More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_4329 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011989  Avi_4329  Aminotransferase protein  100 
 
 
455 aa  935    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.617372  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0196  8-amino-7-oxononanoate synthase  63.18 
 
 
470 aa  591  1e-167  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0951  8-amino-7-oxononanoate synthase  56.38 
 
 
455 aa  450  1e-125  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1944  aminotransferase class I and II  56.57 
 
 
455 aa  449  1e-125  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.49804  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0318  8-amino-7-oxononanoate synthase  56.67 
 
 
455 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.213492  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1111  8-amino-7-oxononanoate synthase  53.94 
 
 
450 aa  448  1.0000000000000001e-124  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0567781 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2728  8-amino-7-oxononanoate synthase  51.47 
 
 
464 aa  437  1e-121  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1837  8-amino-7-oxononanoate synthase  53.54 
 
 
456 aa  437  1e-121  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.688566  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2222  8-amino-7-oxononanoate synthase  52.78 
 
 
457 aa  435  1e-121  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.475476  normal  0.501295 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1946  8-amino-7-oxononanoate synthase  52.78 
 
 
457 aa  435  1e-120  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.800887 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1508  8-amino-7-oxononanoate synthase  53.79 
 
 
445 aa  429  1e-119  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1144  Glycine C-acetyltransferase  52.79 
 
 
453 aa  429  1e-119  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1540  8-amino-7-oxononanoate synthase  52.07 
 
 
445 aa  421  1e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3875  glycine C-acetyltransferase  46.82 
 
 
442 aa  412  1e-114  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.264237  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2618  8-amino-7-oxononanoate synthase  52.06 
 
 
441 aa  414  1e-114  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3011  8-amino-7-oxononanoate synthase, putative  52.06 
 
 
441 aa  414  1e-114  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0753  glycine C-acetyltransferase  48.64 
 
 
442 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0301  8-amino-7-oxononanoate synthase  46.59 
 
 
442 aa  411  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.454104  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0784  8-amino-7-oxononanoate synthase  46.59 
 
 
442 aa  411  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3269  putative 8-amino-7-oxononanoate synthase  48.49 
 
 
439 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3283  aminotransferase class-I  48.49 
 
 
439 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1343  8-amino-7-oxononanoate synthase  48.6 
 
 
440 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.144248  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2164  putative 8-amino-7-oxononanoate synthase  48.49 
 
 
439 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3920  8-amino-7-oxononanoate synthase  49.88 
 
 
450 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.193624  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0541  putative 8-amino-7-oxononanoate synthase  48.49 
 
 
439 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1059  putative 8-amino-7-oxononanoate synthase  48.49 
 
 
439 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3233  putative 8-amino-7-oxononanoate synthase  48.26 
 
 
439 aa  403  1e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0211359  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2287  8-amino-7-oxononanoate synthase, putative  51.57 
 
 
390 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2601  glycine C-acetyltransferase  50.25 
 
 
450 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2059  Glycine C-acetyltransferase  46.97 
 
 
440 aa  377  1e-103  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000332392  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0641  8-amino-7-oxononanoate synthase  49.47 
 
 
428 aa  374  1e-102  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.367441  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3804  8-amino-7-oxononanoate synthase  47.58 
 
 
444 aa  372  1e-102  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.785245 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1973  8-amino-7-oxononanoate synthase  43.45 
 
 
544 aa  371  1e-101  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0795  8-amino-7-oxononanoate synthase  45.38 
 
 
487 aa  326  7e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1353  8-amino-7-oxononanoate synthase  46.17 
 
 
409 aa  319  6e-86  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0593044 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3012  8-amino-7-oxononanoate synthase  45.64 
 
 
408 aa  312  9e-84  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.295664 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3919  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  38.83 
 
 
404 aa  275  1.0000000000000001e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0458222 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1307  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  40.89 
 
 
395 aa  273  6e-72  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1346  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  40.54 
 
 
391 aa  272  1e-71  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.583033  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0779  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  39.89 
 
 
395 aa  272  1e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2194  8-amino-7-oxononanoate synthase, putative  39.44 
 
 
395 aa  270  2.9999999999999997e-71  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1549  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase  39.18 
 
 
393 aa  257  2e-67  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000387483  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2045  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.33 
 
 
390 aa  255  1.0000000000000001e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0152681  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4834  8-amino-7-oxononanoate synthase  40.05 
 
 
380 aa  254  3e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.348424 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0699  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase  38.13 
 
 
395 aa  252  8.000000000000001e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0699  aminotransferase class I and II  38.4 
 
 
396 aa  251  1e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0147  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase  38.71 
 
 
395 aa  248  1e-64  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2967  8-amino-7-oxononanoate synthase  40.62 
 
 
396 aa  247  4e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2195  Glycine C-acetyltransferase  35.37 
 
 
401 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.880865  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1652  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase  37.81 
 
 
393 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1780  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.04 
 
 
395 aa  244  3e-63  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0688  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  36.69 
 
 
396 aa  243  5e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0065  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.67 
 
 
381 aa  243  5e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00162329  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2816  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.07 
 
 
395 aa  242  9e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0067  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.27 
 
 
381 aa  242  1e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0731  Glycine C-acetyltransferase  36.83 
 
 
396 aa  242  1e-62  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.000138233  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2397  Glycine C-acetyltransferase  35.25 
 
 
401 aa  240  4e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.135893  normal  0.0678456 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2207  Glycine C-acetyltransferase  36.76 
 
 
416 aa  240  4e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.35112  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0530  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  36.43 
 
 
396 aa  240  5e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0530  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  36.43 
 
 
396 aa  240  5e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0748  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  36.43 
 
 
396 aa  240  5e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00398054  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0675  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  36.43 
 
 
396 aa  240  5e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.36128e-18 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4680  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  36.43 
 
 
396 aa  239  9e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.721634  hitchhiker  3.77656e-21 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0292  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  36.71 
 
 
393 aa  238  1e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0586  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  36.18 
 
 
396 aa  239  1e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0620  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  36.18 
 
 
396 aa  239  1e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0534  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  37.33 
 
 
396 aa  238  1e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0657  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  36.43 
 
 
396 aa  239  1e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.111241  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0484  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.78 
 
 
399 aa  238  2e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0533  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  37.64 
 
 
396 aa  238  2e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.801462  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2819  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.38 
 
 
386 aa  234  2.0000000000000002e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.238306 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2100  8-amino-7-oxononanoate synthase  36.5 
 
 
386 aa  234  3e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0669  glycine C-acetyltransferase  32.99 
 
 
446 aa  229  7e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.236778  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2298  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  34.63 
 
 
395 aa  228  1e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000248128  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0393  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.7 
 
 
390 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.221946  normal  0.405547 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5175  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.94 
 
 
392 aa  228  1e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.701145  normal  0.281343 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2557  Glycine C-acetyltransferase  35.42 
 
 
403 aa  228  1e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.470257  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1185  glycine C-acetyltransferase  33.89 
 
 
396 aa  227  3e-58  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0352  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.03 
 
 
393 aa  226  6e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.367028 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1835  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.29 
 
 
384 aa  226  6e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4839  8-amino-7-oxononanoate synthase  36.86 
 
 
390 aa  225  1e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.908198 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0022  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  36.41 
 
 
388 aa  223  4.9999999999999996e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0282575  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2435  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.85 
 
 
391 aa  221  1.9999999999999999e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0783032 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05990  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.67 
 
 
391 aa  221  3e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0587  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.75 
 
 
395 aa  219  7.999999999999999e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0573  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.75 
 
 
395 aa  219  7.999999999999999e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.709963  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0049  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase  36.29 
 
 
396 aa  219  7.999999999999999e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0048  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase  34.55 
 
 
396 aa  219  8.999999999999998e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000159697 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01102  Serine palmitoyl transferase subunit [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q7ZA40]  34.62 
 
 
672 aa  218  2e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0709123 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0814  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.89 
 
 
386 aa  218  2e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3021  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.34 
 
 
399 aa  218  2e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0133  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.03 
 
 
392 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0363  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.7 
 
 
390 aa  217  4e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2579  8-amino-7-oxononanoate synthase  32.16 
 
 
400 aa  217  4e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2629  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.97 
 
 
391 aa  216  5e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1009  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.78 
 
 
395 aa  216  5e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4228  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.78 
 
 
395 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.323305  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4686  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.11 
 
 
396 aa  216  7e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0057  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  34.35 
 
 
396 aa  215  9.999999999999999e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1967  8-amino-7-oxononanoate synthase  33.51 
 
 
400 aa  214  1.9999999999999998e-54  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>