35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4152 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_4152  hypothetical protein  100 
 
 		 258 aa  512  1e-144  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.154991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2846  invasion associated locus B  79.78 
 
 		 263 aa  296  2e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.798447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2942  Invasion associated locus B family protein  79.23 
 
 		 248 aa  290  2e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2614  invasion associated locus B  68.57 
 
 		 253 aa  289  3e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0807457  normal  0.637566 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1509  invasion associated locus B  65.46 
 
 		 244 aa  289  4e-77  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.138245  normal  0.0458793 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2049  invasion associated locus B  65.64 
 
 		 250 aa  287  1e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.49734  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2626  invasion associated locus B  78.14 
 
 		 262 aa  285  4e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.194034  decreased coverage  0.0000348412 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3828  Invasion associated locus B family protein  42.17 
 
 		 187 aa  138  8.999999999999999e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0423931 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2193  invasion associated locus B family protein  40.72 
 
 		 251 aa  135  9e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3575  Invasion associated locus B family protein  40 
 
 		 267 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0837139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3693  Invasion associated locus B family protein  38.73 
 
 		 267 aa  125  5e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.468736  normal  0.931761 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3384  invasion associated locus B family protein  38.73 
 
 		 267 aa  125  6e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.877703 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6313  invasion associated locus B family protein  44.64 
 
 		 253 aa  116  3e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00806169 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7180  Invasion associated locus B family protein  43.45 
 
 		 260 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.467749  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1657  invasion associated locus B family protein  38.95 
 
 		 257 aa  103  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0264072 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3868  invasion associated locus B family protein  34.12 
 
 		 267 aa  102  9e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0575  hypothetical protein  31.76 
 
 		 205 aa  93.2  3e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1396  invasion associated locus B family protein  30.57 
 
 		 209 aa  92.8  5e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.213972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0541  invasion associated locus B (IalB) protein  31.36 
 
 		 205 aa  91.3  1e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3637  invasion associated locus B family protein  31.36 
 
 		 205 aa  89.7  4e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1734  Invasion associated locus B family protein  32.16 
 
 		 221 aa  89.4  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.228228 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1918  Invasion associated locus B family protein  32.16 
 
 		 219 aa  88.2  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.308909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1698  invasion associated locus B  31.38 
 
 		 204 aa  85.9  6e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2372  hypothetical protein  29.24 
 
 		 211 aa  83.6  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.889914  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2525  invasion associated locus B  26 
 
 		 205 aa  71.6  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.91457 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0800  invasion associated locus B family protein  26.4 
 
 		 204 aa  65.9  0.0000000006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0471  hypothetical protein  23.91 
 
 		 208 aa  52  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.613905  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0466  hypothetical protein  23.91 
 
 		 198 aa  52  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1038  invasion associated locus B  24.53 
 
 		 242 aa  47.8  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0641  Invasion associated locus B family protein  24.48 
 
 		 213 aa  47  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.285928 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0517  invasion associated locus B family protein  26.57 
 
 		 176 aa  46.6  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1007  Invasion associated locus B family protein  34.43 
 
 		 176 aa  45.8  0.0006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0601  Invasion associated locus B family protein  24.7 
 
 		 213 aa  45.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0580  invasion associated locus B family protein  20.86 
 
 		 204 aa  44.7  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0898  Invasion associated locus B family protein  21.94 
 
 		 182 aa  42.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>