233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1028 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1028  putative capsule polysaccharide export outer membrane protein  100 
 
 		 440 aa  887    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.220124  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3782  polysaccharide export protein  81.84 
 
 		 402 aa  679    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3057  polysaccharide export protein  45.3 
 
 		 440 aa  321  9.999999999999999e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.521526  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0093  polysaccharide export protein  43.08 
 
 		 410 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.249835 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1033  polysaccharide export protein  43.92 
 
 		 400 aa  299  6e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3232  polysaccharide export protein  37.53 
 
 		 422 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3781  polysaccharide export protein  41.4 
 
 		 396 aa  285  1.0000000000000001e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.543784  normal  0.42896 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2984  polysaccharide export protein  37.53 
 
 		 403 aa  284  3.0000000000000004e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.182191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2714  polysaccharide export protein  36.62 
 
 		 393 aa  242  1e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7135  polysaccharide export protein  38.13 
 
 		 389 aa  238  1e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2463  polysaccharide export protein  37.47 
 
 		 390 aa  237  3e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.118558 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3770  polysaccharide export protein  36.68 
 
 		 388 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.951102 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6357  polysaccharide export protein  37.77 
 
 		 389 aa  236  8e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.168651 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3767  polysaccharide export protein  36.81 
 
 		 419 aa  234  3e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.607345 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3660  polysaccharide export protein  37 
 
 		 388 aa  233  5e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.208413 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3820  polysaccharide export protein  37.77 
 
 		 404 aa  233  6e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.388057  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2758  polysaccharide export protein  36.41 
 
 		 390 aa  227  3e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.261698 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2535  polysaccharide export protein  36.86 
 
 		 417 aa  227  3e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3462  polysaccharide export protein  36.15 
 
 		 388 aa  226  8e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.775015  normal  0.722378 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0950  polysaccharide export protein  37.17 
 
 		 394 aa  224  2e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1938  polysaccharide export protein  36.06 
 
 		 410 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.231854  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0324  polysaccharide export protein  36.06 
 
 		 410 aa  218  1e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1327  WcbC  36.3 
 
 		 422 aa  208  1e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0740  polysaccharide export protein  35.05 
 
 		 379 aa  206  5e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1078  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  35.71 
 
 		 378 aa  202  7e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.273848  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2307  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  35.71 
 
 		 387 aa  202  8e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3301  WcbC  35.71 
 
 		 387 aa  202  8e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0776528  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0521  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  35.71 
 
 		 373 aa  202  8e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.21613  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3254  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  35.71 
 
 		 387 aa  202  8e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3289  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  35.71 
 
 		 373 aa  202  8e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2185  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  35.71 
 
 		 387 aa  202  8e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3859  polysaccharide export protein  39.41 
 
 		 398 aa  197  3e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.329436 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5948  exopolysaccharide export protein  34.29 
 
 		 406 aa  196  5.000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0287  polysaccharide export protein  33.76 
 
 		 409 aa  195  1e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0771  polysaccharide export protein  33.76 
 
 		 409 aa  195  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1161  polysaccharide export protein  33.83 
 
 		 388 aa  192  1e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0571636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0753  polysaccharide export protein  36.18 
 
 		 392 aa  186  7e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2347  polysaccharide export protein  32.96 
 
 		 363 aa  183  6e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1533  polysaccharide export protein  33.51 
 
 		 397 aa  182  1e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1486  polysaccharide export protein  37.58 
 
 		 408 aa  179  5.999999999999999e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.721781  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2754  polysaccharide export protein  34.95 
 
 		 391 aa  178  1e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.982682  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0198  polysaccharide export protein  32.56 
 
 		 395 aa  178  2e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6038  polysaccharide export protein  32.73 
 
 		 380 aa  177  3e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2589  polysaccharide export protein  31.46 
 
 		 397 aa  171  2e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2975  capsule polysaccharide export protein, BexD/CtrA/VexA family  31.91 
 
 		 390 aa  168  1e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2079  polysaccharide export protein  34.15 
 
 		 394 aa  159  8e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.238275 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0664  polysaccharide export protein  32.28 
 
 		 386 aa  158  2e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0130788  normal  0.0340972 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0728  polysaccharide export protein  30.27 
 
 		 406 aa  154  2e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0592295  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1559  polysaccharide export protein  32.68 
 
 		 392 aa  141  1.9999999999999998e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.053083  normal  0.0507525 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3494  polysaccharide export protein  29.21 
 
 		 387 aa  137  4e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3037  polysaccharide export protein  31.63 
 
 		 365 aa  135  9.999999999999999e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0416  polysaccharide export protein  33.58 
 
 		 377 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.482624  normal  0.901304 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3419  polysaccharide export protein  31.27 
 
 		 384 aa  133  6.999999999999999e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0961152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2133  polysaccharide export protein  31.85 
 
 		 375 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0759  putative capsule polysaccharide exporter  33.33 
 
 		 378 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2418  polysaccharide export protein  33.33 
 
 		 378 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.160125 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2254  putative polysaccharide export protein  30.6 
 
 		 385 aa  124  3e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.732758 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2257  putative outer membrane polysaccharide exporter  27.06 
 
 		 384 aa  119  9e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6022  polysaccharide export protein  29.34 
 
 		 384 aa  118  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.113173  normal  0.244063 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6173  polysaccharide export protein  28 
 
 		 391 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.371162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2193  polysaccharide biosynthesis/export protein  27.03 
 
 		 378 aa  116  7.999999999999999e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000597973  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4409  polysaccharide export protein  28.17 
 
 		 398 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7400  polysaccharide export protein  28.32 
 
 		 391 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.471372 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5905  polysaccharide export protein  27.25 
 
 		 385 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.438446  normal  0.224196 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4241  polysaccharide export protein  28.48 
 
 		 417 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.238114 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0509  putative polysaccharide export, outer membrane protein, epsA  28.85 
 
 		 350 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3692  polysaccharide export protein  28.98 
 
 		 348 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.427794  normal  0.965292 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4055  polysaccharide export protein  28.57 
 
 		 390 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3905  polysaccharide export protein  28.83 
 
 		 354 aa  111  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.132595 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2717  polysaccharide export protein  26.77 
 
 		 379 aa  110  7.000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.335454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1352  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  27.73 
 
 		 396 aa  109  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2894  polysaccharide export protein  27.39 
 
 		 377 aa  108  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0993342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2613  polysaccharide export protein  26.6 
 
 		 379 aa  108  1e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.139508 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3274  polysaccharide biosynthesis/export protein  29.62 
 
 		 446 aa  108  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3222  polysaccharide biosynthesis/export protein  29.62 
 
 		 400 aa  108  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00986  predicted exopolysaccharide export protein  26.6 
 
 		 379 aa  107  3e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2660  polysaccharide export protein  26.6 
 
 		 379 aa  107  3e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1219  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  26.6 
 
 		 379 aa  107  3e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1099  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  26.6 
 
 		 386 aa  107  3e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0031657  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00993  hypothetical protein  26.6 
 
 		 379 aa  107  3e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3260  polysaccharide biosynthesis/export protein  29.62 
 
 		 422 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.14085  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2332  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  26.6 
 
 		 386 aa  107  4e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.132677  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1092  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  26.26 
 
 		 386 aa  107  5e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3278  polysaccharide export protein  28.52 
 
 		 390 aa  107  6e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.828407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2609  polysaccharide export protein  29.21 
 
 		 376 aa  106  7e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0915  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  30.51 
 
 		 396 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.138032  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2620  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  30.51 
 
 		 391 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2482  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  30.51 
 
 		 391 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.153813  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3319  polysaccharide export protein  28.15 
 
 		 383 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00116836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4169  polysaccharide export protein  28.15 
 
 		 423 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.95415  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4197  polysaccharide export protein  28.15 
 
 		 423 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.937901 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1060  polysaccharide export protein  29.13 
 
 		 393 aa  104  4e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0546  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  30.15 
 
 		 396 aa  104  4e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0819  polysaccharide export protein  24.25 
 
 		 379 aa  103  4e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1728  putative capsular polysaccharide transport outermembrane protein  27.55 
 
 		 352 aa  103  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0503982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1088  polysaccharide export protein  27.78 
 
 		 348 aa  104  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000453729  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1296  polysaccharide export protein  25.55 
 
 		 378 aa  103  7e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.660258  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3036  polysaccharide export protein  26.01 
 
 		 378 aa  101  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1579  polysaccharide export protein  27.99 
 
 		 379 aa  100  4e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.479279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2355  polysaccharide biosynthesis/export protein  27.99 
 
 		 379 aa  100  4e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>