161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4848 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4848  serine/threonine protein kinase  100 
 
 		 880 aa  1745    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1322  serine/threonine protein kinase  45.35 
 
 		 854 aa  634  1e-180  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.198342  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4731  serine/threonine protein kinase  43.55 
 
 		 839 aa  587  1e-166  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7441  Serine/threonine protein kinase-like protein  41.37 
 
 		 873 aa  538  1e-151  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6433  Serine/threonine protein kinase-like protein  40.65 
 
 		 878 aa  526  1e-148  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00642211  normal  0.0697587 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4239  serine/threonine protein kinase  41.73 
 
 		 870 aa  526  1e-148  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.129561 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0532  serine/threonine protein kinase  39.43 
 
 		 853 aa  508  9.999999999999999e-143  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.332532 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3610  serine/threonine protein kinase  41.42 
 
 		 866 aa  501  1e-140  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.561944  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1744  serine/threonine protein kinase  26.35 
 
 		 860 aa  283  7.000000000000001e-75  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00380667  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7172  serine/threonine protein kinase  31.16 
 
 		 861 aa  241  5.999999999999999e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0246  serine/threonine protein kinase  31.54 
 
 		 896 aa  217  7e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4758  serine/threonine protein kinase, putative  23.06 
 
 		 838 aa  199  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000666058  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2130  serine/threonine protein kinase  27.03 
 
 		 894 aa  187  6e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0710537  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2497  serine/threonine protein kinase  30.64 
 
 		 880 aa  128  4.0000000000000003e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2549  Serine/threonine protein kinase  20.88 
 
 		 614 aa  105  5e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0598  serine/threonine protein kinase  27.54 
 
 		 864 aa  101  5e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1920  hypothetical protein  22.6 
 
 		 719 aa  99.8  2e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.527316  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0376  serine/threonine protein kinase  28.53 
 
 		 865 aa  89.7  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1169  protein kinase  24.82 
 
 		 634 aa  62.8  0.00000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000304799  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0982  serine/threonine protein kinase  20.03 
 
 		 702 aa  61.2  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0319  serine/threonine protein kinase  24.53 
 
 		 651 aa  61.2  0.00000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0764  serine/threonine kinase protein  25.59 
 
 		 662 aa  59.7  0.0000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000395129 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0701  serine/threonine kinase protein  26.34 
 
 		 500 aa  59.3  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000041573  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4831  serine/threonine protein kinase  29.31 
 
 		 289 aa  58.9  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3276  serine/threonine kinase protein  26.55 
 
 		 475 aa  58.5  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.162967  normal  0.186689 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8510  Serine/threonine protein kinase-like protein  26.52 
 
 		 596 aa  58.2  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2990  Serine/threonine protein kinase  28.99 
 
 		 442 aa  57.8  0.0000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000108087  normal  0.539453 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1392  serine/threonine kinase protein  25 
 
 		 623 aa  57.8  0.0000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1422  serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 		 1046 aa  57.4  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0717  serine/threonine protein kinase  30.74 
 
 		 861 aa  57.8  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000196708  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2411  serine/threonine protein kinase  31.18 
 
 		 507 aa  56.6  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.380657  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1863  serine/threonine protein kinase  29.51 
 
 		 450 aa  56.2  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.03755  normal  0.81894 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1511  serine/threonine kinase protein  24.06 
 
 		 641 aa  56.6  0.000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3340  serine/threonine protein kinase  24.88 
 
 		 490 aa  56.6  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0991  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  25.54 
 
 		 551 aa  56.2  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0789  serine/threonine kinase protein  25.47 
 
 		 614 aa  55.8  0.000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.350319  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1813  serine/threonine protein kinase  31.07 
 
 		 411 aa  55.5  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3893  protein kinase  24.88 
 
 		 502 aa  55.5  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6424  serine/threonine protein kinase  32.42 
 
 		 1280 aa  55.5  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.328261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3788  serine/threonine protein kinase  24.48 
 
 		 505 aa  55.5  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.987521  normal  0.0424994 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2395  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.91 
 
 		 736 aa  54.7  0.000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2862  serine/threonine protein kinase with FHA domain protein  26.14 
 
 		 461 aa  54.7  0.000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0331912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0181  protein kinase  32.93 
 
 		 579 aa  54.7  0.000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0022  serine/threonine protein kinase  29.63 
 
 		 567 aa  54.7  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0878271  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2410  serine/threonine protein kinase  32.32 
 
 		 460 aa  53.9  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.378864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1844  protein kinase  25.66 
 
 		 485 aa  53.9  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0990  serine/threonine protein kinase  27.88 
 
 		 486 aa  53.9  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000407261  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4028  serine/threonine protein kinase  29.49 
 
 		 493 aa  54.3  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0137121  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1995  Serine/threonine protein kinase  26.61 
 
 		 560 aa  53.1  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1957  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  23.08 
 
 		 668 aa  52.8  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0899  serine/threonine protein kinase  30.54 
 
 		 499 aa  52.8  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000818625  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1542  Serine/threonine protein kinase-like protein  29.69 
 
 		 521 aa  52.4  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.141681  normal  0.485519 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3936  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.59 
 
 		 746 aa  52  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1432  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.45 
 
 		 1609 aa  51.6  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3472  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.78 
 
 		 916 aa  51.2  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00045069  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1450  diguanylate cyclase  28.57 
 
 		 1774 aa  51.2  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4789  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.55 
 
 		 1623 aa  51.2  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.702991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1752  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.4 
 
 		 614 aa  51.2  0.00009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4467  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.86 
 
 		 698 aa  50.8  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3967  serine/threonine protein kinase  28.35 
 
 		 468 aa  50.4  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1100  serine/threonine protein kinase  24.25 
 
 		 1415 aa  50.4  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0080  serine/threonine protein kinase  26.11 
 
 		 928 aa  50.8  0.0001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0372  serine/threonine protein kinase  29.31 
 
 		 1032 aa  50.8  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.904942 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5809  serine/threonine protein kinase  25.79 
 
 		 487 aa  50.8  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0417  serine/threonine protein kinase  30.71 
 
 		 412 aa  50.4  0.0001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1698  serine/threonine protein kinase  29.41 
 
 		 461 aa  50.1  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00790624  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2082  serine/threonine protein kinase  24.53 
 
 		 625 aa  50.1  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3295  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.32 
 
 		 1398 aa  50.1  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8314  putative serine/threonine protein kinase  29.52 
 
 		 554 aa  50.1  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.940738 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5336  serine/threonine protein kinase  24.38 
 
 		 485 aa  50.1  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.567075 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2690  serine/threonine protein kinase  22.03 
 
 		 435 aa  49.7  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3823  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.07 
 
 		 1617 aa  49.3  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0782446 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.55 
 
 		 1599 aa  49.3  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.392467 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5601  serine/threonine protein kinase  33.12 
 
 		 900 aa  49.3  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6755  serine/threonine protein kinase  28.19 
 
 		 597 aa  49.3  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0754  serine/threonine protein kinase  30.22 
 
 		 437 aa  49.3  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.564143 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5900  serine/threonine protein kinase  31.28 
 
 		 476 aa  49.7  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.377642  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0870  serine/threonine protein kinase  29.68 
 
 		 328 aa  49.3  0.0003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00370  serine/threonine protein kinase  30.54 
 
 		 419 aa  49.3  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.339035 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25260  protein kinase family protein  27.2 
 
 		 501 aa  49.3  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.981301 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35230  serine/threonine protein kinase  27.48 
 
 		 531 aa  49.7  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.812554  normal  0.572815 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1417  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  30.77 
 
 		 1598 aa  48.9  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3086  protein kinase  29.11 
 
 		 658 aa  48.9  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2492  Serine/threonine protein kinase-related protein  26.82 
 
 		 503 aa  48.9  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.169488  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4508  serine/threonine protein kinase  25.86 
 
 		 403 aa  48.9  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.465197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1421  serine/threonine protein kinase  25.22 
 
 		 871 aa  48.9  0.0004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.947374  normal  0.27367 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1994  serine/threonine protein kinase  24.43 
 
 		 349 aa  48.9  0.0004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0495985  normal  0.225513 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0021  serine/threonine protein kinase  27.23 
 
 		 581 aa  48.9  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000813832 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1311  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  24.64 
 
 		 584 aa  48.1  0.0006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.760538  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2313  protein kinase  25.47 
 
 		 1018 aa  48.1  0.0006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000403487 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2075  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  26.94 
 
 		 548 aa  48.1  0.0007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.802718  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4709  serine/threonine protein kinase  26.78 
 
 		 557 aa  48.1  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5237  protein kinase  25.99 
 
 		 583 aa  48.1  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.307839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0072  protein kinase  24.63 
 
 		 661 aa  47.8  0.0009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.585558 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1700  Serine/threonine protein kinase  26.03 
 
 		 496 aa  47  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0154574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2096  serine/threonine protein kinase  26.16 
 
 		 476 aa  47  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.688705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0022  protein kinase  25.26 
 
 		 597 aa  47  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31690  protein kinase family protein  31.35 
 
 		 643 aa  47.4  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0783  Lanthionine synthetase C family protein  28.14 
 
 		 1074 aa  47.4  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.265394  normal  0.258057 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00180  protein kinase family protein with PASTA domain  28.91 
 
 		 951 aa  47.4  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.000304613  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>