More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2315 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_2972  flagellar biosynthesis protein FlhA  56.73 
 
 
682 aa  714    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0958  flagellar biosynthesis protein FlhA  63.6 
 
 
680 aa  798    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2007  flagellar biosynthesis protein FlhA  55.81 
 
 
687 aa  734    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.877962  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31020  flagellar biosynthesis protein FlhA  57.93 
 
 
686 aa  746    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2315  flagellar biosynthesis protein FlhA  100 
 
 
680 aa  1328    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0546949  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1673  flagellar biosynthesis protein FlhA  64.46 
 
 
702 aa  840    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0472472  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0861  flagellar biosynthesis protein FlhA  64.22 
 
 
708 aa  794    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.186117  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0739  flagellar biosynthesis protein FlhA  63.35 
 
 
681 aa  782    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0070  flagellar biosynthesis protein FlhA  50 
 
 
692 aa  608  9.999999999999999e-173  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.42428  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2392  flagellar biosynthesis protein FlhA  47.95 
 
 
690 aa  583  1.0000000000000001e-165  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0159  flagellar biosynthesis protein FlhA  50.81 
 
 
676 aa  569  1e-161  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.533108  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1413  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.49 
 
 
686 aa  558  1e-157  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.176354  normal  0.558149 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2031  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.71 
 
 
674 aa  554  1e-156  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0588  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.6 
 
 
695 aa  552  1e-156  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0790  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.59 
 
 
690 aa  551  1e-155  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000500888  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4111  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.51 
 
 
694 aa  547  1e-154  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0120784  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0485  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.71 
 
 
676 aa  542  1e-153  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0869  flagellar biosynthesis protein FlhA  47.98 
 
 
686 aa  542  1e-153  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3767  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.74 
 
 
692 aa  533  1e-150  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2976  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.44 
 
 
692 aa  533  1e-150  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3851  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.45 
 
 
692 aa  532  1e-150  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000167765 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1315  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.83 
 
 
697 aa  534  1e-150  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0704  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.58 
 
 
688 aa  529  1e-149  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1130  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.26 
 
 
679 aa  529  1e-149  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3444  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.12 
 
 
695 aa  530  1e-149  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0761  flagellar biosynthesis protein FlhA  48.67 
 
 
696 aa  525  1e-148  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.417775  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1673  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.13 
 
 
673 aa  528  1e-148  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2963  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.99 
 
 
700 aa  527  1e-148  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.107248  normal  0.0107746 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1945  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.48 
 
 
690 aa  528  1e-148  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1410  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.26 
 
 
682 aa  526  1e-148  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3129  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.97 
 
 
700 aa  525  1e-147  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2846  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.97 
 
 
700 aa  525  1e-147  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3843  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.97 
 
 
700 aa  525  1e-147  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5616  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.05 
 
 
693 aa  522  1e-147  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.114145  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0062  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.97 
 
 
700 aa  525  1e-147  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1548  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.44 
 
 
698 aa  525  1e-147  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3169  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.83 
 
 
700 aa  525  1e-147  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0131  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.14 
 
 
700 aa  523  1e-147  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1696  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.97 
 
 
700 aa  525  1e-147  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3924  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.97 
 
 
700 aa  525  1e-147  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.932271  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3422  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.97 
 
 
700 aa  525  1e-147  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.545221  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3056  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.23 
 
 
696 aa  521  1e-146  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3803  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.99 
 
 
700 aa  520  1e-146  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4067  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.43 
 
 
708 aa  518  1.0000000000000001e-145  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.67458  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0426  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.53 
 
 
694 aa  517  1.0000000000000001e-145  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0744  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.9 
 
 
697 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4179  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.43 
 
 
708 aa  518  1.0000000000000001e-145  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4134  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.61 
 
 
688 aa  516  1.0000000000000001e-145  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000385225  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1162  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.86 
 
 
694 aa  512  1e-144  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1863  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.6 
 
 
693 aa  515  1e-144  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.707218  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0176  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.39 
 
 
700 aa  510  1e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0117653  normal  0.17502 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0982  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.97 
 
 
706 aa  509  1e-143  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.121658 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3820  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.89 
 
 
694 aa  509  1e-143  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.136206 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1393  flagellar biosynthesis FlhA transmembrane protein  45.05 
 
 
696 aa  505  9.999999999999999e-143  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.203699  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1172  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.2 
 
 
703 aa  508  9.999999999999999e-143  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.167459 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3093  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.74 
 
 
694 aa  507  9.999999999999999e-143  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.753258  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0182  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.44 
 
 
700 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4413  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.95 
 
 
693 aa  507  9.999999999999999e-143  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.402008  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2153  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.69 
 
 
678 aa  505  1e-141  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0195  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.44 
 
 
700 aa  505  1e-141  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.107813  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1748  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.54 
 
 
692 aa  504  1e-141  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2283  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.15 
 
 
699 aa  503  1e-141  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.740103 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0019  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.84 
 
 
678 aa  499  1e-140  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000195555  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0019  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.84 
 
 
678 aa  499  1e-140  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000147503  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2022  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.66 
 
 
681 aa  502  1e-140  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02873  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.68 
 
 
699 aa  499  1e-140  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.656306  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3699  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.54 
 
 
695 aa  500  1e-140  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0172867 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3286  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.15 
 
 
696 aa  502  1e-140  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1520  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.54 
 
 
698 aa  500  1e-140  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2839  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.92 
 
 
700 aa  500  1e-140  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.753439  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2293  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.56 
 
 
697 aa  500  1e-140  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0268  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.92 
 
 
700 aa  500  1e-140  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0416492  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0250  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.92 
 
 
700 aa  500  1e-140  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.253227  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3052  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.63 
 
 
700 aa  500  1e-140  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0382146 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1761  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.69 
 
 
692 aa  498  1e-139  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.98256  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16680  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.44 
 
 
689 aa  496  1e-139  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3371  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.62 
 
 
699 aa  498  1e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.029273  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0405  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.88 
 
 
712 aa  498  1e-139  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.245167  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4141  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.82 
 
 
697 aa  497  1e-139  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.303073  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0599  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.71 
 
 
699 aa  498  1e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002829  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.41 
 
 
710 aa  493  9.999999999999999e-139  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.192005  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3707  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.81 
 
 
693 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.306788  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3033  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.38 
 
 
700 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1632  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.81 
 
 
699 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1380  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.13 
 
 
699 aa  489  1e-137  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.329367 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03147  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.45 
 
 
699 aa  490  1e-137  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1619  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.94 
 
 
700 aa  491  1e-137  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.033261 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2015  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.35 
 
 
695 aa  492  1e-137  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.372336  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1865  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.23 
 
 
702 aa  490  1e-137  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.443827  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0931  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.71 
 
 
697 aa  492  1e-137  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01850  flagellar biosynthesis protein A  44.54 
 
 
692 aa  485  1e-136  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.585433  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1516  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.48 
 
 
700 aa  488  1e-136  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01839  hypothetical protein  44.54 
 
 
692 aa  485  1e-136  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.591192  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2029  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.07 
 
 
684 aa  486  1e-136  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2616  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.69 
 
 
692 aa  486  1e-136  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000268529 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3430  flagellar biosynthesis protein FlhA  41.59 
 
 
705 aa  488  1e-136  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2111  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.69 
 
 
692 aa  486  1e-136  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1296  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.73 
 
 
699 aa  487  1e-136  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1363  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.73 
 
 
699 aa  487  1e-136  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.960302 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1753  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.56 
 
 
692 aa  486  1e-136  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>