25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_7463 on replicon NC_011981
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011981  Avi_7463    100 
 
 		 1539 bp  3051    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4798  integrase catalytic region  95 
 
 		 1539 bp  2440    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.285753  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0339  integrase catalytic subunit  79.43 
 
 		 1548 bp  198  3e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.389244 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5143  integrase catalytic subunit  79.56 
 
 		 1539 bp  196  1e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.1652 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3440  integrase catalytic region  85.26 
 
 		 1602 bp  127  9.999999999999999e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.623196  normal  0.257291 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3050  integrase catalytic subunit  84.52 
 
 		 1539 bp  117  1.0000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.985644 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4274    78.54 
 
 		 1540 bp  115  4.0000000000000004e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1742    78.21 
 
 		 1556 bp  111  6e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.812145 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1750  integrase catalytic subunit  82.46 
 
 		 1389 bp  101  6e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4829    84.03 
 
 		 489 bp  85.7  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.271386  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2672  integrase catalytic region  79.9 
 
 		 1539 bp  75.8  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.226674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2991  integrase catalytic subunit  79.9 
 
 		 1539 bp  75.8  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6811    84.09 
 
 		 2852 bp  63.9  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7482  integrase catalytic region  80 
 
 		 576 bp  61.9  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5652  integrase catalytic region  85.71 
 
 		 1539 bp  60  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5758  integrase catalytic region  85.71 
 
 		 1539 bp  60  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1110  integrase catalytic region  85.71 
 
 		 1539 bp  60  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4442  integrase catalytic region  85.71 
 
 		 1539 bp  60  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0181  Integrase catalytic region  83.72 
 
 		 1158 bp  60  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0997  transposase  84.72 
 
 		 1569 bp  56  0.00003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0170218  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1807  transposase  84.72 
 
 		 1284 bp  56  0.00003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.411969  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5960    84.29 
 
 		 389 bp  52  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0590322  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1532  integrase catalytic subunit  86.79 
 
 		 1518 bp  50.1  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1529  integrase catalytic subunit  86.79 
 
 		 1518 bp  50.1  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.544255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1714  putative transposase  100 
 
 		 1542 bp  50.1  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>