More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_5015 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011988  Avi_5015  ABC transporter membrane spanning protein  100 
 
 
240 aa  461  1e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6394  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  82.55 
 
 
241 aa  327  1.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.102283  normal  0.44453 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4532  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  82.55 
 
 
241 aa  314  6e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.209994  normal  0.0993914 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5068  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  68.22 
 
 
240 aa  303  1.0000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.458442  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0174  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  61.23 
 
 
241 aa  241  6e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.390949 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0533  amino acid ABC transporter permease  53.39 
 
 
234 aa  199  3e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7394  ABC transporter membrane spanning protein  45.29 
 
 
240 aa  181  1e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.330237  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6914  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.99 
 
 
241 aa  165  6.9999999999999995e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5921  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.56 
 
 
241 aa  164  8e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.610786  normal  0.165756 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1114  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.82 
 
 
229 aa  164  1.0000000000000001e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.384644  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1524  amino acid ABC transporter permease  42.33 
 
 
229 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0297  ABC basic amino acid transporter, inner membrane subunit  41.67 
 
 
244 aa  162  3e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4049  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  43.42 
 
 
238 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2567  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.1 
 
 
229 aa  162  4.0000000000000004e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.386415  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0328  amino acid ABC transporter permease  41.67 
 
 
244 aa  162  6e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4485  polar amino acid ABC transporter inner membrane subunit  41.36 
 
 
229 aa  161  7e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1430  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.36 
 
 
229 aa  161  7e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0905208  normal  0.971438 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2857  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.18 
 
 
228 aa  161  1e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.224945  normal  0.227891 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4291  amino acid ABC transporter permease  40.91 
 
 
229 aa  159  3e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3872  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.98 
 
 
238 aa  159  3e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.171228  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1926  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.23 
 
 
228 aa  159  4e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.432172 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3448  histidine ABC transporter, permease protein HisQ  39.27 
 
 
228 aa  158  6e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.869706  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5464  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.27 
 
 
229 aa  158  7e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1791  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.01 
 
 
229 aa  158  8e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.369418  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2789  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.18 
 
 
229 aa  158  8e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.113989  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1377  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.18 
 
 
229 aa  157  1e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4638  amino acid ABC transporter permease  40.91 
 
 
229 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3725  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.91 
 
 
229 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0898326 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3990  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.91 
 
 
229 aa  157  1e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.456811 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1539  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.55 
 
 
228 aa  157  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0352  histidine transport system permease HisQ  39.55 
 
 
228 aa  157  2e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.179299  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3607  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.82 
 
 
229 aa  156  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.488418  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2602  histidine ABC transporter, permease protein HisQ  39.27 
 
 
228 aa  157  2e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.311053  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2458  histidine ABC transporter, permease protein HisQ  39.27 
 
 
228 aa  157  2e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1344  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.27 
 
 
228 aa  157  2e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.917469  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1429  histidine ABC transporter, permease protein HisQ  39.55 
 
 
228 aa  157  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0521843  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2927  ABC lysine/arginine/ornithine transporter, innermembrane subunit  40.18 
 
 
233 aa  156  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.26673 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26230  histidine transport system permease protein  41.33 
 
 
229 aa  156  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0832582  normal  0.643473 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2464  histidine ABC transporter, permease protein HisQ  39.27 
 
 
228 aa  157  2e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.796861  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02233  histidine/lysine/arginine/ornithine transporter subunit  38.81 
 
 
228 aa  156  3e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1348  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.81 
 
 
228 aa  156  3e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.120013  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3774  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.45 
 
 
229 aa  156  3e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.134573  hitchhiker  0.00153221 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02193  hypothetical protein  38.81 
 
 
228 aa  156  3e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2686  histidine ABC transporter, permease protein HisQ  38.81 
 
 
228 aa  156  3e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.503163  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2377  ABC His/Glu/Gln/Arg/opine transporter, inner membrane subunit  40.91 
 
 
243 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.413222  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1827  arginine/ornithine ABC transporter, permease protein  39.09 
 
 
229 aa  154  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.883387  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3570  amino acid ABC transporter permease  38.64 
 
 
229 aa  154  1e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.906452  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2703  histidine ABC transporter permease HisQ  38.81 
 
 
228 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2494  histidine ABC transporter, permease protein HisQ  38.81 
 
 
228 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.174518  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2582  histidine ABC transporter permease HisQ  38.81 
 
 
228 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.114361 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2540  histidine ABC transporter permease protein HisQ  38.81 
 
 
228 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.512507  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2594  histidine ABC transporter permease HisQ  38.81 
 
 
228 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4287  ABC polar amino acid transporter, inner membrane subunit  39.63 
 
 
229 aa  153  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2732  amino acid ABC transporter, permease protein  38.71 
 
 
229 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1153  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.63 
 
 
229 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.176367 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3796  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40 
 
 
229 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.719623  normal  0.0561262 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2853  histidine transport system permease protein  38.71 
 
 
229 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2791  histidine ABC transporter, permease protein HisQ  38.71 
 
 
229 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.249098  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2129  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.09 
 
 
260 aa  152  4e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.356557  normal  0.354244 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0696  amino acid ABC transporter permease  39.63 
 
 
229 aa  152  4e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.156874  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1175  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.63 
 
 
229 aa  152  4e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1057  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.63 
 
 
229 aa  152  4e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1410  histidine ABC transporter, permease protein  39.63 
 
 
229 aa  152  5e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.157931  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1054  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.63 
 
 
253 aa  152  5e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.712414  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0885  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.94 
 
 
229 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.524811 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3519  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.83 
 
 
240 aa  151  8.999999999999999e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.405389  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5165  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  46.88 
 
 
232 aa  150  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1089  histidine ABC transporter, permease protein  40.45 
 
 
229 aa  149  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.518061  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1240  histidine ABC transporter, permease protein  40.45 
 
 
229 aa  149  3e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.842706  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1355  His/Glu/Gln/Arg/opine ABC transporter permease  40.45 
 
 
229 aa  149  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.556  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0210  histidine ABC transporter, permease protein  40.45 
 
 
229 aa  149  3e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0483  histidine ABC transporter, permease protein  40.45 
 
 
229 aa  149  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.158807  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1474  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.64 
 
 
229 aa  149  3e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.996981  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1094  histidine ABC transporter, permease protein HisQ  36.49 
 
 
229 aa  149  5e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.914927  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1247  histidine transport system permease protein  36.49 
 
 
229 aa  149  5e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.520623  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1089  histidine ABC transporter, permease protein HisQ  36.49 
 
 
229 aa  149  5e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1440  His/Glu/Gln/Arg/opine ABC transporter permease  40.45 
 
 
371 aa  148  6e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0889  amino acid ABC transporter, permease protein  35.59 
 
 
229 aa  148  8e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2073  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.2 
 
 
246 aa  147  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3017  histidine ABC transporter, permease protein  36.04 
 
 
229 aa  146  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.606762  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0987  histidine ABC transporter, permease protein  36.04 
 
 
229 aa  146  3e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.689242  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1580  histidine ABC transporter, permease protein  36.04 
 
 
229 aa  146  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.280205  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2915  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.73 
 
 
229 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.149871 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3325  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.44 
 
 
228 aa  145  5e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.462378  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1771  amino acid ABC transporter, permease protein  42.16 
 
 
229 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01551  ABC transporter permease protein  33.62 
 
 
246 aa  145  7.0000000000000006e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1122  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.18 
 
 
229 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3391  ABC basic amino acid transporter, inner membrane subunit  40.18 
 
 
229 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1589  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.22 
 
 
267 aa  144  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2252  amino acid ABC transporter permease  44.39 
 
 
232 aa  144  1e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2560  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.28 
 
 
230 aa  144  1e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.645171  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1828  ABC amino acid transporter, inner membrane subunit  39.3 
 
 
240 aa  144  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.300709  normal  0.358336 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2236  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.19 
 
 
240 aa  144  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1554  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.16 
 
 
229 aa  144  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.699614  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6176  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.97 
 
 
244 aa  143  3e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0454667 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4137  amino acid ABC transporter, permease protein  37.73 
 
 
237 aa  142  4e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3875  amino acid ABC transporter permease  38.6 
 
 
242 aa  142  4e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.426238 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4835  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.43 
 
 
240 aa  142  5e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.716985  normal  0.137601 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6601  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.48 
 
 
258 aa  142  6e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5003  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.49 
 
 
229 aa  142  6e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.750872 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>