14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3106 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3106  peptidoglycan binding domain-containing protein  100 
 
 		 159 aa  315  2e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4352  hypothetical protein  45.37 
 
 		 486 aa  94.7  5e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4354  hypothetical protein  44.55 
 
 		 477 aa  90.1  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4743  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.22 
 
 		 573 aa  57.8  0.00000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.258371  normal  0.341295 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4612  peptidoglycan binding domain-containing protein  43.28 
 
 		 244 aa  51.2  0.000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3999  peptidoglycan binding domain-containing protein  42.86 
 
 		 568 aa  48.1  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.121283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8552  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.47 
 
 		 587 aa  48.5  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2405  hypothetical protein  36.05 
 
 		 576 aa  48.1  0.00005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0566608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2313  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.69 
 
 		 596 aa  47  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0641  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.9 
 
 		 589 aa  42.4  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.757288 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0504  peptidoglycan binding domain-containing protein  40.68 
 
 		 593 aa  41.6  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1864  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  51.02 
 
 		 370 aa  41.6  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.498098 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0912  periplasmic protease  30.26 
 
 		 482 aa  40.8  0.008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00173688 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0032  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  32.26 
 
 		 323 aa  40.4  0.009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>