41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0482 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_0482  putative transposase  100 
 
 		 31 aa  62.8  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.775995  normal  0.273328 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0041  IS629, transposase orfB  64.52 
 
 		 295 aa  43.5  0.0009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2513  Integrase catalytic region  83.33 
 
 		 301 aa  41.6  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.298059 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1753  Integrase catalytic region  83.33 
 
 		 301 aa  41.6  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.289897  normal  0.869594 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1663  Integrase catalytic region  83.33 
 
 		 301 aa  41.6  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1597  Integrase catalytic region  83.33 
 
 		 301 aa  41.6  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.369801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2680  IS629, transposase orfB  61.29 
 
 		 295 aa  41.2  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00648038  normal  0.0200158 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1379  IS629, transposase orfB  61.29 
 
 		 295 aa  41.2  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.822294  normal  0.0945096 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1303  IS629, transposase orfB  61.29 
 
 		 295 aa  41.2  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0102  IS629, transposase orfB  61.29 
 
 		 295 aa  41.2  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.147873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2258  IS629 transposase orfB  61.29 
 
 		 296 aa  40.8  0.007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0297  IS629 transposase orfB  61.29 
 
 		 296 aa  40.8  0.007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000478745  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0221  IS629 transposase orfB  61.29 
 
 		 296 aa  40.8  0.007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1240  IS1203 transposase orfB  61.29 
 
 		 296 aa  40.8  0.007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.605  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1664  IS1203 transposase orfB  61.29 
 
 		 296 aa  40.8  0.007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0208  IS629 transposase orfB  61.29 
 
 		 296 aa  40.4  0.007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2286  IS629, transposase orfB  61.29 
 
 		 296 aa  40.4  0.008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.292769  hitchhiker  5.1383e-16 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0988  IS629 transposase orfB  61.29 
 
 		 296 aa  40.4  0.008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4591  IS629, transposase orfB  61.29 
 
 		 296 aa  40.4  0.008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.987029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3874  IS629, transposase orfB  61.29 
 
 		 296 aa  40.4  0.008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.816642 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3516  IS629, transposase orfB  61.29 
 
 		 296 aa  40.4  0.008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0367503 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3386  IS629, transposase orfB  61.29 
 
 		 296 aa  40.4  0.008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3232  IS629, transposase orfB  61.29 
 
 		 296 aa  40.4  0.008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.312429  hitchhiker  0.000944743 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2932  IS629, transposase orfB  61.29 
 
 		 296 aa  40.4  0.008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.529947  hitchhiker  0.00000000000000217145 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2843  IS629, transposase orfB  61.29 
 
 		 296 aa  40.4  0.008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.69714 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2789  IS629, transposase orfB  61.29 
 
 		 296 aa  40.4  0.008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.194228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1592  IS629 transposase orfB  61.29 
 
 		 296 aa  40.4  0.008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1657  IS629, transposase orfB  61.29 
 
 		 296 aa  40.4  0.008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000216946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1924  IS629 transposase orfB  61.29 
 
 		 296 aa  40.4  0.008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.454462  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1178  IS629, transposase orfB  61.29 
 
 		 296 aa  40.4  0.008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1170  IS629, transposase orfB  61.29 
 
 		 296 aa  40.4  0.008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.728097  normal  0.563398 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0291  IS629, transposase orfB  61.29 
 
 		 296 aa  40.4  0.008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.638063 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4642  IS629 transposase orfB  61.29 
 
 		 296 aa  40.4  0.008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.835933  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4763  IS1203 transposase orfB  61.29 
 
 		 296 aa  40.4  0.008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4791  IS1203 transposase orfB  61.29 
 
 		 296 aa  40.4  0.008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.2388 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0134  IS629 transposase orfB  61.29 
 
 		 296 aa  40.4  0.008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0247  IS629 transposase orfB  61.29 
 
 		 296 aa  40.4  0.008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.45525  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4771  IS1203 transposase orfB  61.29 
 
 		 296 aa  40.4  0.008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.220432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2492  IS629, transposase orfB  58.06 
 
 		 295 aa  40.4  0.009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0035  IS629, transposase orfB  58.06 
 
 		 295 aa  40  0.009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0231  IS1203 transposase orfB  61.29 
 
 		 296 aa  40  0.009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0117658  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>