More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3478 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3478  putative oxidoreductase  100 
 
 		 323 aa  661    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.800614 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00764  putative oxidoreductase  43.34 
 
 		 331 aa  255  6e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.544939  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3382  aldo/keto reductase  31.8 
 
 		 340 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.159588  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3526  aldo/keto reductase  32.32 
 
 		 328 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3489  aldo/keto reductase  29.5 
 
 		 331 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0444  aldo/keto reductase  25.83 
 
 		 325 aa  109  7.000000000000001e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3036  aldo/keto reductase  29.01 
 
 		 328 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0625383  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0096  aldo/keto reductase  29.38 
 
 		 335 aa  108  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.69349  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2760  aldo/keto reductase  29.97 
 
 		 327 aa  107  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0256  aldo/keto reductase  30.63 
 
 		 328 aa  105  8e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.223996  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2171  aldo/keto reductase  29 
 
 		 324 aa  105  8e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3528  aldo/keto reductase  30.06 
 
 		 332 aa  103  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31770  putative oxidoreductase  31.38 
 
 		 331 aa  101  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0667  aldo/keto reductase  27.64 
 
 		 302 aa  100  2e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1378  aldo/keto reductase  31.63 
 
 		 331 aa  101  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0679596  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2331  aldo/keto reductase  29.57 
 
 		 329 aa  101  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.196419  normal  0.2019 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1255  aldo/keto reductase  28.48 
 
 		 327 aa  100  3e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1059  aldo/keto reductase  30.03 
 
 		 327 aa  100  3e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2904  aldo/keto reductase  31.33 
 
 		 331 aa  99.8  6e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.96128e-16 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4462  aldo/keto reductase  26.85 
 
 		 317 aa  99  9e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0315022  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2519  aldo/keto reductase  29 
 
 		 331 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.542493  normal  0.338127 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32530  Aldo/keto reductase protein  30.34 
 
 		 330 aa  98.6  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4538  aldo/keto reductase  29.41 
 
 		 331 aa  99  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.145809 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1958  aldo/keto reductase  30.09 
 
 		 326 aa  99  1e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0283  aldo/keto reductase  29.36 
 
 		 315 aa  99  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0613  aldo/keto reductase  30.94 
 
 		 328 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0221334 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6983  aldo/keto reductase  29.68 
 
 		 325 aa  97.8  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0500537  normal  0.645262 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0648  aldo/keto reductase  28.74 
 
 		 330 aa  98.2  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.153576 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0447  aldo/keto reductase  27.55 
 
 		 328 aa  97.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.227175 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2886  aldo/keto reductase  29.48 
 
 		 328 aa  97.8  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.253297  normal  0.167279 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0167  aldo/keto reductase  28.8 
 
 		 335 aa  97.4  3e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.691429  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4273  aldo/keto reductase  28.3 
 
 		 330 aa  97.4  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1802  aldo/keto reductase  26.98 
 
 		 372 aa  97.4  3e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.246141  normal  0.022853 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4022  aldo/keto reductase  28.83 
 
 		 331 aa  97.4  3e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1022  aldo/keto reductase  29.72 
 
 		 275 aa  97.4  3e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0527199  normal  0.490702 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3286  aldo/keto reductase  31.09 
 
 		 329 aa  97.4  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.186639  normal  0.885698 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2200  aldo/keto reductase  28.16 
 
 		 314 aa  97.1  4e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0154507  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3074  aldo/keto reductase  28.48 
 
 		 333 aa  97.1  4e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00558733  hitchhiker  0.00303424 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0155  aldo-keto reductase yakc (NADP+)  30.42 
 
 		 329 aa  97.1  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000886712  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0745  aldo/keto reductase  30.86 
 
 		 449 aa  96.7  5e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0779  aldo/keto reductase  28.27 
 
 		 326 aa  96.3  6e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0614  aldo/keto reductase  28.1 
 
 		 330 aa  96.3  6e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2047  aldo/keto reductase  29.48 
 
 		 329 aa  96.3  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.128714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0147  aldo-keto reductase YakC  30.42 
 
 		 329 aa  95.9  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1012  aldo/keto reductase  28.71 
 
 		 324 aa  96.3  7e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.613048 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2795  aldo/keto reductase  26.48 
 
 		 304 aa  95.1  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1172  aldo/keto reductase  30 
 
 		 331 aa  95.1  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0170373  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6147  aldo/keto reductase  28.71 
 
 		 325 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3544  aldo/keto reductase  28.78 
 
 		 326 aa  94.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.889794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2330  aldo/keto reductase  28.57 
 
 		 328 aa  94.4  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2287  aldo/keto reductase  28.99 
 
 		 330 aa  94.7  2e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000438369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3336  aldo/keto reductase  28.53 
 
 		 331 aa  94  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2293  oxidoreductase  30.09 
 
 		 360 aa  93.6  4e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0207177  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1975  aldo/keto reductase  28.4 
 
 		 332 aa  93.6  4e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3244  aldo/keto reductase  28.75 
 
 		 329 aa  94  4e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.667963  normal  0.407783 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6616  aldo/keto reductase  27.33 
 
 		 328 aa  93.2  5e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1282  aldo/keto reductase  28.94 
 
 		 352 aa  93.2  5e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0039468 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4829  aldo/keto reductase  28.44 
 
 		 328 aa  93.2  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1455  aldo/keto reductase  28.9 
 
 		 298 aa  93.2  6e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0402  aldo/keto reductase  29.23 
 
 		 335 aa  92.8  7e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0608954  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1517  aldo/keto reductase  29.83 
 
 		 325 aa  92.4  8e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.616958  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2791  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  27.33 
 
 		 331 aa  92  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.314524  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4374  aldo/keto reductase  29 
 
 		 334 aa  92  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.25984  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2991  aldo/keto reductase  26.76 
 
 		 325 aa  91.3  2e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7603  aldo/keto reductase  28.66 
 
 		 326 aa  91.7  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2804  aldo/keto reductase  29.36 
 
 		 315 aa  91.3  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2561  aldo/keto reductase  29.57 
 
 		 332 aa  91.3  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230023  normal  0.182857 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3444  aldo/keto reductase  27.11 
 
 		 331 aa  91.3  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0157  Aryl-alcohol dehydrogenase related enzyme  26.89 
 
 		 338 aa  91.7  2e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0831  aldo/keto reductase  27.49 
 
 		 330 aa  91.3  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3082  aldo/keto reductase  26.15 
 
 		 343 aa  90.9  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0228208  normal  0.204358 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0033  aldo/keto reductase  27.16 
 
 		 339 aa  90.5  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0042  aldo/keto reductase  27.16 
 
 		 339 aa  90.5  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00274786 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2271  aldo/keto reductase  28.83 
 
 		 329 aa  90.9  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0397783  normal  0.307626 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0023  aldo/keto reductase  27.16 
 
 		 339 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3835  aldo/keto reductase  27.98 
 
 		 326 aa  90.9  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.256524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4229  lolS protein  26.35 
 
 		 304 aa  90.5  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.155602  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3432  aldo/keto reductase  29.63 
 
 		 328 aa  90.1  4e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.237598  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0153  aldo-keto reductase  26.44 
 
 		 333 aa  90.1  4e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2442  aldo/keto reductase  27.36 
 
 		 309 aa  90.1  5e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38050  Aldo/keto reductase  27.95 
 
 		 401 aa  90.1  5e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0958  aldo/keto reductase  26.59 
 
 		 331 aa  90.1  5e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.420577  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38040  Aldo/keto reductase  27.13 
 
 		 329 aa  89.7  5e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02910  aryl-alcohol dehydrogenase, putative  25.29 
 
 		 357 aa  89.7  6e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.345326  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1031  lolS protein  28.28 
 
 		 304 aa  89.7  6e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2612  aldo/keto reductase  28.22 
 
 		 328 aa  89.4  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3126  aldo/keto reductase family oxidoreductase  28.88 
 
 		 334 aa  89.4  8e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6241  aldo/keto reductase  28.48 
 
 		 327 aa  89.4  8e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2444  aldo/keto reductase  28.52 
 
 		 331 aa  89.4  8e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.959905  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4165  lolS protein  26.32 
 
 		 304 aa  89  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4005  lolS protein  27.24 
 
 		 304 aa  89  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.149867  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3838  aldo/keto reductase family oxidoreductase  27.24 
 
 		 304 aa  89  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl252  putative aldo/keto reductase  26.07 
 
 		 328 aa  89  1e-16  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00286495  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4318  oxidoreductase  27.24 
 
 		 304 aa  89  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1866  aldo/keto reductase  25.62 
 
 		 311 aa  89  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5029  aldo/keto reductase  29.87 
 
 		 330 aa  89  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4120  lolS protein  27.24 
 
 		 304 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000109156 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5308  aldo/keto reductase  29.97 
 
 		 327 aa  89  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6900  aldo/keto reductase  29.17 
 
 		 338 aa  89  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0960645  normal  0.0649561 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3927  aldo/keto reductase  25.97 
 
 		 304 aa  87.8  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.185405  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>