35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_7012 on replicon NC_011981
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011981  Avi_7012    100 
 
 		 748 bp  1483    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0071  transposase  82.74 
 
 		 675 bp  373  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.507355 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8070  transposase  80.97 
 
 		 1041 bp  335  1e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.837659  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7154  transposase  81.82 
 
 		 675 bp  194  2.9999999999999997e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7492    82.23 
 
 		 258 bp  131  3e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5422  putative insertion sequence transposase-like protein  81.5 
 
 		 753 bp  117  5e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5438  putative insertion sequence transposase-like protein  81.5 
 
 		 753 bp  117  5e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7493    84.62 
 
 		 195 bp  111  3e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6108  hypothetical protein  81.13 
 
 		 753 bp  103  7e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6131  Transposase and inactivated derivatives-like protein  81.13 
 
 		 1041 bp  103  7e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8630  Transposase and inactivated derivatives-like protein  82.12 
 
 		 960 bp  101  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3886  putative insertion sequence transposase-like protein  79.57 
 
 		 684 bp  83.8  0.00000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.829291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6736  putative insertion sequence transposase-like protein  81.53 
 
 		 753 bp  81.8  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0621826 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1892    82.14 
 
 		 753 bp  79.8  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8531  hypothetical protein  81.1 
 
 		 753 bp  79.8  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8273    84.11 
 
 		 753 bp  77.8  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.11171  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6484    87.84 
 
 		 189 bp  75.8  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0121127  normal  0.519788 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3813    85.39 
 
 		 703 bp  73.8  0.00000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.562408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3376    78.17 
 
 		 752 bp  71.9  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8317  hypothetical protein  87.88 
 
 		 753 bp  67.9  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.324415  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1866  putative insertion sequence transposase-like protein  83.02 
 
 		 753 bp  67.9  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.308333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2636    79.02 
 
 		 635 bp  65.9  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3910    84.27 
 
 		 748 bp  65.9  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.570348  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3803  putative insertion sequence transposase-like protein  85 
 
 		 780 bp  63.9  0.00000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.6204 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1886  putative transposase  81.74 
 
 		 753 bp  61.9  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1881  putative insertion sequence transposase-like protein  87.93 
 
 		 741 bp  60  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1878    82.08 
 
 		 972 bp  60  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7034  hypothetical protein  82.08 
 
 		 753 bp  60  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0794917  normal  0.0905245 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2583  putative insertion sequence transposase-like protein  86.67 
 
 		 240 bp  56  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3818    78.17 
 
 		 707 bp  52  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0987    84.06 
 
 		 201 bp  50.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.721005  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6183    91.67 
 
 		 337 bp  48.1  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5344  transposase  88.64 
 
 		 765 bp  48.1  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.781184  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5335  transposase  88.64 
 
 		 765 bp  48.1  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5211  integrase catalytic subunit  88.64 
 
 		 795 bp  48.1  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.12008  normal  0.236418 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>