More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2375 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03755  glutamine synthetase  64.74 
 
 		 469 aa  647    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4116  glutamine synthetase, type I  64.74 
 
 		 469 aa  647    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1582  glutamine synthetase, type I  64.61 
 
 		 471 aa  640    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4189  glutamine synthetase  63.68 
 
 		 469 aa  639    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1216  glutamine synthetase, type I  76.71 
 
 		 469 aa  760    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.870182 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1677  glutamine synthetase, type I  66.03 
 
 		 469 aa  654    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.20708  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1258  glutamine synthetase protein  64.52 
 
 		 471 aa  648    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.859472 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3067  glutamine synthetase, type I  63.25 
 
 		 471 aa  637    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2634  glutamine synthetase, type I  63.25 
 
 		 471 aa  637    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.675717  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2377  glutamine synthetase, type I  77.19 
 
 		 469 aa  778    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.476577 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0970  glutamine synthetase, type I  87.63 
 
 		 469 aa  877    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.545228  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1004  glutamine synthetase, type I  87.85 
 
 		 469 aa  878    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4335  glutamine synthetase  64.74 
 
 		 469 aa  647    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4218  glutamine synthetase  64.74 
 
 		 469 aa  647    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.670348  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1189  L-glutamine synthetase  66.03 
 
 		 471 aa  658    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.868262  normal  0.510939 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1442  L-glutamine synthetase  66.03 
 
 		 471 aa  656    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2780  glutamine synthetase, type I  64.32 
 
 		 471 aa  640    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.481689  hitchhiker  0.00799964 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1743  glutamine synthetase, type I  63.25 
 
 		 471 aa  637    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0103435  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4881  glutamine synthetase  63.25 
 
 		 469 aa  636    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.567284  hitchhiker  0.000124189 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4146  glutamine synthetase  64.74 
 
 		 469 aa  647    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.216906 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4255  glutamine synthetase  64.74 
 
 		 469 aa  647    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.743533 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4239  glutamine synthetase  64.74 
 
 		 469 aa  647    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3763  L-glutamine synthetase  65.61 
 
 		 471 aa  637    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.382156  normal  0.0833573 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4346  glutamine synthetase  64.74 
 
 		 469 aa  647    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0626  glutamine synthetase, type I  63.23 
 
 		 471 aa  636    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2057  L-glutamine synthetase  63.46 
 
 		 471 aa  637    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.648979  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4831  L-glutamine synthetase  68.1 
 
 		 470 aa  681    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.840824 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2076  L-glutamine synthetase  65.17 
 
 		 472 aa  654    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.943231  normal  0.983586 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2503  L-glutamine synthetase  63.87 
 
 		 469 aa  635    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1904  glutamine synthetase type I  78.25 
 
 		 469 aa  789    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.394003 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4392  glutamine synthetase  64.74 
 
 		 469 aa  647    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.519647  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2770  glutamine synthetase, type I  63.25 
 
 		 471 aa  637    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2652  glutamine synthetase type I  65.02 
 
 		 469 aa  657    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127344  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2853  glutamine synthetase, type I  69.38 
 
 		 469 aa  691    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.725754  normal  0.0528794 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0147  L-glutamine synthetase  65.25 
 
 		 469 aa  657    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0281822  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2318  glutamine synthetase  63.89 
 
 		 469 aa  639    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5458  L-glutamine synthetase  63.25 
 
 		 471 aa  639    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4581  L-glutamine synthetase  77.56 
 
 		 469 aa  785    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.163262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1389  glutamine synthetase, type I  93.18 
 
 		 469 aa  925    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.737079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1344  glutamine synthetase, type I  65.03 
 
 		 469 aa  655    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5002  glutamine synthetase, type I  64.53 
 
 		 471 aa  649    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2059  glutamine synthetase, type I  62.82 
 
 		 471 aa  637    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0027  glutamine synthetase  63.68 
 
 		 469 aa  639    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3585  glutamine synthetase, type I  72.92 
 
 		 471 aa  745    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.110089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4097  glutamine synthetase  64.74 
 
 		 469 aa  647    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2288  glutamine synthetase, type I  64.52 
 
 		 469 aa  646    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2086  L-glutamine synthetase  66.74 
 
 		 469 aa  677    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0733  glutamine synthetase, type I  80.81 
 
 		 469 aa  820    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.02678  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1217  glutamine synthetase, type I  65.17 
 
 		 471 aa  647    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1086  glutamine synthetase, type I  64.09 
 
 		 471 aa  646    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1844  glutamine synthetase, type I  63.03 
 
 		 471 aa  637    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.43293  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3057  glutamine synthetase, type I  69.55 
 
 		 477 aa  694    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00588  glutamine synthetase  63.89 
 
 		 469 aa  644    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2558  glutamine synthetase, type I  78.42 
 
 		 469 aa  791    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0728767  normal  0.913477 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1108  L-glutamine synthetase  67.59 
 
 		 469 aa  690    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0181625  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5853  glutamine synthetase  65.73 
 
 		 469 aa  636    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.343891  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0030  glutamine synthetase  63.68 
 
 		 469 aa  639    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1515  L-glutamine synthetase  64.24 
 
 		 468 aa  645    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.274657 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2979  glutamine synthetase, type I  65.81 
 
 		 471 aa  651    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0502  L-glutamine synthetase  64.88 
 
 		 468 aa  651    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000000320948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2386  glutamine synthetase, type I  78.42 
 
 		 469 aa  788    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.35436  normal  0.41443 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2447  L-glutamine synthetase  65.16 
 
 		 469 aa  640    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000663157  normal  0.627603 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1807  L-glutamine synthetase  64.96 
 
 		 471 aa  649    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000345989 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1522  L-glutamine synthetase  63.03 
 
 		 471 aa  638    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000686427  normal  0.138561 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3581  glutamine synthetase, type I  65.17 
 
 		 471 aa  648    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3154  glutamine synthetase, type I  64.96 
 
 		 471 aa  651    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2901  glutamine synthetase, type I  78.85 
 
 		 469 aa  792    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0513537  normal  0.111483 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0243  L-glutamine synthetase  65.31 
 
 		 469 aa  646    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2234  glutamine synthetase, type I  78.42 
 
 		 469 aa  787    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.356963  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5127  glutamine synthetase, type I  75.69 
 
 		 469 aa  774    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.032898  normal  0.611689 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2062  L-glutamine synthetase  63.89 
 
 		 471 aa  644    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00147579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1022  L-glutamine synthetase  66.52 
 
 		 468 aa  667    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.562141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0149  glutamine synthetase, type I  67.52 
 
 		 470 aa  684    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5928  glutamine synthetase, type I  63.03 
 
 		 471 aa  639    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1780  glutamine synthetase, type I  65.25 
 
 		 469 aa  657    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.807075 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1025  glutamine synthetase  65.38 
 
 		 469 aa  649    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1544  L-glutamine synthetase  89.77 
 
 		 469 aa  898    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1839  glutamine synthetase  65.87 
 
 		 468 aa  667    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.724651  normal  0.76647 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3244  glutamine synthetase, type I  76.13 
 
 		 468 aa  768    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.877746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2333  glutamine synthetase, type I  76.76 
 
 		 469 aa  773    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.869582  normal  0.133369 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3315  glutamine synthetase, type I  78.85 
 
 		 469 aa  794    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.651786  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0013  L-glutamine synthetase  65.38 
 
 		 471 aa  653    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.778405 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2253  glutamine synthetase, type I  63.25 
 
 		 471 aa  637    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2087  glutamine synthetase, type I  88.49 
 
 		 469 aa  884    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1330  L-glutamine synthetase  72.35 
 
 		 467 aa  722    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.523028  normal  0.654119 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2186  glutamine synthetase, type I  62.82 
 
 		 471 aa  637    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.179605  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67600  glutamine synthetase  65.73 
 
 		 469 aa  636    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01591  glutamine synthetase  65.44 
 
 		 469 aa  649    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2149  glutamine synthetase, type I  63.03 
 
 		 471 aa  639    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0736  glutamine synthetase, type I  64.72 
 
 		 468 aa  644    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00218328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2167  glutamine synthetase, type I  63.03 
 
 		 471 aa  639    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4289  glutamine synthetase  64.74 
 
 		 469 aa  647    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.438385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6588  glutamine synthetase, type I  76.23 
 
 		 470 aa  768    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.601412 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2690  glutamine synthetase, type I  63.25 
 
 		 471 aa  637    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.363282  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4096  glutamine synthetase  64.1 
 
 		 469 aa  646    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4462  glutamine synthetase, type I  66.09 
 
 		 468 aa  662    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0756731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1524  glutamine synthetase, type I  63.25 
 
 		 471 aa  637    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3416  glutamine synthetase  66.03 
 
 		 469 aa  646    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.532289 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4396  glutamine synthetase  64.74 
 
 		 469 aa  647    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1122  glutamine synthetase, type I  62.82 
 
 		 471 aa  638    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.744153  normal  0.286491 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>