278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_7267 on replicon NC_011981
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011981  Avi_7267  allantoate amidohydrolase  100 
 
 		 411 aa  840    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2595  allantoate amidohydrolase  74.94 
 
 		 428 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.40387  normal  0.398812 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4007  allantoate amidohydrolase  71.6 
 
 		 430 aa  595  1e-169  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4047  allantoate amidohydrolase  70.86 
 
 		 433 aa  587  1e-166  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.152103  normal  0.439433 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3752  allantoate amidohydrolase  70.62 
 
 		 441 aa  580  1e-164  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.23358 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0104  allantoate amidohydrolase  50.76 
 
 		 424 aa  389  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0189735 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1455  allantoate amidohydrolase  51.01 
 
 		 424 aa  379  1e-104  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3190  peptidase, M20/M25/M40 family  42.64 
 
 		 426 aa  294  2e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3056  allantoate amidohydrolase  41.62 
 
 		 426 aa  291  1e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.123515  normal  0.691703 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0043  allantoate amidohydrolase  41.01 
 
 		 430 aa  274  3e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1015  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  39.5 
 
 		 433 aa  264  2e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.736306 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2555  amidase  37.12 
 
 		 408 aa  237  3e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3946  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  34.72 
 
 		 421 aa  231  2e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.781731  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6028  N-carbamoyl-L-amino acid hydrolase  36.06 
 
 		 424 aa  228  2e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1293  amidase  35.23 
 
 		 411 aa  223  4e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.569361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3949  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  34.17 
 
 		 407 aa  223  4.9999999999999996e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.193056  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2881  allantoate amidohydrolase  34.01 
 
 		 416 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.138552 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1455  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  34.97 
 
 		 430 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.597555 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1945  allantoate amidohydrolase  33 
 
 		 416 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5349  allantoate amidohydrolase  34.16 
 
 		 426 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.223299 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7813  allantoate amidohydrolase  35.09 
 
 		 415 aa  219  6e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1247  amidase  35.17 
 
 		 408 aa  219  7.999999999999999e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3439  allantoate amidohydrolase  35.22 
 
 		 427 aa  218  1e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0973396  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4269  allantoate amidohydrolase  35.37 
 
 		 418 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4097  allantoate amidohydrolase  35.37 
 
 		 418 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.850952  normal  0.717406 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0660  allantoate amidohydrolase  36.82 
 
 		 425 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3426  allantoate amidohydrolase  35.37 
 
 		 418 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2561  amidase, hydantoinase/carbamoylase  36.95 
 
 		 426 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2043  allantoate amidohydrolase  33.33 
 
 		 416 aa  216  5e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.801178  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0348  allantoate amidohydrolase  33.33 
 
 		 415 aa  216  7e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1622  allantoate amidohydrolase  34.44 
 
 		 418 aa  216  7e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.7496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4022  amidase  34.45 
 
 		 418 aa  216  8e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0614  allantoate amidohydrolase  36.32 
 
 		 425 aa  215  9e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1536  allantoate amidohydrolase  34.07 
 
 		 425 aa  216  9e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1948  allantoate amidohydrolase  35.11 
 
 		 421 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.361736  normal  0.810576 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2691  allantoate amidohydrolase  34.07 
 
 		 426 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0654  allantoate amidohydrolase  36.07 
 
 		 425 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.385596  normal  0.174957 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6569  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  36.01 
 
 		 426 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.13575  normal  0.0102447 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4034  allantoate amidohydrolase  36.41 
 
 		 427 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3508  allantoate amidohydrolase  35.11 
 
 		 418 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1113  allantoate amidohydrolase  34.11 
 
 		 416 aa  214  2.9999999999999995e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.875823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4267  amidase  35.75 
 
 		 424 aa  214  2.9999999999999995e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3991  allantoate amidohydrolase  35.11 
 
 		 418 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.314302 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4042  allantoate amidohydrolase  31.99 
 
 		 411 aa  213  3.9999999999999995e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00143061  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2865  amidase  34.34 
 
 		 421 aa  213  3.9999999999999995e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.129348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1498  allantoate amidohydrolase  37.63 
 
 		 414 aa  213  4.9999999999999996e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1427  allantoate amidohydrolase  33.91 
 
 		 426 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.841231  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1844  allantoate amidohydrolase  34.17 
 
 		 415 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05810  allantoate amidohydrolase  35.14 
 
 		 427 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4755  amidase  34.26 
 
 		 419 aa  212  7e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1838  allantoate amidohydrolase  35.9 
 
 		 427 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.386813  normal  0.060174 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4068  allantoate amidohydrolase  36.25 
 
 		 414 aa  210  3e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1804  allantoate amidohydrolase  36.15 
 
 		 427 aa  210  3e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.58036  normal  0.76978 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3636  allantoate amidohydrolase  35.57 
 
 		 427 aa  211  3e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0419  allantoate amidohydrolase  34.26 
 
 		 418 aa  210  4e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3376  allantoate amidohydrolase  33.83 
 
 		 422 aa  209  5e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6710  allantoate amidohydrolase  33.66 
 
 		 426 aa  210  5e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.150854  normal  0.55827 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0772  allantoate amidohydrolase  33.94 
 
 		 425 aa  210  5e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.177397  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1253  allantoate amidohydrolase  33.94 
 
 		 425 aa  210  5e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.158158  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3071  allantoate amidohydrolase  34.18 
 
 		 421 aa  209  5e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6028  amidase  35.55 
 
 		 431 aa  209  7e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5967  allantoate amidohydrolase  33.42 
 
 		 426 aa  209  7e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.619712 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1597  allantoate amidohydrolase  33.66 
 
 		 426 aa  209  8e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6234  allantoate amidohydrolase  33.66 
 
 		 426 aa  209  8e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.535811  normal  0.174767 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0158  allantoate amidohydrolase  36.46 
 
 		 423 aa  209  9e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0228  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  35.06 
 
 		 422 aa  209  1e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.185353  normal  0.235064 
 
 
-
 
NC_004310  BR0279  allantoate amidohydrolase  33.42 
 
 		 415 aa  208  1e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.334762  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1668  allantoate amidohydrolase  31.91 
 
 		 431 aa  208  1e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5723  allantoate amidohydrolase  32.92 
 
 		 426 aa  207  2e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4148  amidase  34.02 
 
 		 421 aa  208  2e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1586  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  33.17 
 
 		 418 aa  207  3e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.484482  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0293  allantoate amidohydrolase  32.82 
 
 		 415 aa  207  3e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0374467  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0547  allantoate amidohydrolase  35.22 
 
 		 427 aa  207  3e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1225  allantoate amidohydrolase  34.46 
 
 		 423 aa  207  3e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.56571 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6654  allantoate amidohydrolase  33.17 
 
 		 426 aa  206  4e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0127692 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0047  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  32.73 
 
 		 428 aa  206  5e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.21885  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3207  amidase  33.25 
 
 		 423 aa  206  6e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4534  allantoate amidohydrolase  35.71 
 
 		 415 aa  206  6e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.289917  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4490  allantoate amidohydrolase  34.86 
 
 		 423 aa  206  8e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.702219 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0031  amidase, hydantoinase/carbamoylase  35.52 
 
 		 416 aa  205  1e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6670  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  33.76 
 
 		 427 aa  205  1e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.940854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2034  allantoate amidohydrolase  33.68 
 
 		 413 aa  204  3e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.388418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3896  allantoate amidohydrolase  33.42 
 
 		 412 aa  203  4e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1931  amidase, hydantoinase/carbamoylase  34.69 
 
 		 415 aa  203  5e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.876695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4258  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  33.16 
 
 		 412 aa  203  6e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6570  amidase  35.13 
 
 		 429 aa  202  9e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0846344 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1132  allantoate amidohydrolase  32.9 
 
 		 423 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0970  amidase  33.25 
 
 		 420 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0379  amidase, hydantoinase/carbamoylase  33.93 
 
 		 415 aa  201  1.9999999999999998e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.480246  normal  0.16493 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1144  allantoate amidohydrolase  33.07 
 
 		 423 aa  201  3e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.942572  normal  0.284268 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1186  amidase, hydantoinase/carbamoylase  36.25 
 
 		 412 aa  200  3e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2063  allantoate amidohydrolase  34.2 
 
 		 423 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6087  amidase  35.38 
 
 		 429 aa  200  5e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.976805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4391  allantoate amidohydrolase  33.42 
 
 		 427 aa  199  7e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5723  amidase, hydantoinase/carbamoylase  35.38 
 
 		 523 aa  199  7e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1546  allantoate amidohydrolase  36.06 
 
 		 414 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4780  allantoate amidohydrolase  31.85 
 
 		 415 aa  199  7.999999999999999e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.105367 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3623  allantoate amidohydrolase  33.5 
 
 		 415 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4903  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  34.18 
 
 		 420 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.810439  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3463  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  36.01 
 
 		 418 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>