31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_32810 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_32810  metal-binding protein  100 
 
 
195 aa  387  1e-107  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.225261  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3889  hypothetical protein  82.56 
 
 
195 aa  326  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.370714  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45840  hypothetical protein  82.05 
 
 
195 aa  324  6e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1467  YgfB and YecA  78.76 
 
 
195 aa  311  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.383043 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1811  yecA family protein  85.49 
 
 
195 aa  311  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3806  yecA family protein  79.27 
 
 
195 aa  309  2e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.222083  hitchhiker  0.00000393308 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4023  yecA family protein  79.79 
 
 
195 aa  308  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0158141 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4517  hypothetical protein  78.76 
 
 
195 aa  305  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.301076  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1394  yecA family protein  78.76 
 
 
195 aa  305  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3739  hypothetical protein  79.27 
 
 
195 aa  286  1e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.144928  normal  0.012413 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1643  hypothetical protein  79.79 
 
 
195 aa  285  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.646938  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2227  yecA family protein  41.36 
 
 
214 aa  147  1.0000000000000001e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.802171  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0863  YgfB and YecA  41.21 
 
 
236 aa  132  3e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1854  hypothetical protein  33.92 
 
 
185 aa  79.7  0.00000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.988982 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1877  yecA family protein  32.79 
 
 
180 aa  79.3  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2143  YgfB and YecA  33.52 
 
 
185 aa  78.2  0.00000000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2181  hypothetical protein  34.39 
 
 
183 aa  75.1  0.0000000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1894  YgfB and YecA  28.33 
 
 
432 aa  60.5  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00737905  normal  0.979127 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0113  yecA family protein  29.03 
 
 
198 aa  59.3  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000620345  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4194  yecA family protein  28.18 
 
 
221 aa  50.8  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000432994 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0914  yecA family protein  24.87 
 
 
198 aa  50.4  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1273  yecA family protein  28.57 
 
 
204 aa  50.4  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0788  yecA family protein  27.12 
 
 
189 aa  47.4  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1156  yecA family protein  28.83 
 
 
201 aa  47.8  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.324064 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0645  YecA family protein  26.4 
 
 
146 aa  47.8  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.663243  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5791  yecA family protein  27.52 
 
 
236 aa  46.6  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0115  yecA family protein  28.83 
 
 
225 aa  46.2  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.410021  hitchhiker  0.00793411 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2940  yecA family protein  28.33 
 
 
232 aa  44.7  0.0009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.188532  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2706  yecA family protein  28.33 
 
 
232 aa  44.7  0.0009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.179188  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2102  yecA family protein  26.88 
 
 
196 aa  43.9  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0060  yecA family protein  26.67 
 
 
237 aa  42  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>