More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0691 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_0691  thioredoxin  100 
 
 		 105 aa  216  1e-55  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0904  thioredoxin  58.1 
 
 		 105 aa  133  6.0000000000000005e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000201022  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0180  thioredoxin  56.12 
 
 		 115 aa  130  3.9999999999999996e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0373  thioredoxin  58.7 
 
 		 105 aa  127  5.0000000000000004e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31565  predicted protein  52.38 
 
 		 123 aa  127  6e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0338  thioredoxin  58.95 
 
 		 108 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04950  thioredoxin  54.29 
 
 		 105 aa  125  2.0000000000000002e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0404  thioredoxin  59.78 
 
 		 109 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000190247  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0404  thioredoxin  59.78 
 
 		 109 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.986075 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11291  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  56.99 
 
 		 148 aa  124  5e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.554772 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1138  thioredoxin  53.47 
 
 		 106 aa  124  5e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.898127  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0867  thioredoxin  54.46 
 
 		 105 aa  124  5e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.800963  hitchhiker  0.0030343 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0621  thioredoxin  50 
 
 		 108 aa  123  7e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000184635  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0691  thioredoxin  55.91 
 
 		 107 aa  123  1e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0127  thioredoxin  58.33 
 
 		 108 aa  122  1e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000655412  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1673  thioredoxin  54.08 
 
 		 109 aa  122  1e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.172284  hitchhiker  0.000827642 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1372  thioredoxin  50.51 
 
 		 110 aa  123  1e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00473089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15251  thioredoxin  55.91 
 
 		 107 aa  123  1e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1358  thioredoxin  53.68 
 
 		 107 aa  122  1e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0363  thioredoxin  61.11 
 
 		 109 aa  122  2e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000145924  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3952  thioredoxin  57.89 
 
 		 108 aa  122  2e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0816  thioredoxin  58.62 
 
 		 107 aa  122  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3877  thioredoxin  57.89 
 
 		 108 aa  122  2e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000866569 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4070  thioredoxin  57.89 
 
 		 108 aa  122  2e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.282643 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1908  thioredoxin  53.61 
 
 		 106 aa  122  2e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00177252  normal  0.288463 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3929  thioredoxin  57.89 
 
 		 108 aa  122  2e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0921  thioredoxin  48 
 
 		 107 aa  121  3e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000445063  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2496  thioredoxin  56.82 
 
 		 109 aa  120  4e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.182202  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09121  thioredoxin  49.04 
 
 		 107 aa  120  5e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0448  thioredoxin  56.44 
 
 		 108 aa  120  5e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  51 
 
 		 107 aa  120  6e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0720  thioredoxin  48.08 
 
 		 107 aa  120  6e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  50.5 
 
 		 107 aa  120  6e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4115  thioredoxin  49 
 
 		 107 aa  120  7e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3241  thioredoxin  60 
 
 		 107 aa  120  7e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1945  thioredoxin  48.08 
 
 		 124 aa  120  7e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4155  thioredoxin  49 
 
 		 107 aa  120  7e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.853934 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0301  thioredoxin  55.32 
 
 		 106 aa  120  7e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0028  thioredoxin  58.89 
 
 		 106 aa  120  7e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3433  thioredoxin  56.84 
 
 		 108 aa  120  7e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11511  thioredoxin  51 
 
 		 107 aa  120  9e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3216  thioredoxin  56.84 
 
 		 108 aa  120  9e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.604019  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0406  thioredoxin 1  55.79 
 
 		 108 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0410  thioredoxin  55.79 
 
 		 108 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3615  thioredoxin  55.79 
 
 		 108 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0409  thioredoxin  55.79 
 
 		 108 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00884025 
 
 
-
 
NC_002936  DET0661  thioredoxin  56.25 
 
 		 107 aa  118  1.9999999999999998e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0695  thioredoxin  56.25 
 
 		 107 aa  118  1.9999999999999998e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3230  thioredoxin  57.78 
 
 		 109 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000930614  normal  0.223494 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0505  thioredoxin  54.55 
 
 		 109 aa  118  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000129794  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3281  thioredoxin  57.78 
 
 		 109 aa  118  3e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0630  thioredoxin  55.67 
 
 		 107 aa  118  3e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000762931  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1072  thioredoxin  50 
 
 		 107 aa  118  3e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.888152  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4231  thioredoxin  49 
 
 		 107 aa  118  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000465688 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11671  thioredoxin  50 
 
 		 107 aa  118  3e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3312  thioredoxin  48.08 
 
 		 109 aa  118  3e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124332  normal  0.074373 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11661  thioredoxin  50 
 
 		 107 aa  118  3e-26  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.113798  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2105  thioredoxin  56.32 
 
 		 107 aa  117  3.9999999999999996e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0422234  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2021  thioredoxin  56.32 
 
 		 107 aa  117  3.9999999999999996e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000945216  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3369  thioredoxin  47.62 
 
 		 106 aa  117  3.9999999999999996e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0365156  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2256  thioredoxin  49.02 
 
 		 105 aa  117  4.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435277 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_599  thioredoxin  56.25 
 
 		 107 aa  117  4.9999999999999996e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000130429  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2292  thioredoxin  56.18 
 
 		 120 aa  117  4.9999999999999996e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.345169  normal  0.308955 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0460  thioredoxin  56.84 
 
 		 108 aa  117  4.9999999999999996e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.810082  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4956  thioredoxin  54.74 
 
 		 106 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.183907 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1359  thioredoxin  54.55 
 
 		 109 aa  117  6e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1989  thioredoxin  53.12 
 
 		 108 aa  117  6e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.154515  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3378  thioredoxin  55.79 
 
 		 107 aa  117  6e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.197201  normal  0.553993 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1667  thioredoxin  51.61 
 
 		 110 aa  117  6e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.000000000131883  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0398  thioredoxin  55.79 
 
 		 108 aa  117  6e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1456  thioredoxin  54.55 
 
 		 109 aa  117  6e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3958  thioredoxin  57.3 
 
 		 106 aa  117  6e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3584  thioredoxin  55.32 
 
 		 108 aa  117  6e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0328783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4110  thioredoxin  54.74 
 
 		 108 aa  117  6e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.465308  hitchhiker  0.0000724164 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3582  thioredoxin  55.06 
 
 		 107 aa  117  7e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.968394  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1199  thioredoxin  50.5 
 
 		 107 aa  116  9e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.0000534537  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4442  thioredoxin  54.74 
 
 		 119 aa  116  9e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.553221 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3655  thioredoxin  59.55 
 
 		 108 aa  116  9e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000417679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2518  thioredoxin  52 
 
 		 141 aa  116  9e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4906  thioredoxin  54.74 
 
 		 106 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.803641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3919  thioredoxin  50 
 
 		 103 aa  115  9.999999999999999e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.566246  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2997  thioredoxin  57.95 
 
 		 108 aa  116  9.999999999999999e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.140108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0530  thioredoxin  50 
 
 		 114 aa  115  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.303131  normal  0.878071 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0810  thioredoxin  49.48 
 
 		 107 aa  116  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195011 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2067  thioredoxin  49.48 
 
 		 107 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2211  thioredoxin  52.17 
 
 		 112 aa  116  9.999999999999999e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000765425  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2185  thioredoxin  52.17 
 
 		 112 aa  116  9.999999999999999e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.0000121318  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3190  thioredoxin  50.52 
 
 		 108 aa  116  9.999999999999999e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.425401  hitchhiker  0.00537167 
 
 
-
 
NC_002950  PG0034  thioredoxin  53.47 
 
 		 104 aa  115  1.9999999999999998e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08920  thioredoxin  50 
 
 		 102 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000942681  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0175  thioredoxin  54.64 
 
 		 108 aa  115  1.9999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2468  thioredoxin  52.08 
 
 		 108 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0357  thioredoxin  52.17 
 
 		 108 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2323  thioredoxin  55.06 
 
 		 110 aa  115  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1344  thioredoxin  52.13 
 
 		 107 aa  115  1.9999999999999998e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00788637  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0462  thioredoxin  48.98 
 
 		 109 aa  115  1.9999999999999998e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000041281  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0402  thioredoxin  51.55 
 
 		 107 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0895025 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0136  thioredoxin  46.39 
 
 		 107 aa  115  3e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000946631  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4285  thioredoxin  56.18 
 
 		 106 aa  115  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.395722  normal  0.497891 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1124  thioredoxin  52.08 
 
 		 108 aa  114  3e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0722597  normal  0.17575 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>