More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_5390 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_5390  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  100 
 
 		 345 aa  700    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.695996  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0123  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  73.7 
 
 		 354 aa  530  1e-149  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0110  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  73.33 
 
 		 359 aa  526  1e-148  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0107  putative sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  73.33 
 
 		 386 aa  526  1e-148  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4541  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  71.8 
 
 		 367 aa  508  1e-143  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.68861  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6758  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  68.02 
 
 		 346 aa  476  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.420036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5846  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  68.02 
 
 		 346 aa  473  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.268935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2257  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  59.94 
 
 		 352 aa  404  1e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1080  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  59.15 
 
 		 363 aa  389  1e-107  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3403  sulphate transport system permease protein 1  56.62 
 
 		 356 aa  378  1e-104  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.270321  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0595  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  57.05 
 
 		 347 aa  369  1e-101  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.645255 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0584  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  57.05 
 
 		 348 aa  369  1e-101  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1048  sulphate transport system permease protein 1  54.2 
 
 		 348 aa  358  6e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1159  sulphate transport system permease protein 1  53.91 
 
 		 348 aa  358  7e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.940545 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1099  ABC transporter related  57.55 
 
 		 327 aa  358  8e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0559  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  58.25 
 
 		 327 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.387345 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0609  sulphate transport system permease protein 1  57.37 
 
 		 359 aa  355  5e-97  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.863407  normal  0.7165 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1391  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  53.01 
 
 		 350 aa  355  5e-97  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4007  sulphate transport system permease protein 1  53.33 
 
 		 349 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.451546 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6974  sulfate/thiosulfate ABC transporter, ATP-binding component  52.75 
 
 		 345 aa  352  4e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0818  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  52.75 
 
 		 348 aa  352  5e-96  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.650586  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0621  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  57.41 
 
 		 348 aa  350  2e-95  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0827201  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3557  sulphate transport system permease protein 1  53.04 
 
 		 349 aa  350  3e-95  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1181  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein CysA  58.39 
 
 		 348 aa  347  1e-94  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.36202  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0701  sulfate ABC transporter ATP-binding protein  57.1 
 
 		 348 aa  347  1e-94  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2757  sulphate transport system permease protein 1  52.75 
 
 		 349 aa  347  2e-94  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.194573  normal  0.471135 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4115  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  50.29 
 
 		 357 aa  347  2e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3891  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  59.36 
 
 		 356 aa  345  5e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.540067  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02515  sulfate/thiosulfate import ATP-binding protein CysA  53.6 
 
 		 346 aa  345  8e-94  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0503  sulphate transport system permease protein 1  51.53 
 
 		 360 aa  343  2e-93  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2534  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  52.01 
 
 		 354 aa  342  5e-93  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0417932  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4587  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  58.8 
 
 		 375 aa  342  5.999999999999999e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0197  sulphate transport system permease protein 1  52.03 
 
 		 329 aa  341  1e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1186  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  52.33 
 
 		 330 aa  340  2e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4348  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  51.74 
 
 		 332 aa  338  7e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0311  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein CysA  51.74 
 
 		 326 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3091  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  52.19 
 
 		 330 aa  338  9.999999999999999e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.711753  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0081  ABC transporter  51.74 
 
 		 326 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5168  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  51.45 
 
 		 329 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.644217 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5476  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  56.21 
 
 		 376 aa  336  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.351267  normal  0.0358165 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03650  sulfate transport protein CysA  51.16 
 
 		 329 aa  336  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00236886  hitchhiker  0.00000000727844 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3807  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  55.84 
 
 		 355 aa  336  2.9999999999999997e-91  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.772256 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5075  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  51.45 
 
 		 329 aa  336  5e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.207952  normal  0.649102 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3690  sulphate transport system permease protein 1  49.86 
 
 		 355 aa  335  5e-91  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5228  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  51.16 
 
 		 329 aa  335  5.999999999999999e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.138595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1522  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  57.14 
 
 		 375 aa  335  7.999999999999999e-91  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.164669  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2335  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  57.14 
 
 		 375 aa  335  7.999999999999999e-91  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0371  sulfate transport protein CysA  50.87 
 
 		 329 aa  334  1e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.322306  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3431  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  54.8 
 
 		 371 aa  333  2e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.405046 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0294  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  51.16 
 
 		 329 aa  333  2e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.491051 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1903  sulphate transport system permease protein 1  64.94 
 
 		 343 aa  333  2e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000843013  hitchhiker  0.000000000000895278 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3696  ABC sulfate/thiosulfate transporter, ATPase subunit CysA  54.49 
 
 		 371 aa  332  5e-90  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2958  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  54.63 
 
 		 365 aa  332  6e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0126  ABC type ATPase  63.2 
 
 		 352 aa  331  1e-89  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228603 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1347  sulfate transport ATP-binding ABC transporter protein  50.14 
 
 		 372 aa  331  1e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1797  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  59.07 
 
 		 371 aa  331  1e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.472003 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1739  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  49.01 
 
 		 355 aa  330  2e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1286  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  50.42 
 
 		 369 aa  330  3e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.245798  normal  0.231745 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0964  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  53.99 
 
 		 369 aa  329  4e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1349  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  64.94 
 
 		 343 aa  328  6e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1968  sulphate transport system permease protein 1  50.14 
 
 		 378 aa  328  6e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0730  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  56.29 
 
 		 354 aa  328  6e-89  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2800  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  49.71 
 
 		 330 aa  328  1.0000000000000001e-88  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1378  sulphate transport system permease protein 1  49.58 
 
 		 367 aa  327  2.0000000000000001e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.747382  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1223  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  50.14 
 
 		 369 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.243512  normal  0.134553 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2379  sulphate transport system permease protein 1  56.34 
 
 		 362 aa  327  3e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1776  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  49.29 
 
 		 352 aa  326  3e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0968397  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1796  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  56.04 
 
 		 376 aa  326  3e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.356789  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1302  sulfate/thiosulfate transporter subunit  57.09 
 
 		 363 aa  325  6e-88  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.807045  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2467  ABC sulfate/thiosulfate transporter, ATPase subunit, CysA  48.86 
 
 		 352 aa  325  6e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.37453  normal  0.40558 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1411  sulfate/thiosulfate transporter subunit  57.09 
 
 		 363 aa  325  6e-88  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0622  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  54.09 
 
 		 365 aa  325  7e-88  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4655  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  55.99 
 
 		 354 aa  325  8.000000000000001e-88  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1546  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  56.69 
 
 		 362 aa  325  1e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02322  sulfate/thiosulfate transporter subunit  57.8 
 
 		 365 aa  323  2e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02283  hypothetical protein  57.8 
 
 		 365 aa  323  2e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0869  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  57.39 
 
 		 371 aa  323  2e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2548  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  61.96 
 
 		 374 aa  323  2e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.469643  normal  0.012535 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2766  sulfate/thiosulfate transporter subunit  56.74 
 
 		 363 aa  323  3e-87  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0027443 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1047  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  47.97 
 
 		 330 aa  323  3e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1239  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  57.8 
 
 		 365 aa  322  5e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.525663  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1257  sulfate/thiosulfate transporter subunit  57.8 
 
 		 365 aa  322  5e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109195 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2558  sulfate/thiosulfate transporter subunit  57.8 
 
 		 365 aa  322  5e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2577  sulfate/thiosulfate transporter subunit  57.8 
 
 		 365 aa  322  5e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1759  sulphate transport system permease protein 1  54.36 
 
 		 367 aa  322  6e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3652  sulfate/thiosulfate transporter subunit  57.8 
 
 		 365 aa  322  7e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.992152  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1199  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  55.83 
 
 		 357 aa  322  9.000000000000001e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1495  sulphate transport system permease protein 1  54.37 
 
 		 338 aa  321  9.000000000000001e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.625572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2195  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  56.49 
 
 		 339 aa  320  1.9999999999999998e-86  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.643313  normal  0.295178 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2708  sulfate/thiosulfate transporter subunit  57.45 
 
 		 365 aa  320  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.882672  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1500  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  49.58 
 
 		 352 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.823264  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1014  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  60.32 
 
 		 357 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.939142  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2701  sulfate/thiosulfate transporter subunit  57.45 
 
 		 365 aa  320  3e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.525621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2807  sulfate/thiosulfate transporter subunit  57.45 
 
 		 365 aa  320  3e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2677  sulfate/thiosulfate transporter subunit  57.45 
 
 		 364 aa  319  3e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0079  sulfate/thiosulfate transporter subunit  56.03 
 
 		 377 aa  320  3e-86  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.58607  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2586  sulfate/thiosulfate transporter subunit  57.45 
 
 		 365 aa  320  3e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2635  sulfate/thiosulfate transporter subunit  57.45 
 
 		 365 aa  320  3e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.203348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1520  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  49.58 
 
 		 352 aa  320  3e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.34383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1128  sulfate/thiosulfate import ATP-binding protein CysA  55.48 
 
 		 357 aa  319  3.9999999999999996e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>