More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0610 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_0610  ribosome-binding factor A  100 
 
 		 128 aa  259  8.999999999999999e-69  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0012936  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0990  ribosome-binding factor A  51.28 
 
 		 123 aa  119  9.999999999999999e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.645083  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3675  ribosome-binding factor A  42.97 
 
 		 125 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2049  ribosome-binding factor A  47.97 
 
 		 127 aa  111  3e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1157  ribosome-binding factor A  48.67 
 
 		 126 aa  106  9.000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000826248  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1445  ribosome-binding factor A  40.62 
 
 		 131 aa  106  9.000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000145103  normal  0.2265 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1644  ribosome-binding factor A  42.37 
 
 		 119 aa  106  1e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0458  ribosome-binding factor A  47.66 
 
 		 117 aa  105  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1051  ribosome-binding factor A  42.11 
 
 		 122 aa  104  4e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000570949  hitchhiker  0.000000154001 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0901  hypothetical protein  38.21 
 
 		 122 aa  103  6e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1335  ribosome-binding factor A  45.45 
 
 		 118 aa  103  7e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0231832  hitchhiker  0.00144693 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3633  ribosome-binding factor A  45.45 
 
 		 118 aa  103  7e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0539851  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3909  ribosome-binding factor A  45.45 
 
 		 118 aa  103  7e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.391027  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1956  ribosome-binding factor A  38.33 
 
 		 120 aa  103  9e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0818  ribosome-binding factor A  45.3 
 
 		 133 aa  102  1e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0100863 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3552  ribosome-binding factor A  44.63 
 
 		 118 aa  102  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3570  ribosome-binding factor A  44.63 
 
 		 118 aa  102  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3822  ribosome-binding factor A  44.63 
 
 		 118 aa  102  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.3299500000000005e-63 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07850  ribosome-binding factor A  42.34 
 
 		 122 aa  101  3e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3849  ribosome-binding factor A  44.63 
 
 		 118 aa  101  4e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3662  ribosome-binding factor A  44.63 
 
 		 118 aa  101  4e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118279  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3948  ribosome-binding factor A  44.63 
 
 		 118 aa  101  4e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0837  ribosome-binding factor A  42.86 
 
 		 116 aa  100  5e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2463  ribosome-binding factor A  44.63 
 
 		 118 aa  100  5e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0350107  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1330  ribosome-binding factor A  42.02 
 
 		 130 aa  100  5e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.285304  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1356  ribosome-binding factor A  42.02 
 
 		 116 aa  100  6e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.348543  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2204  ribosome-binding factor A  40.65 
 
 		 142 aa  99.8  1e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3858  ribosome-binding factor A  43.8 
 
 		 118 aa  99.8  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000036841  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0815  ribosome-binding factor A  44.88 
 
 		 123 aa  99.8  1e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0116201  normal  0.0354189 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5461  ribosome-binding factor A  37.6 
 
 		 128 aa  98.6  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.74875  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1004  ribosome-binding factor A  37.29 
 
 		 129 aa  98.6  3e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.439697  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002610  ribosome-binding factor A  42.37 
 
 		 131 aa  97.8  5e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03395  ribosome-binding factor A  40.98 
 
 		 137 aa  96.7  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3607  ribosome-binding factor A  36.51 
 
 		 129 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.858095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1939  ribosome-binding factor A  45.37 
 
 		 116 aa  96.3  1e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1657  ribosome-binding factor A  45.37 
 
 		 116 aa  96.3  1e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0726  ribosome-binding factor A  35.65 
 
 		 147 aa  96.3  1e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.237747  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3187  ribosome-binding factor A  40.34 
 
 		 119 aa  95.1  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.11601  normal  0.332882 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1947  ribosome-binding factor A  36.07 
 
 		 130 aa  94.4  5e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0382472 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62740  ribosome-binding factor A  38.14 
 
 		 129 aa  94.4  5e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.232446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0822  ribosome-binding factor A  39.2 
 
 		 126 aa  92.8  1e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.329178  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0991  ribosome-binding factor A  38.84 
 
 		 143 aa  93.2  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2773  ribosome-binding factor A  39.68 
 
 		 136 aa  92.4  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0175  ribosome-binding factor A  40.98 
 
 		 136 aa  92  2e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.146816  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1008  ribosome-binding factor A  39.67 
 
 		 142 aa  92  2e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.211982  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42810  ribosome-binding factor A  35.59 
 
 		 129 aa  92.4  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0696  ribosome-binding factor A  33.62 
 
 		 124 aa  92  3e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.146266  normal  0.222032 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3073  ribosome-binding factor A  37.39 
 
 		 131 aa  91.7  3e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.729556  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01271  ribosome-binding factor A  34.65 
 
 		 130 aa  91.3  4e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1480  ribosome-binding factor A  40 
 
 		 123 aa  91.3  4e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.243092  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3464  ribosome-binding factor A  38.46 
 
 		 133 aa  91.3  4e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0490  ribosome-binding factor A  39.17 
 
 		 136 aa  90.9  5e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.509602  normal  0.0536804 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4711  ribosome-binding factor A  34.19 
 
 		 132 aa  90.9  6e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.31631 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0722  ribosome-binding factor A  34.19 
 
 		 132 aa  90.5  6e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.041956 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4711  ribosome-binding factor A  34.19 
 
 		 132 aa  90.5  7e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.165962  hitchhiker  0.00698134 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0809  ribosome-binding factor A  38.46 
 
 		 132 aa  90.5  7e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4576  ribosome-binding factor A  34.19 
 
 		 132 aa  90.5  7e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.63413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3994  ribosome-binding factor A  37.5 
 
 		 136 aa  90.1  9e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.405974  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1052  ribosome-binding factor A  42.86 
 
 		 132 aa  90.1  9e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000164371  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3595  ribosome-binding factor A  37.5 
 
 		 136 aa  90.1  9e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000837981  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3729  ribosome-binding factor A  37.5 
 
 		 136 aa  90.1  9e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0092978  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0586  ribosome-binding factor A  37.07 
 
 		 132 aa  89.7  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.309895  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0780  ribosome-binding factor A  34.45 
 
 		 133 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000489115  normal  0.0558247 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3345  ribosome-binding factor A  37.07 
 
 		 132 aa  89.7  1e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.970615  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0909  ribosome-binding factor A  35.83 
 
 		 121 aa  89.7  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1092  ribosome-binding factor A  39.84 
 
 		 146 aa  89.4  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0591977 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1031  ribosome-binding factor A  39.84 
 
 		 146 aa  90.1  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.571877  hitchhiker  0.000026303 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01851  ribosome-binding factor A  39.81 
 
 		 123 aa  88.6  2e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.30308  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1205  ribosome-binding factor A  38.84 
 
 		 147 aa  89  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4489  ribosome-binding factor A  33.61 
 
 		 138 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0856583  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0477  ribosome-binding factor A  39.09 
 
 		 126 aa  89.4  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00670849  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1027  ribosome-binding factor A  39.84 
 
 		 146 aa  89.4  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000106496 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03034  ribosome-binding factor A  38.98 
 
 		 133 aa  88.2  3e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.710808  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0538  ribosome-binding factor A  38.98 
 
 		 133 aa  88.2  3e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1028  ribosome-binding factor A  38.84 
 
 		 129 aa  88.6  3e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0189385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3651  ribosome-binding factor A  38.98 
 
 		 133 aa  88.2  3e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02985  hypothetical protein  38.98 
 
 		 133 aa  88.2  3e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.757266  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3359  ribosome-binding factor A  38.98 
 
 		 133 aa  88.2  3e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3463  ribosome-binding factor A  38.98 
 
 		 133 aa  88.2  3e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.287723 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4488  ribosome-binding factor A  38.98 
 
 		 133 aa  88.2  3e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3604  ribosome-binding factor A  38.98 
 
 		 133 aa  88.2  3e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0531  ribosome-binding factor A  38.98 
 
 		 133 aa  88.2  3e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000335299 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4179  ribosome-binding factor A  32.23 
 
 		 138 aa  87.8  5e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.308306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2350  ribosome-binding factor A  35.45 
 
 		 140 aa  87.8  5e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.840269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1436  ribosome-binding factor A  39.84 
 
 		 118 aa  87.4  6e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.349731  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1696  ribosome-binding factor A  38.66 
 
 		 138 aa  87.4  6e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3543  ribosome-binding factor A  37.07 
 
 		 133 aa  87.4  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3580  ribosome-binding factor A  37.07 
 
 		 133 aa  87.4  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0927  ribosome-binding factor A  43.93 
 
 		 119 aa  87  8e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.100451  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0158  ribosome-binding factor A  35.11 
 
 		 140 aa  87  9e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3347  ribosome-binding factor A  34.88 
 
 		 143 aa  86.3  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0341  ribosome-binding factor A  35.19 
 
 		 134 aa  86.3  1e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3642  ribosome-binding factor A  38.14 
 
 		 133 aa  86.7  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1863  ribosome-binding factor A  34.45 
 
 		 126 aa  86.7  1e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3474  ribosome-binding factor A  38.14 
 
 		 133 aa  86.7  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1661  ribosome-binding factor A  38.53 
 
 		 121 aa  86.3  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.661527  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3474  ribosome-binding factor A  36.21 
 
 		 133 aa  86.3  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0070  ribosome-binding factor A  34.56 
 
 		 134 aa  85.9  2e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.196892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26151  ribosome-binding factor A  36.11 
 
 		 142 aa  85.9  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.549053 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0962  ribosome-binding factor A  38.46 
 
 		 137 aa  85.9  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.394859  normal  0.0786715 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>