60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_1550 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_1550  lignin degradation protein  100 
 
 		 226 aa  460  1e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.355245  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0774  glutathione S-transferase domain-containing protein  60.55 
 
 		 229 aa  280  1e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.264601 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1223  Glutathione S-transferase domain protein  59.63 
 
 		 229 aa  272  3e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000515515 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1078  Glutathione S-transferase domain  58.72 
 
 		 229 aa  271  7e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000010734 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4143  glutathione S-transferase-like protein  49.29 
 
 		 231 aa  218  3.9999999999999997e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.595769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1788  putative glutathione S-transferase (GST)  50 
 
 		 229 aa  208  5e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4134  glutathione S-transferase-like  47.2 
 
 		 231 aa  208  6e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4820  Glutathione S-transferase domain  47.44 
 
 		 231 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.651391  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2357  glutathione S-transferase domain-containing protein  47.34 
 
 		 238 aa  198  5e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.396368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1599  glutathione S-transferase domain-containing protein  46.48 
 
 		 226 aa  197  2.0000000000000003e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0946501 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7062  Glutathione S-transferase domain protein  47.93 
 
 		 229 aa  193  2e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00932246  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6243  glutathione S-transferase domain-containing protein  46.08 
 
 		 229 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.247558 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2618  glutathione S-transferase domain protein  40.38 
 
 		 236 aa  167  2e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3099  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.48 
 
 		 232 aa  166  2.9999999999999998e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.937068  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2685  glutathione S-transferase-like protein  38.79 
 
 		 236 aa  163  2.0000000000000002e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.702474  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4017  glutathione S-transferase-like  38.46 
 
 		 232 aa  160  2e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.678212 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2863  putative lignin beta-etherase  40.76 
 
 		 222 aa  160  2e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.300835  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05770  Glutathione S-transferase-like protein  39.81 
 
 		 230 aa  145  5e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.765948  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1948  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.07 
 
 		 232 aa  145  7.0000000000000006e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1652  hypothetical protein  32.49 
 
 		 237 aa  122  5e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887044  normal  0.0204387 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2405  glutathione S-transferase-like  31.03 
 
 		 279 aa  106  3e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27580  putative glutathione S-transferase  32.2 
 
 		 220 aa  62  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.08808  decreased coverage  0.00115097 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00480  expressed protein  25.97 
 
 		 252 aa  58.5  0.00000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02948  glutathione S-transferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G07930)  23.79 
 
 		 268 aa  58.2  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2771  Glutathione S-transferase domain protein  28.08 
 
 		 225 aa  57.4  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00309034  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1907  glutathione S-transferase-like protein  28.78 
 
 		 263 aa  56.6  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0464392  normal  0.0635336 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2334  glutathione S-transferase  38.78 
 
 		 220 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0381359  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06190  putative glutathione S-transferase  28.89 
 
 		 249 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0166402 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0881  glutathione S-transferase domain protein  24.39 
 
 		 263 aa  52.8  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0898679  normal  0.46136 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1478  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.83 
 
 		 263 aa  52.8  0.000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.204587  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0854  Glutathione S-transferase domain protein  24.39 
 
 		 263 aa  52.8  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1914  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.57 
 
 		 220 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0652856  normal  0.568324 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1848  putative glutathione S-transferase-related protein  27.27 
 
 		 315 aa  52.4  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.417859 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0788  glutathione S-transferase  23.04 
 
 		 264 aa  52.4  0.000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.200068 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0579  putative glutathione S-transferase  36.73 
 
 		 249 aa  52.4  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02592  conserved hypothetical protein  24.51 
 
 		 271 aa  52  0.000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.121449  normal  0.298423 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2873  Glutathione S-transferase domain  36.67 
 
 		 260 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.606982  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3437  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.35 
 
 		 208 aa  50.4  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.303772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0523  Glutathione S-transferase domain protein  37.5 
 
 		 228 aa  48.9  0.00007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0507  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.5 
 
 		 228 aa  48.5  0.00008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.911631  normal  0.0384549 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2422  glutathione S-transferase-like protein  30.93 
 
 		 210 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0594947 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1744  Glutathione S-transferase domain protein  35.85 
 
 		 221 aa  47.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.662899  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5058  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.67 
 
 		 207 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000892035 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0753  Glutathione S-transferase domain protein  32.58 
 
 		 217 aa  45.8  0.0006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00015348 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2348  putative glutathione S-transferase  33.33 
 
 		 246 aa  45.4  0.0007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2090  maleylacetoacetate isomerase  31.18 
 
 		 213 aa  45.1  0.0008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0343  putative glutathione S-transferase  31.25 
 
 		 241 aa  45.1  0.0009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.889809  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5366  Glutathione S-transferase domain protein  29.37 
 
 		 207 aa  45.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.230494  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2563  putative glutathione S-transferase-related protein  26.46 
 
 		 312 aa  44.3  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.569618  normal  0.331421 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2490  putative glutathione S-transferase-related protein  26.03 
 
 		 313 aa  43.5  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3532  Glutathione S-transferase domain protein  23.63 
 
 		 217 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.150118 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26121  putative glutathione S-transferase  29.35 
 
 		 241 aa  43.5  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.551591 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1132  glutathione S-transferase family protein  26.96 
 
 		 224 aa  43.9  0.002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4998  glutathione S-transferase-like protein  32.22 
 
 		 223 aa  44.3  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0183331  normal  0.221223 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4995  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.38 
 
 		 218 aa  43.5  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000401874 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0885  glutathione S-transferase  26.96 
 
 		 224 aa  43.5  0.003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0233753  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3352  maleylacetoacetate isomerase  29.03 
 
 		 212 aa  43.5  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.41026 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2915  putative glutathione S-transferase-related protein  24.19 
 
 		 312 aa  42.7  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1478  putative glutathione S-transferase  21.35 
 
 		 239 aa  42.7  0.005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.184026  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01821  putative glutathione S-transferase  22.54 
 
 		 239 aa  42.4  0.006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0879846  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>