29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_01400 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_01400  phosphotransferase family protein  100 
 
 		 355 aa  704    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3302  aminoglycoside phosphotransferase  40.07 
 
 		 331 aa  170  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.595225 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4532  aminoglycoside phosphotransferase  34.18 
 
 		 333 aa  131  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.464676  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0461  aminoglycoside phosphotransferase  29.26 
 
 		 325 aa  129  9.000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1642  hypothetical protein  27.97 
 
 		 325 aa  118  1.9999999999999998e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4279  aminoglycoside phosphotransferase  32.57 
 
 		 328 aa  97.8  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5731  hypothetical protein  35.68 
 
 		 331 aa  91.7  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.716912  normal  0.682082 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5102  hypothetical protein  27.92 
 
 		 319 aa  66.2  0.0000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1259  aminoglycoside phosphotransferase  27.21 
 
 		 359 aa  62  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0160608  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11253  conserved hypothetical protein  24.06 
 
 		 323 aa  59.7  0.00000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.32435 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2466  aminoglycoside phosphotransferase  27.14 
 
 		 338 aa  54.3  0.000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0779  aminoglycoside phosphotransferase  27.27 
 
 		 284 aa  53.1  0.000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.366594 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2803  hypothetical protein  30.22 
 
 		 219 aa  51.2  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.121298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2064  aminoglycoside phosphotransferase  27.92 
 
 		 361 aa  49.7  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.449993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16861  hypothetical protein  20.63 
 
 		 297 aa  48.9  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1431  fructosamine kinase  27.31 
 
 		 307 aa  48.1  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3665  aminoglycoside phosphotransferase  26.56 
 
 		 267 aa  46.6  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1385  hypothetical protein  23.4 
 
 		 288 aa  45.4  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0188597  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4482  aminoglycoside phosphotransferase  30.46 
 
 		 268 aa  45.1  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.399694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22921  hypothetical protein  25.2 
 
 		 287 aa  44.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1018  aminoglycoside phosphotransferase  25.59 
 
 		 358 aa  44.3  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4947  aminoglycoside phosphotransferase  30.46 
 
 		 268 aa  43.9  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.594703 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1532  fructosamine-3-kinase  22.16 
 
 		 288 aa  43.5  0.005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2913  aminoglycoside phosphotransferase  39.39 
 
 		 325 aa  43.5  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.605881  normal  0.0304684 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02239  hypothetical protein  24.48 
 
 		 288 aa  43.1  0.007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1097  aminoglycoside phosphotransferase  24.81 
 
 		 348 aa  43.1  0.007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.627512  normal  0.0663578 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2829  aminoglycoside phosphotransferase  30.08 
 
 		 306 aa  43.1  0.008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.077246  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2519  aminoglycoside phosphotransferase  26.97 
 
 		 349 aa  42.7  0.009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0177703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4998  aminoglycoside phosphotransferase  30 
 
 		 268 aa  42.7  0.01  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.101924  normal  0.36612 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>