38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0050 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0050  hypothetical protein  100 
 
 		 251 aa  519  1e-146  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1755  hydrolase or acyltransferase  32.44 
 
 		 258 aa  124  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.639278  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1776  hypothetical protein  30.8 
 
 		 258 aa  122  7e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0274205  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1914  hypothetical protein  30.8 
 
 		 258 aa  122  7e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0234927  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1733  hydrolase or acyltransferase  30.8 
 
 		 258 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0207181  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2045  alpha/beta hydrolase fold protein  27.39 
 
 		 243 aa  119  4.9999999999999996e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.083987 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1788  hydrolase or acyltransferase  30.22 
 
 		 258 aa  117  3e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000680312  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0027  hydrolase, alpha/beta superfamily, CesH  29.44 
 
 		 260 aa  109  5e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1270  alpha/beta hydrolase fold protein  29.96 
 
 		 262 aa  108  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000273364  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5049  hypothetical protein  27.71 
 
 		 247 aa  104  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.82888  normal  0.0566576 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0713  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  25.6 
 
 		 248 aa  60.8  0.00000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.702118  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2481  alpha/beta hydrolase fold protein  21.72 
 
 		 253 aa  60.8  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0532502  normal  0.345271 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3691  putative hydrolase  22.73 
 
 		 259 aa  58.9  0.00000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.236062 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05300  hypothetical protein  21.63 
 
 		 249 aa  52.8  0.000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3143  alpha/beta hydrolase fold protein  22.35 
 
 		 265 aa  51.6  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3963  hypothetical protein  31.91 
 
 		 260 aa  50.8  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0379  alpha/beta hydrolase fold  20.59 
 
 		 327 aa  46.6  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4553  alpha/beta hydrolase fold  29.25 
 
 		 275 aa  45.4  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.780124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2049  alpha/beta hydrolase fold  27.52 
 
 		 262 aa  45.4  0.0009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0531  alpha/beta hydrolase fold  19.53 
 
 		 264 aa  45.4  0.0009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0176995 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2194  alpha/beta hydrolase fold protein  18.11 
 
 		 350 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.984262  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0348  magnesium chelatase accessory protein  21.31 
 
 		 322 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.80309  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0558  alpha/beta hydrolase fold  22.03 
 
 		 338 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2963  alpha/beta fold family hydrolase  28.57 
 
 		 294 aa  43.9  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0480024  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1832  magnesium chelatase accessory protein  29.79 
 
 		 302 aa  43.9  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0474032 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3187  alpha/beta fold family hydrolase  28.57 
 
 		 294 aa  43.9  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3194  hydrolase, alpha/beta fold family  27.1 
 
 		 294 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22460  alpha/beta family hydrolase  26.55 
 
 		 275 aa  43.1  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.241397  hitchhiker  0.0000000538784 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2954  hydrolase  28.57 
 
 		 294 aa  42.7  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000251178  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1900  putative hydrolase  26.13 
 
 		 275 aa  42.7  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.118605  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3235  magnesium chelatase accessory protein  26.63 
 
 		 301 aa  42.7  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3010  magnesium chelatase accessory protein  26.47 
 
 		 299 aa  42.7  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.219603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0909  alpha/beta hydrolase fold  28.3 
 
 		 267 aa  42  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0222  alpha/beta hydrolase fold  28.72 
 
 		 308 aa  42.4  0.008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.267301 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1736  Alpha/beta hydrolase fold-1  17.42 
 
 		 320 aa  42  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2629  alpha/beta hydrolase fold protein  25 
 
 		 263 aa  42  0.009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000794828  hitchhiker  0.00279844 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0763  alpha/beta fold family hydrolase  30.99 
 
 		 323 aa  42  0.009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2065  magnesium chelatase accessory protein  30.85 
 
 		 384 aa  42  0.01  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.178825 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>