77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_5368 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_5368  hypothetical protein  100 
 
 		 253 aa  491  9.999999999999999e-139  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.813565  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5273  phage shock protein A, PspA  85.54 
 
 		 244 aa  409  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0710942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5545  phage shock protein A, PspA  87.5 
 
 		 244 aa  402  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.892809 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1404  phage shock protein A, PspA  41.45 
 
 		 241 aa  153  2e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.792709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5044  phage shock protein A, PspA  40.97 
 
 		 232 aa  152  5e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0169336 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3389  phage shock protein A, PspA  41.33 
 
 		 231 aa  152  5e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1693  PspA/IM30  41.45 
 
 		 235 aa  138  1e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.509577  normal  0.622642 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3786  PspA/IM30 family protein  41.03 
 
 		 235 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.634391  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1388  hypothetical protein  38.67 
 
 		 231 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0883629  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16150  hypothetical protein  38.22 
 
 		 231 aa  132  5e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3822  phage shock protein A, PspA  37.28 
 
 		 236 aa  127  1.0000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.302506  normal  0.194258 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4191  PspA/IM30 family protein  35.68 
 
 		 229 aa  126  4.0000000000000003e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1224  phage shock protein A, PspA  33.91 
 
 		 226 aa  125  5e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01340  Phage shock protein A (IM30), suppresses sigma54-dependent transcription  34.67 
 
 		 226 aa  124  1e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3703  phage shock protein A, PspA  38.33 
 
 		 232 aa  123  3e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3479  ubiquinone biosynthesis hydroxylase, UbiH/UbiF/VisC/COQ6  34.93 
 
 		 229 aa  121  9.999999999999999e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.111551  normal  0.0139812 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02185  PspA/IM30 family protein  33.33 
 
 		 257 aa  114  1.0000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0185  phage shock protein A, PspA  33.33 
 
 		 227 aa  108  1e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2668  PspA/IM30  33.04 
 
 		 229 aa  105  9e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.638244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3482  phage shock protein A, PspA  31.88 
 
 		 229 aa  104  2e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0916026  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3266  phage shock protein A, PspA  31.44 
 
 		 229 aa  102  4e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.942546  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0827  phage shock protein A, PspA  32.89 
 
 		 229 aa  102  8e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3114  phage shock protein A, PspA  32.46 
 
 		 229 aa  101  1e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.139469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3091  phage shock protein A, PspA  31.42 
 
 		 229 aa  101  1e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0777554  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0922  phage shock protein A, PspA  31.42 
 
 		 229 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0858  phage shock protein A, PspA  32.46 
 
 		 229 aa  100  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.69065  normal  0.706037 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3450  phage shock protein A, PspA  31.42 
 
 		 229 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.613908  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0912  phage shock protein A, PspA  31.42 
 
 		 229 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0749469  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3765  hypothetical protein  32.46 
 
 		 229 aa  100  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0888  phage shock protein A, PspA  31.42 
 
 		 229 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0755885  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0697  PspA/IM30  31.88 
 
 		 229 aa  99.8  4e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000488945  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3838  phage shock protein A, PspA  31.86 
 
 		 228 aa  98.6  9e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.867887  unclonable  0.00000000015087 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0623  phage shock protein A, PspA  31.42 
 
 		 228 aa  97.1  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.865812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0722  phage shock protein A, PspA  30.97 
 
 		 228 aa  96.7  3e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000273053  hitchhiker  0.000000222893 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3831  phage shock protein A, PspA  33.05 
 
 		 232 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000771014 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4653  PspA/IM30 family protein  33.05 
 
 		 232 aa  95.1  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.618876 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04011  hypothetical protein  33.05 
 
 		 232 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04049  predicted transcriptional regulator effector protein  33.05 
 
 		 232 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4742  PspA/IM30 family protein  33.05 
 
 		 232 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.473518  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4426  PspA/IM30 family protein  33.05 
 
 		 232 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3811  phage shock protein A, PspA  33.05 
 
 		 232 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5698  PspA/IM30 family protein  32.05 
 
 		 232 aa  94  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4649  PspA/IM30 family protein  32.62 
 
 		 232 aa  89.4  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4768  PspA/IM30 family protein  32.19 
 
 		 232 aa  88.2  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4789  PspA/IM30 family protein  32.19 
 
 		 232 aa  88.2  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4732  PspA/IM30 family protein  32.19 
 
 		 232 aa  88.2  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.783579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1637  phage shock protein A, PspA  29.65 
 
 		 232 aa  56.6  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0607  phage shock protein A, PspA  24.47 
 
 		 279 aa  51.2  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1006  hypothetical protein  22.99 
 
 		 246 aa  49.7  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.682197  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0716  phage shock protein A, PspA  25.45 
 
 		 233 aa  49.7  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000138037  normal  0.0481757 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2993  phage shock protein A, PspA  26.32 
 
 		 225 aa  47.4  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.403474  normal  0.419915 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0216  phage shock protein A, PspA  25.13 
 
 		 222 aa  47  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2342  phage shock protein A, PspA  26.27 
 
 		 222 aa  46.2  0.0005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00393606  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01292  hypothetical protein  26.27 
 
 		 222 aa  46.2  0.0005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01281  regulatory protein for phage-shock-protein operon  26.27 
 
 		 222 aa  46.2  0.0005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2279  phage shock protein A, PspA  23.69 
 
 		 295 aa  46.2  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1514  phage shock protein PspA  26.27 
 
 		 222 aa  46.2  0.0005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1419  phage shock protein PspA  26.27 
 
 		 222 aa  46.2  0.0005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1540  phage shock protein PspA  26.27 
 
 		 222 aa  46.2  0.0005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1946  phage shock protein PspA  26.27 
 
 		 222 aa  46.2  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2321  phage shock protein PspA  26.27 
 
 		 222 aa  46.2  0.0005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.17031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1782  phage shock protein A, PspA  26.19 
 
 		 263 aa  45.8  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.957793  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0952  phage shock protein A, PspA  24.31 
 
 		 260 aa  45.4  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0811243  normal  0.359878 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0487  phage shock protein A, PspA  24.61 
 
 		 283 aa  45.4  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.496627  normal  0.29502 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3183  phage shock protein A, PspA  34.04 
 
 		 230 aa  45.4  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.170876  normal  0.95857 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2957  PspA/IM30 family protein  38 
 
 		 230 aa  45.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0635667 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1621  phage shock protein A, PspA  24.65 
 
 		 297 aa  44.7  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.615418 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1818  phage shock protein PspA  25.85 
 
 		 222 aa  45.1  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.264575 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0677  phage shock protein A, PspA  27.06 
 
 		 228 aa  44.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.274325  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0735  phage shock protein A, PspA  25.33 
 
 		 228 aa  42.7  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.320834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1157  phage shock protein A, PspA  24.71 
 
 		 220 aa  42.7  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.477333  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0429  phage shock protein A, PspA  25.34 
 
 		 272 aa  42.7  0.006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.418473  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3152  PspA/IM30 family protein  25.49 
 
 		 260 aa  42.7  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1815  phage shock protein PspA  25.85 
 
 		 222 aa  42.4  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.216453 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3520  phage shock protein A, PspA  28.05 
 
 		 224 aa  42  0.009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0161  phage shock protein A, PspA  24.69 
 
 		 258 aa  42  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.877832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0406  phage shock protein A, PspA  26.53 
 
 		 223 aa  42  0.01  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>