31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_3542 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_3542  hypothetical protein  100 
 
 		 715 aa  1435    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.652953  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3345  hypothetical protein  44.42 
 
 		 841 aa  315  1.9999999999999998e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.172568  decreased coverage  0.00479246 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3088  hypothetical protein  43.3 
 
 		 836 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.671976  normal  0.139652 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2615  hypothetical protein  46.11 
 
 		 766 aa  302  2e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1681  hypothetical protein  40 
 
 		 465 aa  222  1.9999999999999999e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.571535  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3157  hypothetical protein  48.02 
 
 		 544 aa  221  3e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0907045  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1625  hypothetical protein  40.8 
 
 		 465 aa  221  3e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1232  hypothetical protein  36.66 
 
 		 479 aa  215  1.9999999999999998e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1124  hypothetical protein  38.12 
 
 		 518 aa  149  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2964  hypothetical protein  37.57 
 
 		 540 aa  146  1e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.209259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4773  hypothetical protein  37.5 
 
 		 534 aa  146  1e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.43696  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4085  hypothetical protein  37.14 
 
 		 553 aa  141  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.414268  normal  0.0981997 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1331  hypothetical protein  36.36 
 
 		 540 aa  140  7.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.239363 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1851  hypothetical protein  37.5 
 
 		 546 aa  140  7.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3893  hypothetical protein  36.36 
 
 		 541 aa  139  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0724599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0286  hypothetical protein  29.77 
 
 		 499 aa  127  6e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5639  putative CheA signal transduction histidine kinase  36.11 
 
 		 496 aa  125  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495169  normal  0.277349 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0963  hypothetical protein  33.89 
 
 		 493 aa  125  3e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.373348 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1000  hypothetical protein  33.89 
 
 		 492 aa  125  4e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7582  hypothetical protein  34.66 
 
 		 409 aa  120  9e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117835  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0307  hypothetical protein  35.26 
 
 		 472 aa  118  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.453732  normal  0.292197 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0941  hypothetical protein  32.78 
 
 		 493 aa  115  3e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0036  hypothetical protein  33.52 
 
 		 460 aa  114  5e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6846  hypothetical protein  32.39 
 
 		 414 aa  108  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1006  hypothetical protein  32.29 
 
 		 634 aa  108  3e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0103184 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1299  hypothetical protein  30.41 
 
 		 1763 aa  101  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2605  hypothetical protein  34.07 
 
 		 1680 aa  93.6  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.6809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3351  peptidase M23B  32.73 
 
 		 687 aa  55.5  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0955739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0836  hypothetical protein  52.7 
 
 		 268 aa  49.7  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000351202 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6136  hypothetical protein  33.33 
 
 		 277 aa  43.9  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160377 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01443  hypothetical protein  47.37 
 
 		 1309 aa  43.9  0.01  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.968118  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>