52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0417 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0417  serine/threonine protein kinase  100 
 
 		 412 aa  839    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6433  Serine/threonine protein kinase-like protein  22.54 
 
 		 878 aa  90.1  7e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00642211  normal  0.0697587 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0376  serine/threonine protein kinase  23.67 
 
 		 865 aa  86.3  9e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0598  serine/threonine protein kinase  24.16 
 
 		 864 aa  84.7  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1744  serine/threonine protein kinase  27.4 
 
 		 860 aa  80.5  0.00000000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00380667  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7441  Serine/threonine protein kinase-like protein  25.14 
 
 		 873 aa  80.5  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2130  serine/threonine protein kinase  22.49 
 
 		 894 aa  77  0.0000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0710537  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4731  serine/threonine protein kinase  22.87 
 
 		 839 aa  74.7  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4758  serine/threonine protein kinase, putative  24.56 
 
 		 838 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000666058  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1322  serine/threonine protein kinase  23.71 
 
 		 854 aa  67  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.198342  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2549  Serine/threonine protein kinase  24.63 
 
 		 614 aa  67  0.0000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3610  serine/threonine protein kinase  21.35 
 
 		 866 aa  65.5  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.561944  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4239  serine/threonine protein kinase  25.78 
 
 		 870 aa  64.7  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.129561 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1920  hypothetical protein  27.64 
 
 		 719 aa  63.2  0.000000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.527316  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7172  serine/threonine protein kinase  22.22 
 
 		 861 aa  62  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0532  serine/threonine protein kinase  23.28 
 
 		 853 aa  58.5  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.332532 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0246  serine/threonine protein kinase  31.09 
 
 		 896 aa  58.2  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2542  serine/threonine protein kinase  23.1 
 
 		 447 aa  57.8  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2497  serine/threonine protein kinase  32.04 
 
 		 880 aa  54.7  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2728  serine/threonine protein kinase  24.8 
 
 		 824 aa  53.5  0.000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2348  serine/threonine protein kinase  27.68 
 
 		 432 aa  52.4  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4848  serine/threonine protein kinase  30.71 
 
 		 880 aa  50.4  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2082  serine/threonine protein kinase  25.37 
 
 		 472 aa  50.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2126  serine/threonine protein kinase  25.37 
 
 		 472 aa  50.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.842501 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2109  Serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  29.7 
 
 		 777 aa  49.3  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.312058 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5934  serine/threonine protein kinase  23.24 
 
 		 550 aa  49.3  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0503162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1698  protein kinase  29.23 
 
 		 274 aa  48.9  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1527  Serine/threonine protein kinase-like  29.37 
 
 		 672 aa  48.9  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1078  serine/threonine protein kinase  26.92 
 
 		 419 aa  48.5  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000110576  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3437  serine/threonine protein kinase  26.09 
 
 		 771 aa  47.4  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4923  Serine/threonine protein kinase  28.79 
 
 		 524 aa  47.4  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0957797 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2662  Serine/threonine protein kinase-like protein  23.57 
 
 		 814 aa  47.4  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00893552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1756  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  25 
 
 		 608 aa  47  0.0006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1130  serine/threonine protein kinase  25.48 
 
 		 555 aa  47  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2229  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  24.53 
 
 		 644 aa  47  0.0007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.277557  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3605  serine/threonine protein kinase  25.97 
 
 		 481 aa  45.8  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.170818  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0677  serine/threonine protein kinase  23.56 
 
 		 898 aa  45.8  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000321455 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2609  serine/threonine protein kinase  31.54 
 
 		 415 aa  46.2  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.101255 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2084  Serine/threonine protein kinase  25.14 
 
 		 643 aa  46.2  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000649074  unclonable  0.000000262207 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1213  serine/threonine protein kinase  31.96 
 
 		 273 aa  45.8  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7433  Serine/threonine protein kinase-like protein  23.93 
 
 		 664 aa  45.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1754  serine/threonine protein kinase  22.16 
 
 		 535 aa  45.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4730  serine/threonine protein kinase  22.93 
 
 		 564 aa  44.7  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0808  serine/threonine protein kinase  26.61 
 
 		 285 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.369013 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2831  serine/threonine protein kinase  26.35 
 
 		 618 aa  45.1  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.314695 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1974  Serine/threonine protein kinase-like protein  31.07 
 
 		 481 aa  43.9  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0153  Serine/threonine protein kinase  25.41 
 
 		 485 aa  44.3  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.913908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_16067  predicted protein  27.06 
 
 		 264 aa  43.9  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0854835  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6081  serine/threonine protein kinase  29.21 
 
 		 542 aa  43.5  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.168714 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4592  serine/threonine protein kinase  27.27 
 
 		 598 aa  43.1  0.01  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.398958  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3154  serine/threonine protein kinase  25.17 
 
 		 713 aa  42.7  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4012  serine/threonine protein kinase  23.08 
 
 		 528 aa  43.1  0.01  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>