More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1896 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_1896  histone family protein DNA-binding protein  100 
 
 		 89 aa  176  8e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0115  histone family protein DNA-binding protein  51.69 
 
 		 95 aa  93.2  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.552761  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3089  transcriptional regulator HU subunit beta  51.69 
 
 		 90 aa  91.7  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  1.42002e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3051  transcriptional regulator HU subunit beta  51.69 
 
 		 90 aa  91.7  3e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00488463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3231  transcriptional regulator HU subunit beta  51.69 
 
 		 90 aa  91.7  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1227  HU family DNA-binding protein  51.69 
 
 		 90 aa  91.7  3e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000165625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0510  transcriptional regulator HU subunit beta  53.93 
 
 		 90 aa  90.9  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0507646  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0500  transcriptional regulator HU subunit beta  53.93 
 
 		 90 aa  90.9  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.332585  normal  0.0268714 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0554  transcriptional regulator HU subunit beta  53.93 
 
 		 90 aa  90.9  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00736621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0491  transcriptional regulator HU subunit beta  53.93 
 
 		 90 aa  90.9  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0126716  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0493  transcriptional regulator HU subunit beta  53.93 
 
 		 90 aa  90.9  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.107938  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00392  HU, DNA-binding transcriptional regulator, beta subunit  52.81 
 
 		 90 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3169  histone family protein DNA-binding protein  52.81 
 
 		 90 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000005828  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0517  transcriptional regulator HU subunit beta  52.81 
 
 		 90 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000441181  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0526  transcriptional regulator HU subunit beta  52.81 
 
 		 90 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00026983  normal  0.698185 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0483  transcriptional regulator HU subunit beta  52.81 
 
 		 90 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000219434  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00396  hypothetical protein  52.81 
 
 		 90 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0476  transcriptional regulator HU subunit beta  52.81 
 
 		 90 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000220916  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3192  transcriptional regulator HU subunit beta  52.81 
 
 		 90 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0216859  hitchhiker  0.00242013 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0083  DNA-binding protein HU (DNA-binding protein II)  50.56 
 
 		 90 aa  89.7  1e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0363  transcriptional regulator HU subunit beta  52.81 
 
 		 90 aa  89.7  1e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00017145  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1041  DNA-binding protein HU  53.93 
 
 		 90 aa  89.4  2e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.436255  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1530  histone family protein DNA-binding protein  53.93 
 
 		 90 aa  89.4  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.277737  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1560  histone family protein DNA-binding protein  53.93 
 
 		 90 aa  89.4  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.768925  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0075  histone family protein DNA-binding protein  51.69 
 
 		 91 aa  89  2e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2285  histone family protein DNA-binding protein  49.44 
 
 		 90 aa  88.2  3e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0556838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0135  histone family protein DNA-binding protein  52.81 
 
 		 91 aa  87.8  4e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00267128  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1629  DNA-binding protein HU, form B  51.69 
 
 		 92 aa  87.4  5e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0004  DNA-binding protein HU-alpha  51.69 
 
 		 92 aa  87.4  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2972  DNA-binding protein HU-alpha  51.69 
 
 		 92 aa  87.4  5e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2913  DNA-binding protein HU, form B  51.69 
 
 		 92 aa  87.4  5e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.5361  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0004  DNA-binding protein HU-alpha  51.69 
 
 		 92 aa  87.4  5e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0004  DNA-binding protein HU-alpha  51.69 
 
 		 126 aa  87.4  5e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3397  DNA-binding protein HU, form B  51.69 
 
 		 92 aa  87.4  5e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.218557  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2658  histone family protein DNA-binding protein  51.69 
 
 		 90 aa  87.4  5e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000180426  normal  0.730265 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1596  histone family protein DNA-binding protein  51.69 
 
 		 90 aa  87.4  6e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000169185  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2747  histone family protein DNA-binding protein  51.69 
 
 		 90 aa  87.4  6e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000276504  normal  0.581764 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1797  HU family DNA-binding protein  51.69 
 
 		 90 aa  87.4  6e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1630  histone family protein DNA-binding protein  51.69 
 
 		 90 aa  87.4  6e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000159632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1493  histone family protein DNA-binding protein  51.69 
 
 		 90 aa  87.4  6e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000000388309  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2492  histone family protein DNA-binding protein  51.69 
 
 		 90 aa  87.4  6e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000348442  normal  0.0842071 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2560  histone family protein DNA-binding protein  51.69 
 
 		 90 aa  87.4  6e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000135506  normal  0.0536414 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1607  histone family protein DNA-binding protein  51.69 
 
 		 90 aa  87.4  6e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000022491  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1626  histone family protein DNA-binding protein  47.19 
 
 		 90 aa  87.4  6e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000133039  hitchhiker  0.00000000638901 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0084  histone family protein DNA-binding protein  51.69 
 
 		 92 aa  87.4  7e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0065  histone family protein DNA-binding protein  51.69 
 
 		 92 aa  87.4  7e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0066  histone family protein DNA-binding protein  51.69 
 
 		 92 aa  87.4  7e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3247  histone-like DNA-binding protein  51.69 
 
 		 92 aa  87.4  7e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.704477 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0005  histone-like DNA-binding protein  51.69 
 
 		 92 aa  87.4  7e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.129264  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0055  histone family protein DNA-binding protein  51.69 
 
 		 92 aa  87.4  7e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0065  histone family protein DNA-binding protein  51.69 
 
 		 92 aa  87.4  7e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1666  histone family protein DNA-binding protein  50.56 
 
 		 90 aa  86.7  9e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3933  histone family protein DNA-binding protein  51.69 
 
 		 92 aa  86.7  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0687  histone family protein DNA-binding protein  51.69 
 
 		 91 aa  86.7  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.105584  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3067  histone family protein DNA-binding protein  51.69 
 
 		 92 aa  86.7  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0353619 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2873  transcriptional regulator HU subunit beta  49.44 
 
 		 90 aa  86.7  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1474  putative DNA-binding protein HU-beta  49.44 
 
 		 90 aa  86.7  1e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000997119  hitchhiker  0.0000985943 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00213  DNA-binding protein  52.81 
 
 		 101 aa  86.3  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4504  DNA-binding protein HU-alpha  51.69 
 
 		 92 aa  86.7  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.806931 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1653  histone-like DNA-binding protein  49.44 
 
 		 90 aa  86.7  1e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000047794  unclonable  0.0000440637 
 
 
 
NC_012917  PC1_1051  transcriptional regulator HU subunit beta  48.31 
 
 		 90 aa  85.5  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.593082  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23600  histone-like DNA-binding protein  52.81 
 
 		 90 aa  85.5  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0085  nucleoid protein Hbs  51.69 
 
 		 91 aa  85.5  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0539634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3261  transcriptional regulator HU subunit beta  48.31 
 
 		 90 aa  85.5  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3065  transcriptional regulator HU subunit beta  48.31 
 
 		 90 aa  85.1  3e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002182  DNA-binding protein HU-alpha  51.69 
 
 		 90 aa  85.1  3e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.131368  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0186  histone family protein DNA-binding protein  51.69 
 
 		 90 aa  85.1  3e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2650  DNA-binding protein HU  52.81 
 
 		 90 aa  85.1  3e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1098  histone family protein DNA-binding protein  49.44 
 
 		 101 aa  85.1  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00970005  hitchhiker  0.00000236625 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3110  histone family protein DNA-binding protein  49.44 
 
 		 90 aa  85.5  3e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000105676  hitchhiker  0.00000299463 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0907  transcriptional regulator HU subunit beta  50.56 
 
 		 90 aa  84.7  4e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0908162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3085  histone family protein DNA-binding protein  50.56 
 
 		 91 aa  84.7  4e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000115471  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1837  histone family protein DNA-binding protein  52.81 
 
 		 90 aa  84.3  4e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00431989  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2678  histone family protein DNA-binding protein  50.56 
 
 		 90 aa  84.7  4e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000589622  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3781  HU family DNA-binding protein  49.44 
 
 		 90 aa  84.3  5e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.0095051  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0600  histone family protein DNA-binding protein  48.31 
 
 		 90 aa  84.3  5e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0791658  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2154  histone family protein DNA-binding protein  50.56 
 
 		 90 aa  84.3  5e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000552537  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0500  histone family protein DNA-binding protein  48.31 
 
 		 90 aa  84.3  5e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000759527 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1611  nucleoid protein HU beta subunit  52.81 
 
 		 90 aa  84.3  5e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000132089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2593  histone family protein DNA-binding protein  49.44 
 
 		 91 aa  84.3  5e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173721  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2043  histone-like DNA-binding protein  49.44 
 
 		 90 aa  84  6e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0894  nucleoid DNA-binding protein  51.14 
 
 		 91 aa  84  6e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  8.08972e-16  hitchhiker  0.000000000000265027 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3710  transcriptional regulator HU subunit alpha  51.69 
 
 		 90 aa  84  6e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.273113  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1544  histone family protein DNA-binding protein  49.44 
 
 		 90 aa  84  7e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000007734  hitchhiker  0.000745392 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2053  nucleoid protein HU beta subunit  51.69 
 
 		 90 aa  84  7e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000457213  normal  0.0670315 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0465  histone family protein DNA-binding protein  49.44 
 
 		 90 aa  84  7e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2505  histone family protein DNA-binding protein  48.31 
 
 		 90 aa  83.6  8e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000791734  normal  0.581146 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0860  histone family protein DNA-binding protein  51.69 
 
 		 90 aa  83.6  8e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0124999  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3133  histone-like DNA-binding protein  48.31 
 
 		 90 aa  83.6  8e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000045924  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1010  nucleoid protein Hbs  51.14 
 
 		 91 aa  83.6  8e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.301873  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2058  histone-like DNA-binding protein  48.31 
 
 		 90 aa  83.6  9e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.954956  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3864  transcriptional regulator HU subunit alpha  50.56 
 
 		 90 aa  82.8  0.000000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.78216  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2879  histone family protein DNA-binding protein  49.44 
 
 		 90 aa  82.8  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3493  DNA-binding protein HU  51.69 
 
 		 90 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.175993  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2492  histone-like DNA-binding protein  48.31 
 
 		 90 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00401844  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41210  DNA-binding protein HU  51.69 
 
 		 90 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0758892  normal  0.416187 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0942  histone family protein DNA-binding protein  48.31 
 
 		 90 aa  82.8  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2621  histone family protein DNA-binding protein  49.44 
 
 		 90 aa  82.4  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.348082  normal  0.0833374 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0324  histone family protein DNA-binding protein  48.31 
 
 		 90 aa  82  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.064189  normal  0.0110025 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1187  histone family protein DNA-binding protein  49.44 
 
 		 90 aa  82.4  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>