12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_19370 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_19370  hypothetical protein  100 
 
 		 172 aa  342  2e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50930  hypothetical protein  40.54 
 
 		 186 aa  100  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000416549 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4129  hypothetical protein  35.71 
 
 		 183 aa  97.8  6e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3865  hypothetical protein  37.84 
 
 		 183 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.471102 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1418  hypothetical protein  39.34 
 
 		 184 aa  95.9  3e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.119631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4344  hypothetical protein  36.61 
 
 		 184 aa  80.9  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3365  hypothetical protein  35.21 
 
 		 249 aa  56.2  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0902126 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3937  hypothetical protein  43.08 
 
 		 318 aa  50.8  0.000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08450  hypothetical protein  41.18 
 
 		 360 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000918861 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0800  hypothetical protein  38.75 
 
 		 355 aa  44.7  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5105  hypothetical protein  38.57 
 
 		 316 aa  43.9  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.697261  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0602  hypothetical protein  31.78 
 
 		 310 aa  43.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>