 
328 aa  126  6e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1642  hypothetical protein  27.5 
 
 
325 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5731  hypothetical protein  26.8 
 
 
331 aa  95.5  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.716912  normal  0.682082 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5102  hypothetical protein  28.9 
 
 
319 aa  62.8  0.000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11253  conserved hypothetical protein  24.81 
 
 
323 aa  57.4  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.32435 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2112  aminoglycoside phosphotransferase  26.14 
 
 
353 aa  55.8  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2629  aminoglycoside phosphotransferase  26.2 
 
 
368 aa  50.8  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0566206  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4338  aminoglycoside phosphotransferase  28.15 
 
 
343 aa  49.3  0.00009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5078  aminoglycoside phosphotransferase  28.69 
 
 
357 aa  48.9  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.114652  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5841  aminoglycoside phosphotransferase  28.51 
 
 
343 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5019  aminoglycoside phosphotransferase  28.51 
 
 
343 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3187  putative tyrosine protein kinase/aminoglycoside phosphotransferase  26.07 
 
 
368 aa  48.5  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5274  aminoglycoside phosphotransferase  27.13 
 
 
343 aa  48.1  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1371  fructosamine kinase  23.51 
 
 
291 aa  47.4  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100074  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3218  aminoglycoside phosphotransferase  28.22 
 
 
343 aa  47.8  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.466338  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3710  aminoglycoside phosphotransferase  30.9 
 
 
333 aa  46.6  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.745243 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3604  aminoglycoside phosphotransferase  27.38 
 
 
331 aa  46.2  0.0007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.252193  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1532  fructosamine-3-kinase  23.18 
 
 
288 aa  46.6  0.0007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4452  aminoglycoside phosphotransferase  29.11 
 
 
346 aa  45.4  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.744873  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4461  aminoglycoside phosphotransferase  27.51 
 
 
298 aa  45.8  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4307  aminoglycoside phosphotransferase  26.17 
 
 
362 aa  45.4  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0855792  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0226  aminoglycoside phosphotransferase  29.2 
 
 
346 aa  45.4  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3327  aminoglycoside phosphotransferase  24.32 
 
 
361 aa  45.4  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.163531  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5681  aminoglycoside phosphotransferase  30.6 
 
 
306 aa  45.8  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01062  aminoglycoside phosphotransferase  26.67 
 
 
352 aa  45.1  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.533136  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0232  aminoglycoside phosphotransferase  29.2 
 
 
346 aa  45.1  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1314  phosphotransferase enzyme family protein  27.49 
 
 
368 aa  44.3  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1368  aminoglycoside phosphotransferase  24.9 
 
 
368 aa  43.9  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.544786  hitchhiker  0.00183478 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1944  aminoglycoside phosphotransferase  29.29 
 
 
361 aa  43.9  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3076  aminoglycoside phosphotransferase  25.74 
 
 
337 aa  43.5  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.422792  normal  0.609725 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1778  aminoglycoside phosphotransferase  29.29 
 
 
361 aa  43.5  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.221845  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2803  hypothetical protein  32.72 
 
 
219 aa  43.1  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.121298  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2913  aminoglycoside phosphotransferase  25 
 
 
325 aa  43.1  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.605881  normal  0.0304684 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0761  aminoglycoside phosphotransferase  25.82 
 
 
327 aa  43.1  0.007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0110589 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3665  aminoglycoside phosphotransferase  30.18 
 
 
267 aa  42.7  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0011  aminoglycoside phosphotransferase  26.26 
 
 
337 aa  42.7  0.008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.477677  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1912  aminoglycoside phosphotransferase  24.53 
 
 
363 aa  42.7  0.009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.143156  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>