25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3999 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_3999  peptidoglycan binding domain-containing protein  100 
 
 		 568 aa  1110    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.121283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4743  peptidoglycan binding domain-containing protein  40.32 
 
 		 573 aa  131  3e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.258371  normal  0.341295 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4612  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.17 
 
 		 244 aa  79  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4352  hypothetical protein  24.09 
 
 		 486 aa  74.3  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4354  hypothetical protein  29.77 
 
 		 477 aa  65.5  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0925  peptidoglycan binding domain-containing protein  49.02 
 
 		 327 aa  51.2  0.00005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2313  peptidoglycan binding domain-containing protein  42.37 
 
 		 596 aa  51.2  0.00005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1653  lytic murein transglycosylase  50 
 
 		 424 aa  50.1  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.725775 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1125  membrane bound lytic murein transglycosylase B  39.68 
 
 		 417 aa  49.3  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.170659  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2786  lytic murein transglycosylase  39.68 
 
 		 419 aa  48.5  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.245296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3106  peptidoglycan binding domain-containing protein  42.86 
 
 		 159 aa  47.8  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2405  hypothetical protein  43.14 
 
 		 576 aa  47.8  0.0005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0566608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4719  putative adenylate/guanylate cyclase  32.18 
 
 		 312 aa  47.8  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.742577 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4194  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.67 
 
 		 528 aa  47.8  0.0006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1011  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  23.51 
 
 		 718 aa  47.8  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.114785 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0051  lytic murein transglycosylase  40.68 
 
 		 421 aa  47.4  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0167  lytic murein transglycosylase  42 
 
 		 445 aa  46.2  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000010193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0899  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.19 
 
 		 713 aa  46.6  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.935654  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2998  carboxyl-terminal protease  40.35 
 
 		 480 aa  45.8  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000384491  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0641  peptidoglycan binding domain-containing protein  40 
 
 		 589 aa  45.1  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.757288 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1972  lytic murein transglycosylase  34.52 
 
 		 486 aa  45.1  0.004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000382948  normal  0.768189 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1246  peptidoglycan binding domain-containing protein  47.83 
 
 		 508 aa  44.7  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0662  lytic murein transglycosylase  42 
 
 		 433 aa  44.3  0.006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00608172  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1709  spore cortex-lytic enzyme  40.74 
 
 		 267 aa  44.3  0.006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.233149  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0025  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.62 
 
 		 1261 aa  43.5  0.01  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.861527  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>