More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_1050 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011725  BCB4264_A4995  glycogen phosphorylase  45.86 
 
 		 802 aa  695    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4976  glycogen phosphorylase  45.74 
 
 		 802 aa  688    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2066  glycogen phosphorylase  44.81 
 
 		 836 aa  637    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.149852  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2411  glycogen phosphorylase  45.3 
 
 		 817 aa  672    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.141999  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0242  glycogen phosphorylase  45.49 
 
 		 802 aa  689    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0239984  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5024  glycogen phosphorylase  45.98 
 
 		 802 aa  694    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0359  Phosphorylase  44.38 
 
 		 824 aa  641    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.262429  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4757  glycogen phosphorylase  45.74 
 
 		 802 aa  688    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4595  glycogen phosphorylase  45.74 
 
 		 802 aa  689    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4617  glycogen phosphorylase  45.74 
 
 		 802 aa  688    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.706651  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0789  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  46.08 
 
 		 818 aa  679    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4706  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  45.24 
 
 		 802 aa  682    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1105  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  43.11 
 
 		 808 aa  638    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2722  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  47 
 
 		 843 aa  637    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.121035 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0940  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  44.3 
 
 		 838 aa  641    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3391  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  46.86 
 
 		 843 aa  636    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5119  glycogen phosphorylase  45.74 
 
 		 802 aa  688    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1983  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  44.61 
 
 		 836 aa  653    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000313415  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3500  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  45.12 
 
 		 802 aa  690    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3199  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  51.42 
 
 		 811 aa  784    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1446  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  47.42 
 
 		 818 aa  687    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0562  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  45.85 
 
 		 804 aa  682    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0083  glycogen phosphorylase  48.38 
 
 		 811 aa  726    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0558  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  42.55 
 
 		 828 aa  650    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.371479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5005  glycogen phosphorylase  45.98 
 
 		 802 aa  694    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3694  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  45.65 
 
 		 849 aa  637    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.363758 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0176  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  42.47 
 
 		 828 aa  635    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.23902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0727  glycogen phosphorylase  47.01 
 
 		 800 aa  716    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0939464  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1798  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  45.9 
 
 		 828 aa  667    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.362346  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0554  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  46.76 
 
 		 820 aa  712    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02552  putative maltodextrin phosphorylase  43.08 
 
 		 837 aa  639    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0284872  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0411  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  44.11 
 
 		 827 aa  642    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.908979  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1705  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  45.06 
 
 		 834 aa  647    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1050  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  100 
 
 		 809 aa  1680    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0879  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  45.54 
 
 		 846 aa  632  1e-180  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.400969  normal  0.0261229 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1023  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  45.54 
 
 		 846 aa  632  1e-180  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0471814 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1244  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  45.48 
 
 		 833 aa  630  1e-179  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0518107 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3790  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  45.02 
 
 		 817 aa  632  1e-179  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.727667 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2235  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  43.46 
 
 		 842 aa  626  1e-178  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1470  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  44.38 
 
 		 832 aa  626  1e-178  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0341159 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1992  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  42.56 
 
 		 842 aa  627  1e-178  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000769709 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2446  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  43.62 
 
 		 832 aa  624  1e-177  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00073927  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2056  phosphorylase  45.13 
 
 		 837 aa  624  1e-177  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.258287 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0864  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  44.49 
 
 		 841 aa  624  1e-177  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0913  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  44.49 
 
 		 841 aa  624  1e-177  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.910975  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0909  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  44.61 
 
 		 841 aa  625  1e-177  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.631457  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2246  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  43.51 
 
 		 824 aa  622  1e-176  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.71978  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3758  glycogen phosphorylase  44.29 
 
 		 822 aa  620  1e-176  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5267  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  42.75 
 
 		 839 aa  619  1e-176  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0440049  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2197  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  42.3 
 
 		 831 aa  620  1e-176  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.100797  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1891  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  44.05 
 
 		 842 aa  620  1e-176  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.391259 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0228  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  44.79 
 
 		 831 aa  618  1e-175  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2201  phosphorylase  43.51 
 
 		 817 aa  616  1e-175  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.511282 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5144  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  42.73 
 
 		 827 aa  617  1e-175  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.117324  normal  0.797605 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1520  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  42.13 
 
 		 829 aa  617  1e-175  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0549278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0415  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  45.32 
 
 		 833 aa  616  1e-175  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1192  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  45.33 
 
 		 840 aa  618  1e-175  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.823471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2661  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  44.92 
 
 		 837 aa  613  9.999999999999999e-175  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0527  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  44.13 
 
 		 828 aa  613  9.999999999999999e-175  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0685  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  44.13 
 
 		 828 aa  613  9.999999999999999e-175  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0757795  hitchhiker  0.000741199 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4232  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  42.61 
 
 		 848 aa  613  9.999999999999999e-175  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5966  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  43.49 
 
 		 817 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.684528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0192  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  41.76 
 
 		 843 aa  613  9.999999999999999e-175  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.96757 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3952  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  44.24 
 
 		 859 aa  614  9.999999999999999e-175  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.731107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0218  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  43.02 
 
 		 850 aa  615  9.999999999999999e-175  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.372597 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17030  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  43.79 
 
 		 814 aa  613  9.999999999999999e-175  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04849  maltodextrin phosphorylase  41.29 
 
 		 817 aa  613  9.999999999999999e-175  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5031  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  44.89 
 
 		 845 aa  611  1e-173  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.520735 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0921  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  45.53 
 
 		 839 aa  610  1e-173  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0938734  normal  0.606568 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1771  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  43.74 
 
 		 832 aa  609  1e-173  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000106696 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0227  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  43.69 
 
 		 815 aa  611  1e-173  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0255274  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2767  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  42.63 
 
 		 835 aa  610  1e-173  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0513  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  41.67 
 
 		 833 aa  610  1e-173  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000569061  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0244  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  42.66 
 
 		 844 aa  610  1e-173  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.336061  normal  0.79007 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0880  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  42.82 
 
 		 834 aa  610  1e-173  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.151922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1594  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  41.82 
 
 		 870 aa  608  1e-173  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.113727 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3347  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  43.19 
 
 		 820 aa  608  9.999999999999999e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3076  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  42.04 
 
 		 840 aa  608  9.999999999999999e-173  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0428621 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2334  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  42.38 
 
 		 847 aa  607  9.999999999999999e-173  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2244  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  42.5 
 
 		 826 aa  607  9.999999999999999e-173  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.238085  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3854  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  43.19 
 
 		 829 aa  607  9.999999999999999e-173  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1322  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  44.58 
 
 		 864 aa  607  9.999999999999999e-173  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2385  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  42.38 
 
 		 847 aa  607  9.999999999999999e-173  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45650  glycogen phosphorylase  43.54 
 
 		 815 aa  608  9.999999999999999e-173  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2163  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  42.38 
 
 		 838 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2957  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  44.73 
 
 		 838 aa  607  9.999999999999999e-173  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.815892 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44172  predicted protein  41.46 
 
 		 876 aa  608  9.999999999999999e-173  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.079411 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25951  phosphorylase  42.12 
 
 		 841 aa  607  9.999999999999999e-173  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01015  hypothetical protein similar to glycogen phosphorylase 1 (Broad)  41.08 
 
 		 879 aa  603  1.0000000000000001e-171  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.202732 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2739  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  41.84 
 
 		 821 aa  604  1.0000000000000001e-171  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0182  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  40.37 
 
 		 840 aa  603  1.0000000000000001e-171  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3118  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  41.99 
 
 		 793 aa  602  1.0000000000000001e-171  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.986953  normal  0.22362 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0989  phosphorylase  43.34 
 
 		 816 aa  602  1.0000000000000001e-171  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.245423 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3649  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  42.75 
 
 		 820 aa  605  1.0000000000000001e-171  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2540  glycogen phosphorylase  44.2 
 
 		 836 aa  600  1e-170  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.461812  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2115  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  43.3 
 
 		 833 aa  601  1e-170  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.180252  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2508  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  44.46 
 
 		 822 aa  601  1e-170  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.372187  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6361  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  44.76 
 
 		 832 aa  599  1e-170  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0196426  normal  0.63045 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4043  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  43.02 
 
 		 859 aa  599  1e-170  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.160668  normal  0.103786 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2932  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  43.29 
 
 		 837 aa  601  1e-170  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>