34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_C0081 on replicon NC_007412
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007412  Ava_C0081  DNA polymerase I-like  100 
 
 		 311 aa  637    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5509  DNA-directed DNA polymerase B  41.9 
 
 		 603 aa  243  3.9999999999999997e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.26262 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3187  DNA polymerase B, exonuclease  30.68 
 
 		 744 aa  96.7  5e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000163636 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3245  DNA polymerase II, putative  30.17 
 
 		 745 aa  95.1  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1412  DNA polymerase B region  29.84 
 
 		 785 aa  87.8  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0296  DNA polymerase B region  30.1 
 
 		 743 aa  85.9  7e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0413746  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0027  DNA polymerase B region  27.17 
 
 		 796 aa  84.7  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2799  DNA polymerase B region  26.23 
 
 		 735 aa  82  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0105637 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2007  DNA-directed DNA polymerase B  24.84 
 
 		 788 aa  81.3  0.00000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0006  DNA polymerase B region  26.55 
 
 		 811 aa  79.7  0.00000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0007  DNA polymerase B region  25.14 
 
 		 796 aa  78.6  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0006  DNA polymerase B region  26.26 
 
 		 800 aa  77  0.0000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0104933 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0006  cyclic nucleotide-binding protein  26.76 
 
 		 793 aa  76.6  0.0000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0005  DNA-directed DNA polymerase B  27.17 
 
 		 792 aa  76.6  0.0000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.775002  normal  0.276245 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0922  DNA-directed DNA polymerase  23.99 
 
 		 607 aa  63.2  0.000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.434202  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1316  DNA-directed DNA polymerase  24.64 
 
 		 784 aa  58.2  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.198282  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0798  DNA polymerase I  26.43 
 
 		 853 aa  55.8  0.0000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1320  DNA polymerase II  28.66 
 
 		 784 aa  55.5  0.000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.4978 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2154  DNA polymerase II  27.81 
 
 		 783 aa  55.1  0.000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000768017  hitchhiker  0.000641936 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0393  DNA polymerase II  21.09 
 
 		 794 aa  53.5  0.000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1361  DNA polymerase I  25.68 
 
 		 854 aa  52.8  0.000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0961  DNA polymerase II  26.38 
 
 		 785 aa  52.8  0.000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0816  DNA polymerase I  25.5 
 
 		 854 aa  52  0.00001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.766661  hitchhiker  0.00661096 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1049  DNA polymerase II  26.45 
 
 		 783 aa  50.8  0.00003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0144376 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2210  DNA polymerase II  24.46 
 
 		 782 aa  49.7  0.00007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.40989 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1342  DNA polymerase Pol2  22.57 
 
 		 781 aa  48.9  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.0000000227387  normal  0.522725 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1884  DNA polymerase II  24.73 
 
 		 786 aa  46.6  0.0005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.115615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2142  DNA polymerase II  28.19 
 
 		 789 aa  45.8  0.0008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.249301  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2300  DNA polymerase B region  27.13 
 
 		 552 aa  45.4  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2482  DNA polymerase II  24.69 
 
 		 795 aa  44.3  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.205655  hitchhiker  0.00219855 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1444  DNA polymerase B region  22.98 
 
 		 562 aa  43.9  0.003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0144  DNA polymerase I  23.74 
 
 		 871 aa  43.9  0.004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.248865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003097  DNA polymerase II  26.11 
 
 		 787 aa  43.5  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000122511  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1258  replicative DNA polymerase I  25.4 
 
 		 780 aa  42.4  0.009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>